RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562589.5

E4F1-202, Transcript of E4F transcription factor 1, humanhuman

TSL 5

Gene E4F1, Length 817 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1-202ENST00000562589 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.3■■■■■ 7.4
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E4F1-202ENST00000562589 ABCC9O60706 1549 aa53.47■■■■■ 6.15
E4F1-202ENST00000562589 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.4■■■■■ 5.82
E4F1-202ENST00000562589 NACADO15069 1562 aa51.34■■■■■ 5.81
E4F1-202ENST00000562589 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.21■■■■■ 5.79
E4F1-202ENST00000562589 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.03■■■■■ 5.76
E4F1-202ENST00000562589 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.03■■■■■ 5.76
E4F1-202ENST00000562589 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.74■■■■■ 5.71
E4F1-202ENST00000562589 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.22■■■■■ 5.63
E4F1-202ENST00000562589 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.95■■■■■ 5.59
E4F1-202ENST00000562589 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.87■■■■■ 5.57
E4F1-202ENST00000562589 SCRIBQ14160 1630 aa49.71■■■■■ 5.55
E4F1-202ENST00000562589 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.37■■■■■ 5.49
E4F1-202ENST00000562589 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.24■■■■■ 5.47
E4F1-202ENST00000562589 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.55■■■■■ 5.36
E4F1-202ENST00000562589 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.38■■■■■ 5.34
E4F1-202ENST00000562589 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.09■■■■■ 5.29
E4F1-202ENST00000562589 SMARCA4P51532 1647 aa47.58■■■■■ 5.21
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E4F1-202ENST00000562589 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.37■■■■■ 5.17
E4F1-202ENST00000562589 SMARCA2P51531 1590 aa47.3■■■■■ 5.16
E4F1-202ENST00000562589 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.22■■■■■ 5.15
E4F1-202ENST00000562589 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.15■■■■■ 5.14
E4F1-202ENST00000562589 HMGXB3Q12766 1538 aa47.12■■■■■ 5.13
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E4F1-202ENST00000562589 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.65■■■■■ 5.06
E4F1-202ENST00000562589 NESP48681 1621 aa46.24■■■■■ 4.99
E4F1-202ENST00000562589 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.21■■■■■ 4.99
E4F1-202ENST00000562589 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.13■■■■■ 4.97
E4F1-202ENST00000562589 ERCC6Q03468 1493 aa46.1■■■■■ 4.97
E4F1-202ENST00000562589 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.99■■■■■ 4.95
E4F1-202ENST00000562589 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.84■■■■■ 4.93
E4F1-202ENST00000562589 CUX2O14529 1486 aa45.7■■■■■ 4.91
E4F1-202ENST00000562589 CFTRP13569 1480 aa45.69■■■■■ 4.91
E4F1-202ENST00000562589 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.68■■■■■ 4.9
E4F1-202ENST00000562589 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.68■■■■■ 4.9
E4F1-202ENST00000562589 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.58■■■■■ 4.89
E4F1-202ENST00000562589 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.43■■■■■ 4.86
E4F1-202ENST00000562589 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.38■■■■■ 4.86
E4F1-202ENST00000562589 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.36■■■■■ 4.85
E4F1-202ENST00000562589 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.32■■■■■ 4.85
E4F1-202ENST00000562589 PRDM2Q13029 1718 aa45.29■■■■■ 4.84
E4F1-202ENST00000562589 WDR62O43379 1518 aa45.22■■■■■ 4.83
E4F1-202ENST00000562589 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
E4F1-202ENST00000562589 ABCC8Q09428 1581 aa44.71■■■■■ 4.75
E4F1-202ENST00000562589 TOPBP1Q92547 1522 aa44.7■■■■■ 4.75
E4F1-202ENST00000562589 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.64■■■■■ 4.74
E4F1-202ENST00000562589 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.47■■■■■ 4.71
E4F1-202ENST00000562589 IFT140Q96RY7 1462 aa44.46■■■■■ 4.71
E4F1-202ENST00000562589 CUX1P39880 1505 aa44.31■■■■■ 4.68
E4F1-202ENST00000562589 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.31■■■■■ 4.68
E4F1-202ENST00000562589 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.25■■■■■ 4.67
E4F1-202ENST00000562589 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.23■■■■■ 4.67
E4F1-202ENST00000562589 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.17■■■■■ 4.66
E4F1-202ENST00000562589 SOGA1O94964 1423 aa44.13■■■■■ 4.65
E4F1-202ENST00000562589 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.11■■■■■ 4.65
E4F1-202ENST00000562589 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
E4F1-202ENST00000562589 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44■■■■■ 4.632e-6■■■□□ 16.7
E4F1-202ENST00000562589 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.98■■■■■ 4.63
E4F1-202ENST00000562589 TOP2BQ02880 1626 aa43.9■■■■■ 4.62
E4F1-202ENST00000562589 WDR97A6NE52 1622 aa43.89■■■■■ 4.62
E4F1-202ENST00000562589 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
E4F1-202ENST00000562589 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.88■■■■■ 4.62
E4F1-202ENST00000562589 SYNJ1O43426 1573 aa43.86■■■■■ 4.61
E4F1-202ENST00000562589 OSCARQ8IYS5 282 aa43.79■■■■■ 4.6
E4F1-202ENST00000562589 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.77■■■■■ 4.6
E4F1-202ENST00000562589 GRIN2BQ13224 1484 aa43.64■■■■■ 4.58
E4F1-202ENST00000562589 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.62■■■■■ 4.57
E4F1-202ENST00000562589 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.59■■■■■ 4.57
E4F1-202ENST00000562589 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.57■■■■■ 4.57
E4F1-202ENST00000562589 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.54■■■■■ 4.56
E4F1-202ENST00000562589 CHD1O14646 1710 aa43.52■■■■■ 4.56
E4F1-202ENST00000562589 PBRM1Q86U86 1689 aa43.5■■■■■ 4.55
E4F1-202ENST00000562589 FBLN2P98095 1184 aa43.46■■■■■ 4.55
E4F1-202ENST00000562589 SYNJ2O15056 1496 aa43.37■■■■■ 4.53
E4F1-202ENST00000562589 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.35■■■■■ 4.53
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E4F1-202ENST00000562589 ADAMTS12P58397 1594 aa43.17■■■■■ 4.5
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E4F1-202ENST00000562589 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.08■■■■■ 4.49
E4F1-202ENST00000562589 KIF27Q86VH2 1401 aa43.07■■■■■ 4.49
E4F1-202ENST00000562589 GRIN2AQ12879 1464 aa43.06■■■■■ 4.48
E4F1-202ENST00000562589 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.06■■■■■ 4.48
E4F1-202ENST00000562589 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.06■■■■■ 4.48
E4F1-202ENST00000562589 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.06■■■■■ 4.48
E4F1-202ENST00000562589 ARHGEF11O15085 1522 aa43.06■■■■■ 4.48
E4F1-202ENST00000562589 IGF1RP08069 1367 aa42.94■■■■■ 4.46
E4F1-202ENST00000562589 NUP160Q12769 1436 aa42.9■■■■■ 4.46
E4F1-202ENST00000562589 TRIM41Q8WV44 630 aa42.89■■■■■ 4.46
E4F1-202ENST00000562589 CEP170Q5SW79 1584 aa42.85■■■■■ 4.45
E4F1-202ENST00000562589 CUL7Q14999 1698 aa42.79■■■■■ 4.44
E4F1-202ENST00000562589 ARAP1Q96P48 1450 aa42.7■■■■■ 4.43
E4F1-202ENST00000562589 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.66■■■■■ 4.42
E4F1-202ENST00000562589 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.66■■■■■ 4.42
E4F1-202ENST00000562589 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.62■■■■■ 4.41
E4F1-202ENST00000562589 SHROOM2Q13796 1616 aa42.58■■■■■ 4.41
E4F1-202ENST00000562589 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.46■■■■■ 4.39
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