Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 PSME4-201ENST00000389993 6581 ntTSL 1 (best)16.39■□□□□ 0.215e-160■■■■■ 227.4
GTF2F1P35269 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.055e-160■■■■■ 227.4
GTF2F1P35269 PSME4-208ENST00000481518 886 ntTSL 525.66■■□□□ 1.77e-160■■■■■ 224.2
GTF2F1P35269 CBX4-203ENST00000494546 432 ntTSL 336.87■■■■□ 3.494e-27■■■■■ 205.7
GTF2F1P35269 NME4-204ENST00000433358 966 ntTSL 326.06■■□□□ 1.764e-18■■■■■ 190.7
GTF2F1P35269 NME4-206ENST00000448828 1167 ntTSL 225.34■■□□□ 1.654e-18■■■■■ 190.7
GTF2F1P35269 NME4-209ENST00000460297 1652 ntTSL 525.23■■□□□ 1.634e-18■■■■■ 190.7
GTF2F1P35269 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.494e-18■■■■■ 190.7
GTF2F1P35269 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.454e-18■■■■■ 190.7
GTF2F1P35269 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.454e-18■■■■■ 190.7
GTF2F1P35269 NME4-205ENST00000444498 1111 ntTSL 320.7■□□□□ 0.94e-18■■■■■ 190.7
GTF2F1P35269 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.774e-18■■■■■ 190.7
GTF2F1P35269 NME4-208ENST00000454619 719 ntTSL 516.4■□□□□ 0.224e-18■■■■■ 190.7
GTF2F1P35269 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.024e-18■■■■■ 190.7
GTF2F1P35269 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.295e-18■■■■■ 186.4
GTF2F1P35269 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)22.69■■□□□ 1.228e-49■■■■■ 172.1
GTF2F1P35269 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 18e-49■■■■■ 172.1
GTF2F1P35269 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 220.27■□□□□ 0.848e-49■■■■■ 172.1
GTF2F1P35269 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 219.52■□□□□ 0.728e-49■■■■■ 172.1
GTF2F1P35269 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.578e-49■■■■■ 172.1
GTF2F1P35269 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.018e-49■■■■■ 172.1
GTF2F1P35269 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.438e-49■■■■■ 172.1
GTF2F1P35269 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 310.19□□□□□ -0.788e-49■■■■■ 172.1
GTF2F1P35269 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 59.76□□□□□ -0.858e-49■■■■■ 172.1
GTF2F1P35269 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 39.16□□□□□ -0.948e-49■■■■■ 172.1
GTF2F1P35269 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 56.68□□□□□ -1.348e-49■■■■■ 172.1
GTF2F1P35269 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 46.26□□□□□ -1.418e-49■■■■■ 172.1
GTF2F1P35269 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 56.05□□□□□ -1.448e-49■■■■■ 172.1
GTF2F1P35269 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.31□□□□□ -2.048e-49■■■■■ 172.1
GTF2F1P35269 SREBF1-216ENST00000490796 698 ntTSL 222.22■■□□□ 1.151e-8■■■■■ 169.5
GTF2F1P35269 SREBF1-203ENST00000395751 4653 ntTSL 220.34■□□□□ 0.851e-8■■■■■ 169.5
GTF2F1P35269 SREBF1-204ENST00000395756 3026 ntTSL 220.06■□□□□ 0.81e-8■■■■■ 169.5
GTF2F1P35269 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.191e-8■■■■■ 169.5
GTF2F1P35269 SREBF1-207ENST00000447641 644 ntTSL 315.35■□□□□ 0.051e-8■■■■■ 169.5
GTF2F1P35269 SREBF1-223ENST00000584760 564 ntTSL 214.85□□□□□ -0.031e-8■■■■■ 169.5
GTF2F1P35269 CLTCL1-207ENST00000611723 838 ntTSL 216.69■□□□□ 0.263e-8■■■■■ 161.7
GTF2F1P35269 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.053e-8■■■■■ 161.7
GTF2F1P35269 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -03e-8■■■■■ 161.7
GTF2F1P35269 CLTCL1-209ENST00000617103 4859 ntTSL 1 (best)12.48□□□□□ -0.413e-8■■■■■ 161.7
GTF2F1P35269 CLTCL1-211ENST00000621271 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.653e-8■■■■■ 161.7
GTF2F1P35269 CLTCL1-202ENST00000427926 5513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.673e-8■■■■■ 161.7
GTF2F1P35269 CLTCL1-208ENST00000615606 4994 ntTSL 1 (best)10.27□□□□□ -0.773e-8■■■■■ 161.7
GTF2F1P35269 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.769e-8■■■■■ 161.6
GTF2F1P35269 FAM178B-205ENST00000494172 592 ntTSL 319.65■□□□□ 0.749e-8■■■■■ 161.6
GTF2F1P35269 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.159e-8■■■■■ 161.6
GTF2F1P35269 FAM178B-202ENST00000470789 722 ntTSL 1 (best)12.47□□□□□ -0.419e-8■■■■■ 161.6
GTF2F1P35269 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.837e-10■■■■■ 142.2
GTF2F1P35269 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.727e-10■■■■■ 142.2
GTF2F1P35269 PUM2-206ENST00000424110 546 ntTSL 415.7■□□□□ 0.11e-15■■■■■ 128.8
GTF2F1P35269 PUM2-204ENST00000403432 3594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.251e-15■■■■■ 128.8
GTF2F1P35269 FAM98B-204ENST00000559431 305 ntTSL 512.45□□□□□ -0.425e-13■■■■■ 127
GTF2F1P35269 ATXN2L-223ENST00000568266 1294 ntTSL 519.02■□□□□ 0.647e-19■■■■■ 120.7
GTF2F1P35269 SRSF6-202ENST00000483871 1680 ntTSL 215□□□□□ -0.011e-11■■■■■ 120.3
GTF2F1P35269 SRSF6-201ENST00000244020 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.641e-11■■■■■ 120.3
GTF2F1P35269 PCNT-205ENST00000480896 10485 ntTSL 1 (best)12.79□□□□□ -0.364e-16■■■■■ 118.6
GTF2F1P35269 PCNT-201ENST00000359568 10560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.44e-16■■■■■ 118.6
GTF2F1P35269 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.654e-8■■■■■ 117.5
GTF2F1P35269 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.254e-8■■■■■ 117.5
GTF2F1P35269 SURF1-203ENST00000463965 493 ntTSL 328.44■■■□□ 2.142e-57■■■■■ 117.2
GTF2F1P35269 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.022e-57■■■■■ 117.2
GTF2F1P35269 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.022e-57■■■■■ 117.2
GTF2F1P35269 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.158e-16■■■■■ 113
GTF2F1P35269 PUM2-210ENST00000442400 955 ntTSL 58.86□□□□□ -0.998e-16■■■■■ 113
GTF2F1P35269 PUM2-208ENST00000432105 584 ntTSL 57.11□□□□□ -1.278e-16■■■■■ 113
GTF2F1P35269 PUM2-205ENST00000420234 562 ntTSL 55.07□□□□□ -1.68e-16■■■■■ 113
GTF2F1P35269 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.572e-27■■■■■ 112.9
GTF2F1P35269 ARHGAP5-204ENST00000432921 5003 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.542e-27■■■■■ 112.9
GTF2F1P35269 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.842e-27■■■■■ 112.9
GTF2F1P35269 RPS21-205ENST00000492356 429 ntTSL 1 (best)13.55□□□□□ -0.243e-31■■■■■ 110.1
GTF2F1P35269 RPS21-202ENST00000370562 1002 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.253e-31■■■■■ 110.1
GTF2F1P35269 RPS21-201ENST00000343986 344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.73e-31■■■■■ 110.1
GTF2F1P35269 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.383e-8■■■■■ 109.4
GTF2F1P35269 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.156e-12■■■■■ 107.9
GTF2F1P35269 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.424e-35■■■■■ 107.5
GTF2F1P35269 ZNF514-203ENST00000447814 554 ntTSL 49.7□□□□□ -0.864e-35■■■■■ 107.5
GTF2F1P35269 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.14e-15■■■■■ 106.8
GTF2F1P35269 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.744e-15■■■■■ 106.8
GTF2F1P35269 DOLPP1-201ENST00000327812 1932 ntTSL 1 (best)19.44■□□□□ 0.74e-15■■■■■ 106.8
GTF2F1P35269 DOLPP1-204ENST00000412363 911 ntTSL 517.3■□□□□ 0.364e-15■■■■■ 106.8
GTF2F1P35269 COPB1-209ENST00000533096 547 ntTSL 415.09■□□□□ 0.013e-9■■■■■ 105.7
GTF2F1P35269 COPB1-206ENST00000529210 607 ntTSL 413.38□□□□□ -0.273e-9■■■■■ 105.7
GTF2F1P35269 COPB1-207ENST00000529866 729 ntTSL 212.1□□□□□ -0.473e-9■■■■■ 105.7
GTF2F1P35269 COPB1-201ENST00000249923 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.513e-9■■■■■ 105.7
GTF2F1P35269 COPB1-202ENST00000439561 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.73e-9■■■■■ 105.7
GTF2F1P35269 COPB1-211ENST00000534234 1584 ntTSL 510.02□□□□□ -0.813e-9■■■■■ 105.7
GTF2F1P35269 COPB1-210ENST00000533533 537 ntTSL 49.91□□□□□ -0.823e-9■■■■■ 105.7
GTF2F1P35269 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.953e-9■■■■■ 105.7
GTF2F1P35269 COPB1-212ENST00000534771 576 ntTSL 41.28□□□□□ -2.23e-9■■■■■ 105.7
GTF2F1P35269 LIG4-204ENST00000611712 4180 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.832e-26■■■■■ 105.6
GTF2F1P35269 LIG4-202ENST00000405925 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.862e-26■■■■■ 105.6
GTF2F1P35269 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.812e-26■■■■■ 105.6
GTF2F1P35269 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.872e-26■■■■■ 105.6
GTF2F1P35269 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.34■□□□□ 0.212e-9■■■■■ 104
GTF2F1P35269 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.85e-25■■■■■ 101
GTF2F1P35269 RANBP1-211ENST00000448394 688 ntTSL 215.75■□□□□ 0.114e-11■■■■■ 100.5
GTF2F1P35269 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.454e-21■■■■■ 100.1
GTF2F1P35269 ARHGAP5-208ENST00000555814 583 ntTSL 410.06□□□□□ -0.84e-21■■■■■ 100.1
GTF2F1P35269 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.44e-21■■■■■ 100.1
GTF2F1P35269 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.454e-21■■■■■ 100.1
GTF2F1P35269 RPL22-203ENST00000465335 806 ntTSL 317.34■□□□□ 0.373e-7■■■■■ 99.5
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 97.5 ms