RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615313.4

DDX3X-210, Transcript of DEAD-box helicase 3 X-linked, humanhuman

TSL 4

Gene DDX3X, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3X-210ENST00000615313 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.41■■■■■ 5.18
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DDX3X-210ENST00000615313 NACADO15069 1562 aa39.83■■■■□ 3.97
DDX3X-210ENST00000615313 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.4■■■■□ 3.9
DDX3X-210ENST00000615313 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
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DDX3X-210ENST00000615313 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.08■■■■□ 3.85
DDX3X-210ENST00000615313 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.84■■■■□ 3.81
DDX3X-210ENST00000615313 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.83■■■■□ 3.81
DDX3X-210ENST00000615313 SCRIBQ14160 1630 aa38.63■■■■□ 3.78
DDX3X-210ENST00000615313 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.26■■■■□ 3.72
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DDX3X-210ENST00000615313 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.79■■■■□ 3.64
DDX3X-210ENST00000615313 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.62■■■■□ 3.61
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DDX3X-210ENST00000615313 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.79■■■■□ 3.48
DDX3X-210ENST00000615313 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
DDX3X-210ENST00000615313 SMARCA2P51531 1590 aa36.67■■■■□ 3.46
DDX3X-210ENST00000615313 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.58■■■■□ 3.45
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DDX3X-210ENST00000615313 WIZO95785 1651 aa36.16■■■■□ 3.38
DDX3X-210ENST00000615313 NESP48681 1621 aa36.12■■■■□ 3.37
DDX3X-210ENST00000615313 ERCC6Q03468 1493 aa36.08■■■■□ 3.37
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DDX3X-210ENST00000615313 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.85■■■■□ 3.33
DDX3X-210ENST00000615313 CUX2O14529 1486 aa35.77■■■■□ 3.32
DDX3X-210ENST00000615313 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.73■■■■□ 3.31
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DDX3X-210ENST00000615313 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.66■■■■□ 3.3
DDX3X-210ENST00000615313 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.61■■■■□ 3.29
DDX3X-210ENST00000615313 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
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DDX3X-210ENST00000615313 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.35■■■■□ 3.25
DDX3X-210ENST00000615313 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.34■■■■□ 3.25
DDX3X-210ENST00000615313 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.33■■■■□ 3.25
DDX3X-210ENST00000615313 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.3■■■■□ 3.24
DDX3X-210ENST00000615313 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.21■■■■□ 3.23
DDX3X-210ENST00000615313 WDR62O43379 1518 aa35.2■■■■□ 3.23
DDX3X-210ENST00000615313 PRDM2Q13029 1718 aa35.03■■■■□ 3.2
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DDX3X-210ENST00000615313 TOPBP1Q92547 1522 aa34.72■■■■□ 3.15
DDX3X-210ENST00000615313 ABCC8Q09428 1581 aa34.62■■■■□ 3.13
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DDX3X-210ENST00000615313 IFT140Q96RY7 1462 aa34.57■■■■□ 3.12
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DDX3X-210ENST00000615313 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
DDX3X-210ENST00000615313 FBLN2P98095 1184 aa34■■■■□ 3.03
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DDX3X-210ENST00000615313 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.96■■■■□ 3.03
DDX3X-210ENST00000615313 WDR97A6NE52 1622 aa33.95■■■■□ 3.03
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DDX3X-210ENST00000615313 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.93■■■■□ 3.02
DDX3X-210ENST00000615313 SYNJ1O43426 1573 aa33.9■■■■□ 3.02
DDX3X-210ENST00000615313 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.89■■■■□ 3.02
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DDX3X-210ENST00000615313 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.86■■■■□ 3.01
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DDX3X-210ENST00000615313 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.15■■■□□ 2.9
DDX3X-210ENST00000615313 SHROOM2Q13796 1616 aa33.06■■■□□ 2.88
DDX3X-210ENST00000615313 CUL7Q14999 1698 aa33.05■■■□□ 2.88
DDX3X-210ENST00000615313 JPH4Q96JJ6 628 aa33.03■■■□□ 2.88
DDX3X-210ENST00000615313 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.01■■■□□ 2.88
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