RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494188.1

RAB1A-205, Transcript of RAB1A, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB1A, Length 771 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1A-205ENST00000494188 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.53■■■■■ 6.48
RAB1A-205ENST00000494188 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.34■■■■■ 5.49
RAB1A-205ENST00000494188 ABCC9O60706 1549 aa48.22■■■■■ 5.31
RAB1A-205ENST00000494188 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.42■■■■■ 5.02
RAB1A-205ENST00000494188 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.4■■■■■ 5.02
RAB1A-205ENST00000494188 NACADO15069 1562 aa46.35■■■■■ 5.01
RAB1A-205ENST00000494188 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.3■■■■■ 5
RAB1A-205ENST00000494188 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.07■■■■■ 4.97
RAB1A-205ENST00000494188 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.92■■■■■ 4.94
RAB1A-205ENST00000494188 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.32■■■■■ 4.85
RAB1A-205ENST00000494188 SCRIBQ14160 1630 aa45.09■■■■■ 4.81
RAB1A-205ENST00000494188 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.07■■■■■ 4.81
RAB1A-205ENST00000494188 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.96■■■■■ 4.79
RAB1A-205ENST00000494188 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.51■■■■■ 4.72
RAB1A-205ENST00000494188 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.09■■■■■ 4.65
RAB1A-205ENST00000494188 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.8■■■■■ 4.6
RAB1A-205ENST00000494188 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.6■■■■■ 4.57
RAB1A-205ENST00000494188 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.3■■■■■ 4.52
RAB1A-205ENST00000494188 SMARCA4P51532 1647 aa43.09■■■■■ 4.49
RAB1A-205ENST00000494188 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
RAB1A-205ENST00000494188 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.82■■■■■ 4.44
RAB1A-205ENST00000494188 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.81■■■■■ 4.44
RAB1A-205ENST00000494188 SMARCA2P51531 1590 aa42.78■■■■■ 4.44
RAB1A-205ENST00000494188 NCAPD3P42695 1498 aa42.74■■■■■ 4.43
RAB1A-205ENST00000494188 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.62■■■■■ 4.41
RAB1A-205ENST00000494188 HMGXB3Q12766 1538 aa42.58■■■■■ 4.41
RAB1A-205ENST00000494188 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
RAB1A-205ENST00000494188 WIZO95785 1651 aa42.37■■■■■ 4.37
RAB1A-205ENST00000494188 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.35■■■■■ 4.37
RAB1A-205ENST00000494188 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
RAB1A-205ENST00000494188 NESP48681 1621 aa41.74■■■■■ 4.27
RAB1A-205ENST00000494188 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.64■■■■■ 4.26
RAB1A-205ENST00000494188 ERCC6Q03468 1493 aa41.58■■■■■ 4.25
RAB1A-205ENST00000494188 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.53■■■■■ 4.24
RAB1A-205ENST00000494188 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.42■■■■■ 4.22
RAB1A-205ENST00000494188 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
RAB1A-205ENST00000494188 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.36■■■■■ 4.21
RAB1A-205ENST00000494188 CFTRP13569 1480 aa41.3■■■■■ 4.2
RAB1A-205ENST00000494188 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.26■■■■■ 4.2
RAB1A-205ENST00000494188 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
RAB1A-205ENST00000494188 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.09■■■■■ 4.17
RAB1A-205ENST00000494188 CUX2O14529 1486 aa41.05■■■■■ 4.16
RAB1A-205ENST00000494188 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.04■■■■■ 4.16
RAB1A-205ENST00000494188 PRDM2Q13029 1718 aa41.01■■■■■ 4.16
RAB1A-205ENST00000494188 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.95■■■■■ 4.15
RAB1A-205ENST00000494188 WDR62O43379 1518 aa40.8■■■■■ 4.12
RAB1A-205ENST00000494188 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
RAB1A-205ENST00000494188 TOPBP1Q92547 1522 aa40.43■■■■■ 4.06
RAB1A-205ENST00000494188 ABCC8Q09428 1581 aa40.41■■■■■ 4.06
RAB1A-205ENST00000494188 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.4■■■■■ 4.06
RAB1A-205ENST00000494188 CUX1P39880 1505 aa40.17■■■■■ 4.02
RAB1A-205ENST00000494188 IFT140Q96RY7 1462 aa40.16■■■■■ 4.02
RAB1A-205ENST00000494188 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
RAB1A-205ENST00000494188 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.04■■■■■ 4
RAB1A-205ENST00000494188 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
RAB1A-205ENST00000494188 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
RAB1A-205ENST00000494188 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.96■■■■□ 3.99
RAB1A-205ENST00000494188 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.94■■■■□ 3.98
RAB1A-205ENST00000494188 SOGA1O94964 1423 aa39.93■■■■□ 3.98
RAB1A-205ENST00000494188 SYNJ1O43426 1573 aa39.86■■■■□ 3.97
RAB1A-205ENST00000494188 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
RAB1A-205ENST00000494188 TOP2BQ02880 1626 aa39.84■■■■□ 3.97
RAB1A-205ENST00000494188 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.83■■■■□ 3.97
RAB1A-205ENST00000494188 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.76■■■■□ 3.961e-7■■■□□ 16.7
RAB1A-205ENST00000494188 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.7■■■■□ 3.95
RAB1A-205ENST00000494188 WDR97A6NE52 1622 aa39.68■■■■□ 3.94
RAB1A-205ENST00000494188 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.62■■■■□ 3.93
RAB1A-205ENST00000494188 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.62■■■■□ 3.93
RAB1A-205ENST00000494188 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.48■■■■□ 3.91
RAB1A-205ENST00000494188 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.47■■■■□ 3.91
RAB1A-205ENST00000494188 GRIN2BQ13224 1484 aa39.46■■■■□ 3.91
RAB1A-205ENST00000494188 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.43■■■■□ 3.9
RAB1A-205ENST00000494188 PBRM1Q86U86 1689 aa39.41■■■■□ 3.9
RAB1A-205ENST00000494188 OSCARQ8IYS5 282 aa39.35■■■■□ 3.89
RAB1A-205ENST00000494188 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.34■■■■□ 3.89
RAB1A-205ENST00000494188 FBLN2P98095 1184 aa39.3■■■■□ 3.88
RAB1A-205ENST00000494188 CHD1O14646 1710 aa39.3■■■■□ 3.88
RAB1A-205ENST00000494188 SYNJ2O15056 1496 aa39.19■■■■□ 3.86
RAB1A-205ENST00000494188 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.18■■■■□ 3.86
RAB1A-205ENST00000494188 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.15■■■■□ 3.86
RAB1A-205ENST00000494188 KIF27Q86VH2 1401 aa39.12■■■■□ 3.85
RAB1A-205ENST00000494188 ADAMTS12P58397 1594 aa39.12■■■■□ 3.85
RAB1A-205ENST00000494188 TRIM41Q8WV44 630 aa39.09■■■■□ 3.85
RAB1A-205ENST00000494188 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.02■■■■□ 3.84
RAB1A-205ENST00000494188 GRIN2AQ12879 1464 aa38.96■■■■□ 3.83
RAB1A-205ENST00000494188 IGF1RP08069 1367 aa38.89■■■■□ 3.82
RAB1A-205ENST00000494188 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.87■■■■□ 3.81
RAB1A-205ENST00000494188 CUL7Q14999 1698 aa38.84■■■■□ 3.81
RAB1A-205ENST00000494188 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.79■■■■□ 3.8
RAB1A-205ENST00000494188 CEP170Q5SW79 1584 aa38.77■■■■□ 3.8
RAB1A-205ENST00000494188 NUP160Q12769 1436 aa38.76■■■■□ 3.8
RAB1A-205ENST00000494188 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.74■■■■□ 3.79
RAB1A-205ENST00000494188 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.74■■■■□ 3.79
RAB1A-205ENST00000494188 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.74■■■■□ 3.79
RAB1A-205ENST00000494188 ARHGEF11O15085 1522 aa38.74■■■■□ 3.79
RAB1A-205ENST00000494188 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.7■■■■□ 3.78
RAB1A-205ENST00000494188 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.65■■■■□ 3.78
RAB1A-205ENST00000494188 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.49■■■■□ 3.75
RAB1A-205ENST00000494188 ARAP1Q96P48 1450 aa38.45■■■■□ 3.75
RAB1A-205ENST00000494188 SHROOM2Q13796 1616 aa38.45■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms