RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580241.5

PIPOX-208, Transcript of pipecolic acid and sarcosine oxidase, humanhuman

TSL 5

Gene PIPOX, Length 1,772 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPOX-208ENST00000580241 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.95■■■■■ 5.11
PIPOX-208ENST00000580241 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.38■■■■■ 4.21
PIPOX-208ENST00000580241 ABCC9O60706 1549 aa39.82■■■■□ 3.97
PIPOX-208ENST00000580241 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
PIPOX-208ENST00000580241 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39■■■■□ 3.83
PIPOX-208ENST00000580241 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.78■■■■□ 3.8
PIPOX-208ENST00000580241 NACADO15069 1562 aa38.66■■■■□ 3.78
PIPOX-208ENST00000580241 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.62■■■■□ 3.77
PIPOX-208ENST00000580241 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.56■■■■□ 3.76
PIPOX-208ENST00000580241 SCRIBQ14160 1630 aa37.96■■■■□ 3.67
PIPOX-208ENST00000580241 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.85■■■■□ 3.65
PIPOX-208ENST00000580241 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.76■■■■□ 3.64
PIPOX-208ENST00000580241 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.41■■■■□ 3.58
PIPOX-208ENST00000580241 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.34■■■■□ 3.57
PIPOX-208ENST00000580241 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.55■■■■□ 3.44
PIPOX-208ENST00000580241 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
PIPOX-208ENST00000580241 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
PIPOX-208ENST00000580241 SMARCA4P51532 1647 aa36.31■■■■□ 3.4
PIPOX-208ENST00000580241 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.26■■■■□ 3.4
PIPOX-208ENST00000580241 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
PIPOX-208ENST00000580241 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.04■■■■□ 3.36
PIPOX-208ENST00000580241 WIZO95785 1651 aa35.96■■■■□ 3.35
PIPOX-208ENST00000580241 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
PIPOX-208ENST00000580241 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.86■■■■□ 3.33
PIPOX-208ENST00000580241 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.85■■■■□ 3.33
PIPOX-208ENST00000580241 SMARCA2P51531 1590 aa35.83■■■■□ 3.33
PIPOX-208ENST00000580241 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.78■■■■□ 3.32
PIPOX-208ENST00000580241 NCAPD3P42695 1498 aa35.65■■■■□ 3.3
PIPOX-208ENST00000580241 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
PIPOX-208ENST00000580241 HMGXB3Q12766 1538 aa35.6■■■■□ 3.29
PIPOX-208ENST00000580241 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
PIPOX-208ENST00000580241 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.12■■■■□ 3.21
PIPOX-208ENST00000580241 NESP48681 1621 aa34.72■■■■□ 3.15
PIPOX-208ENST00000580241 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.68■■■■□ 3.14
PIPOX-208ENST00000580241 CFTRP13569 1480 aa34.66■■■■□ 3.14
PIPOX-208ENST00000580241 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.64■■■■□ 3.14
PIPOX-208ENST00000580241 PRDM2Q13029 1718 aa34.57■■■■□ 3.12
PIPOX-208ENST00000580241 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.36■■■■□ 3.09
PIPOX-208ENST00000580241 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.34■■■■□ 3.09
PIPOX-208ENST00000580241 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.34■■■■□ 3.09
PIPOX-208ENST00000580241 ERCC6Q03468 1493 aa34.23■■■■□ 3.07
PIPOX-208ENST00000580241 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.23■■■■□ 3.07
PIPOX-208ENST00000580241 ABCC8Q09428 1581 aa34.2■■■■□ 3.07
PIPOX-208ENST00000580241 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.01■■■■□ 3.04
PIPOX-208ENST00000580241 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.99■■■■□ 3.03
PIPOX-208ENST00000580241 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
PIPOX-208ENST00000580241 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
PIPOX-208ENST00000580241 SYNJ1O43426 1573 aa33.96■■■■□ 3.03
PIPOX-208ENST00000580241 CUX1P39880 1505 aa33.96■■■■□ 3.03
PIPOX-208ENST00000580241 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.91■■■■□ 3.02
PIPOX-208ENST00000580241 TOPBP1Q92547 1522 aa33.89■■■■□ 3.02
PIPOX-208ENST00000580241 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.88■■■■□ 3.01
PIPOX-208ENST00000580241 TOP2BQ02880 1626 aa33.87■■■■□ 3.01
PIPOX-208ENST00000580241 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.86■■■■□ 3.01
PIPOX-208ENST00000580241 WDR62O43379 1518 aa33.86■■■■□ 3.01
PIPOX-208ENST00000580241 TRIM41Q8WV44 630 aa33.77■■■■□ 3
PIPOX-208ENST00000580241 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.72■■■□□ 2.99
PIPOX-208ENST00000580241 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
PIPOX-208ENST00000580241 CUX2O14529 1486 aa33.55■■■□□ 2.96
PIPOX-208ENST00000580241 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.55■■■□□ 2.96
PIPOX-208ENST00000580241 SOGA1O94964 1423 aa33.5■■■□□ 2.95
PIPOX-208ENST00000580241 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
PIPOX-208ENST00000580241 WDR97A6NE52 1622 aa33.43■■■□□ 2.94
PIPOX-208ENST00000580241 IFT140Q96RY7 1462 aa33.42■■■□□ 2.94
PIPOX-208ENST00000580241 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.37■■■□□ 2.93
PIPOX-208ENST00000580241 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.31■■■□□ 2.92
PIPOX-208ENST00000580241 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.27■■■□□ 2.92
PIPOX-208ENST00000580241 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.26■■■□□ 2.92
PIPOX-208ENST00000580241 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.24■■■□□ 2.91
PIPOX-208ENST00000580241 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.23■■■□□ 2.91
PIPOX-208ENST00000580241 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.21■■■□□ 2.911e-7■■■■■ 34.3
PIPOX-208ENST00000580241 KIF27Q86VH2 1401 aa33.2■■■□□ 2.91
PIPOX-208ENST00000580241 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.17■■■□□ 2.9
PIPOX-208ENST00000580241 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.14■■■□□ 2.9
PIPOX-208ENST00000580241 PBRM1Q86U86 1689 aa33.12■■■□□ 2.89
PIPOX-208ENST00000580241 EEA1Q15075 1411 aa33.04■■■□□ 2.88
PIPOX-208ENST00000580241 GRIN2BQ13224 1484 aa33■■■□□ 2.87
PIPOX-208ENST00000580241 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.98■■■□□ 2.87
PIPOX-208ENST00000580241 IGF1RP08069 1367 aa32.96■■■□□ 2.87
PIPOX-208ENST00000580241 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.93■■■□□ 2.86
PIPOX-208ENST00000580241 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.92■■■□□ 2.86
PIPOX-208ENST00000580241 CUL7Q14999 1698 aa32.88■■■□□ 2.85
PIPOX-208ENST00000580241 ADAMTS12P58397 1594 aa32.86■■■□□ 2.85
PIPOX-208ENST00000580241 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.83■■■□□ 2.85
PIPOX-208ENST00000580241 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.79■■■□□ 2.84
PIPOX-208ENST00000580241 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.78■■■□□ 2.84
PIPOX-208ENST00000580241 PRXQ9BXM0 1461 aa32.77■■■□□ 2.84
PIPOX-208ENST00000580241 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.75■■■□□ 2.83
PIPOX-208ENST00000580241 KIF21BO75037 1637 aa32.75■■■□□ 2.83
PIPOX-208ENST00000580241 SYNJ2O15056 1496 aa32.72■■■□□ 2.83
PIPOX-208ENST00000580241 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.7■■■□□ 2.83
PIPOX-208ENST00000580241 CHD1O14646 1710 aa32.69■■■□□ 2.82
PIPOX-208ENST00000580241 FBLN2P98095 1184 aa32.68■■■□□ 2.82
PIPOX-208ENST00000580241 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.63■■■□□ 2.81
PIPOX-208ENST00000580241 GRIN2AQ12879 1464 aa32.62■■■□□ 2.81
PIPOX-208ENST00000580241 GOLGA3Q08378 1498 aa32.61■■■□□ 2.81
PIPOX-208ENST00000580241 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.57■■■□□ 2.8
PIPOX-208ENST00000580241 CEP170Q5SW79 1584 aa32.48■■■□□ 2.79
PIPOX-208ENST00000580241 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
PIPOX-208ENST00000580241 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.45■■■□□ 2.79
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