Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 SNF8-212ENST00000514089 571 ntTSL 513.43□□□□□ -0.261e-7■□□□□ 10.6
SF3A3Q12874 SNF8-205ENST00000507302 742 ntTSL 313.11□□□□□ -0.311e-7■□□□□ 10.6
SF3A3Q12874 SNF8-206ENST00000509989 677 ntTSL 312.32□□□□□ -0.441e-7■□□□□ 10.6
SF3A3Q12874 SNF8-215ENST00000515572 687 ntTSL 210.96□□□□□ -0.651e-7■□□□□ 10.6
SF3A3Q12874 SNF8-201ENST00000290330 951 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.91e-7■□□□□ 10.6
SF3A3Q12874 SNF8-207ENST00000509995 560 ntTSL 37.96□□□□□ -1.141e-7■□□□□ 10.6
SF3A3Q12874 TRIO-213ENST00000509354 801 ntTSL 26.95□□□□□ -1.31e-7■□□□□ 10.6
SF3A3Q12874 CLASP1-205ENST00000430234 582 ntTSL 46.6□□□□□ -1.351e-7■□□□□ 10.6
SF3A3Q12874 RFWD3-205ENST00000572610 572 ntTSL 1 (best)5.91□□□□□ -1.461e-7■□□□□ 10.6
SF3A3Q12874 SLC26A6-219ENST00000485361 575 ntTSL 413.81□□□□□ -0.22e-7■□□□□ 10.6
SF3A3Q12874 SLC26A6-222ENST00000496469 1034 ntTSL 512.08□□□□□ -0.482e-7■□□□□ 10.6
SF3A3Q12874 NAP1L4-214ENST00000528261 644 ntTSL 24.95□□□□□ -1.625e-7■□□□□ 10.6
SF3A3Q12874 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.555e-12■□□□□ 10.6
SF3A3Q12874 SPIRE2-209ENST00000566337 1369 ntTSL 520.2■□□□□ 0.825e-12■□□□□ 10.6
SF3A3Q12874 SPIRE2-206ENST00000564878 663 ntTSL 315.76■□□□□ 0.115e-12■□□□□ 10.6
SF3A3Q12874 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.022e-6■□□□□ 10.6
SF3A3Q12874 CYP27A1-205ENST00000494263 2566 ntTSL 219.34■□□□□ 0.692e-6■□□□□ 10.6
SF3A3Q12874 MTUS1-224ENST00000523471 828 ntTSL 47.57□□□□□ -1.21e-14■□□□□ 10.6
SF3A3Q12874 SNX5-204ENST00000431277 840 ntTSL 514.24□□□□□ -0.133e-9■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 JAG1-207ENST00000617965 837 ntTSL 512.61□□□□□ -0.398e-7■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 MSH5-215ENST00000482280 944 ntTSL 217.41■□□□□ 0.383e-7■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 MSH5-207ENST00000425703 694 ntTSL 516.3■□□□□ 0.23e-7■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 ASXL1-211ENST00000619344 550 ntTSL 512.89□□□□□ -0.351e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 MRPL38-202ENST00000410030 535 ntTSL 421.4■■□□□ 1.029e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 AC087289.3-203ENST00000587556 550 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.239e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 TCF25-204ENST00000561958 763 ntTSL 313.51□□□□□ -0.259e-7■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 ARFRP1-201ENST00000424545 384 ntTSL 26.02□□□□□ -1.453e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.564e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.524e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.284e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.284e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.024e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.984e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.84e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 GTPBP3-221ENST00000600610 1105 ntTSL 1 (best)19.04■□□□□ 0.644e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 GTPBP3-217ENST00000598493 808 ntTSL 518.21■□□□□ 0.514e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 GTPBP3-223ENST00000600995 812 ntTSL 218.17■□□□□ 0.54e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.414e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.364e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 PCMT1-209ENST00000494411 600 ntTSL 417.1■□□□□ 0.334e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 GTPBP3-216ENST00000598038 2917 ntTSL 516.9■□□□□ 0.34e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 GTPBP3-205ENST00000594018 934 ntTSL 516.62■□□□□ 0.254e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 GTPBP3-213ENST00000596166 1024 ntTSL 316.62■□□□□ 0.254e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 PCMT1-207ENST00000484601 1095 ntTSL 516.5■□□□□ 0.234e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 GTPBP3-211ENST00000596001 1072 ntTSL 516.34■□□□□ 0.214e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 GTPBP3-228ENST00000602165 617 ntTSL 416.08■□□□□ 0.164e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 GTPBP3-204ENST00000593297 555 ntTSL 416.05■□□□□ 0.164e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 GTPBP3-214ENST00000596218 897 ntTSL 316.03■□□□□ 0.164e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 GTPBP3-206ENST00000594345 1004 ntTSL 315.95■□□□□ 0.144e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 GTPBP3-220ENST00000599429 592 ntTSL 415.95■□□□□ 0.144e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 GTPBP3-225ENST00000601261 606 ntTSL 415.65■□□□□ 0.14e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 GTPBP3-215ENST00000596941 678 ntTSL 215.41■□□□□ 0.064e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 GTPBP3-224ENST00000601213 584 ntTSL 415.41■□□□□ 0.064e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 GTPBP3-219ENST00000599329 582 ntTSL 314.1□□□□□ -0.154e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 PCMT1-204ENST00000460828 582 ntTSL 513.47□□□□□ -0.254e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 PCMT1-210ENST00000495487 548 ntTSL 312.76□□□□□ -0.374e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 GTPBP3-210ENST00000595951 532 ntTSL 410.62□□□□□ -0.714e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 PCMT1-208ENST00000486585 801 ntTSL 37.99□□□□□ -1.134e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 SNX5-205ENST00000463050 845 ntTSL 24.23□□□□□ -1.731e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 TCF25-223ENST00000568870 263 ntTSL 213.12□□□□□ -0.311e-6■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 UBE2D3-216ENST00000503742 1977 ntTSL 1 (best)21.75■■□□□ 1.072e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 UBE2D3-214ENST00000503282 584 ntTSL 219.9■□□□□ 0.782e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 PIPOX-208ENST00000580241 1772 ntTSL 519.76■□□□□ 0.752e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 POLD2-214ENST00000481104 541 ntTSL 218.85■□□□□ 0.612e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 UBE2D3-229ENST00000510129 582 ntTSL 318.83■□□□□ 0.62e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 PIPOX-210ENST00000583215 1829 ntTSL 518.64■□□□□ 0.572e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.562e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 POLD2-204ENST00000433715 765 ntTSL 318.15■□□□□ 0.52e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 PSMC3IP-206ENST00000588544 902 ntTSL 1 (best)17.37■□□□□ 0.372e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 PSMC3IP-207ENST00000589505 1244 ntTSL 217.37■□□□□ 0.372e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 PSMC3IP-209ENST00000590931 1049 ntTSL 1 (best)17.37■□□□□ 0.372e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 UBE2D3-220ENST00000505307 743 ntTSL 516.97■□□□□ 0.312e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.32e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.292e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 UBE2D3-215ENST00000503418 662 ntTSL 416.88■□□□□ 0.292e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.272e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.22e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.142e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.092e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.042e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 ATG13-222ENST00000534610 1655 ntTSL 515.26■□□□□ 0.032e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 UBE2D3-213ENST00000502690 599 ntTSL 414.49□□□□□ -0.092e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 ATG13-202ENST00000395549 937 ntTSL 514.48□□□□□ -0.092e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 POLD2-213ENST00000470867 678 ntTSL 514.09□□□□□ -0.152e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.162e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.282e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.292e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 UBE2D3-228ENST00000508974 568 ntTSL 413.06□□□□□ -0.322e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 UBE2D3-209ENST00000394804 4166 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.382e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 ATG13-207ENST00000526508 4199 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.62e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 PIPOX-204ENST00000469082 760 ntTSL 511.19□□□□□ -0.622e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 PIPOX-205ENST00000484308 1038 ntTSL 310.76□□□□□ -0.692e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 UBE2D3-208ENST00000394803 2227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.712e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 ATG13-213ENST00000528984 587 ntTSL 410.37□□□□□ -0.752e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 PSMC3IP-203ENST00000586337 747 ntTSL 59.98□□□□□ -0.812e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 UBE2D3-232ENST00000514755 593 ntTSL 49.94□□□□□ -0.822e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 GPI-213ENST00000590362 378 ntTSL 59.82□□□□□ -0.842e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 POLD2-210ENST00000463464 707 ntTSL 29.53□□□□□ -0.882e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 ATG13-203ENST00000524625 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.922e-8■□□□□ 10.5
SF3A3Q12874 ATG13-201ENST00000359513 4348 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.952e-8■□□□□ 10.5
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