RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481104.1

POLD2-214, Transcript of DNA polymerase delta 2, accessory subunit, humanhuman

TSL 2

Gene POLD2, Length 541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2-214ENST00000481104 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.21■■■■■ 6.11
POLD2-214ENST00000481104 ABCC9O60706 1549 aa47.71■■■■■ 5.23
POLD2-214ENST00000481104 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.59■■■■■ 5.21
POLD2-214ENST00000481104 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.27■■■■■ 4.84
POLD2-214ENST00000481104 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.02■■■■■ 4.8
POLD2-214ENST00000481104 NACADO15069 1562 aa45.02■■■■■ 4.8
POLD2-214ENST00000481104 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.66■■■■■ 4.74
POLD2-214ENST00000481104 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.48■■■■■ 4.71
POLD2-214ENST00000481104 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.46■■■■■ 4.71
POLD2-214ENST00000481104 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.36■■■■■ 4.69
POLD2-214ENST00000481104 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.24■■■■■ 4.67
POLD2-214ENST00000481104 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.65
POLD2-214ENST00000481104 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.93■■■■■ 4.62
POLD2-214ENST00000481104 SCRIBQ14160 1630 aa43.43■■■■■ 4.54
POLD2-214ENST00000481104 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.39■■■■■ 4.54
POLD2-214ENST00000481104 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.08■■■■■ 4.49
POLD2-214ENST00000481104 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.01■■■■■ 4.48
POLD2-214ENST00000481104 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.94■■■■■ 4.47
POLD2-214ENST00000481104 NCAPD3P42695 1498 aa41.68■■■■■ 4.26
POLD2-214ENST00000481104 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.57■■■■■ 4.25
POLD2-214ENST00000481104 SMARCA4P51532 1647 aa41.46■■■■■ 4.23
POLD2-214ENST00000481104 HMGXB3Q12766 1538 aa41.29■■■■■ 4.2
POLD2-214ENST00000481104 SMARCA2P51531 1590 aa41.29■■■■■ 4.2
POLD2-214ENST00000481104 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
POLD2-214ENST00000481104 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.12■■■■■ 4.17
POLD2-214ENST00000481104 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.12■■■■■ 4.17
POLD2-214ENST00000481104 NESP48681 1621 aa41.08■■■■■ 4.17
POLD2-214ENST00000481104 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.07■■■■■ 4.16
POLD2-214ENST00000481104 CUX2O14529 1486 aa41.02■■■■■ 4.16
POLD2-214ENST00000481104 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
POLD2-214ENST00000481104 ERCC6Q03468 1493 aa41■■■■■ 4.15
POLD2-214ENST00000481104 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
POLD2-214ENST00000481104 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.6■■■■■ 4.09
POLD2-214ENST00000481104 WIZO95785 1651 aa40.49■■■■■ 4.07
POLD2-214ENST00000481104 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.4■■■■■ 4.06
POLD2-214ENST00000481104 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.36■■■■■ 4.05
POLD2-214ENST00000481104 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.33■■■■■ 4.05
POLD2-214ENST00000481104 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
POLD2-214ENST00000481104 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.07■■■■■ 4
POLD2-214ENST00000481104 WDR62O43379 1518 aa40.03■■■■■ 4
POLD2-214ENST00000481104 CFTRP13569 1480 aa39.95■■■■□ 3.99
POLD2-214ENST00000481104 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
POLD2-214ENST00000481104 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.88■■■■□ 3.98
POLD2-214ENST00000481104 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.85■■■■□ 3.97
POLD2-214ENST00000481104 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
POLD2-214ENST00000481104 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.57■■■■□ 3.93
POLD2-214ENST00000481104 PRDM2Q13029 1718 aa39.32■■■■□ 3.89
POLD2-214ENST00000481104 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.19■■■■□ 3.86
POLD2-214ENST00000481104 TOPBP1Q92547 1522 aa39.17■■■■□ 3.86
POLD2-214ENST00000481104 TRIM41Q8WV44 630 aa39.15■■■■□ 3.86
POLD2-214ENST00000481104 OSCARQ8IYS5 282 aa39.11■■■■□ 3.85
POLD2-214ENST00000481104 IFT140Q96RY7 1462 aa39.09■■■■□ 3.85
POLD2-214ENST00000481104 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.96■■■■□ 3.83
POLD2-214ENST00000481104 ABCC8Q09428 1581 aa38.9■■■■□ 3.82
POLD2-214ENST00000481104 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.86■■■■□ 3.81
POLD2-214ENST00000481104 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.84■■■■□ 3.81
POLD2-214ENST00000481104 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.79■■■■□ 3.8
POLD2-214ENST00000481104 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.79■■■■□ 3.84e-7■■■□□ 18.6
POLD2-214ENST00000481104 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.7■■■■□ 3.79
POLD2-214ENST00000481104 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.7■■■■□ 3.79
POLD2-214ENST00000481104 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.7■■■■□ 3.79
POLD2-214ENST00000481104 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.69■■■■□ 3.78
POLD2-214ENST00000481104 ARHGEF11O15085 1522 aa38.6■■■■□ 3.77
POLD2-214ENST00000481104 CUX1P39880 1505 aa38.56■■■■□ 3.76
POLD2-214ENST00000481104 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.53■■■■□ 3.76
POLD2-214ENST00000481104 SOGA1O94964 1423 aa38.53■■■■□ 3.76
POLD2-214ENST00000481104 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.52■■■■□ 3.76
POLD2-214ENST00000481104 CHD1O14646 1710 aa38.5■■■■□ 3.75
POLD2-214ENST00000481104 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.34■■■■□ 3.73
POLD2-214ENST00000481104 FBLN2P98095 1184 aa38.3■■■■□ 3.72
POLD2-214ENST00000481104 ARAP1Q96P48 1450 aa38.29■■■■□ 3.72
POLD2-214ENST00000481104 WDR97A6NE52 1622 aa38.27■■■■□ 3.72
POLD2-214ENST00000481104 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.25■■■■□ 3.71
POLD2-214ENST00000481104 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.24■■■■□ 3.71
POLD2-214ENST00000481104 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.21■■■■□ 3.71
POLD2-214ENST00000481104 GRIN2BQ13224 1484 aa38.18■■■■□ 3.7
POLD2-214ENST00000481104 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.16■■■■□ 3.7
POLD2-214ENST00000481104 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.09■■■■□ 3.69
POLD2-214ENST00000481104 SYNJ2O15056 1496 aa38.07■■■■□ 3.68
POLD2-214ENST00000481104 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.06■■■■□ 3.68
POLD2-214ENST00000481104 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.04■■■■□ 3.68
POLD2-214ENST00000481104 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.04■■■■□ 3.68
POLD2-214ENST00000481104 PBRM1Q86U86 1689 aa37.98■■■■□ 3.67
POLD2-214ENST00000481104 SYNJ1O43426 1573 aa37.97■■■■□ 3.67
POLD2-214ENST00000481104 TOP2BQ02880 1626 aa37.84■■■■□ 3.65
POLD2-214ENST00000481104 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.83■■■■□ 3.65
POLD2-214ENST00000481104 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.83■■■■□ 3.65
POLD2-214ENST00000481104 GRIN2AQ12879 1464 aa37.73■■■■□ 3.63
POLD2-214ENST00000481104 ADAMTS12P58397 1594 aa37.72■■■■□ 3.63
POLD2-214ENST00000481104 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.7■■■■□ 3.63
POLD2-214ENST00000481104 NUP160Q12769 1436 aa37.69■■■■□ 3.62
POLD2-214ENST00000481104 CEP170Q5SW79 1584 aa37.67■■■■□ 3.62
POLD2-214ENST00000481104 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.66■■■■□ 3.62
POLD2-214ENST00000481104 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.58■■■■□ 3.61
POLD2-214ENST00000481104 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.54■■■■□ 3.6
POLD2-214ENST00000481104 SHROOM2Q13796 1616 aa37.48■■■■□ 3.59
POLD2-214ENST00000481104 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
POLD2-214ENST00000481104 IGF1RP08069 1367 aa37.2■■■■□ 3.55
POLD2-214ENST00000481104 JPH4Q96JJ6 628 aa37.2■■■■□ 3.55
POLD2-214ENST00000481104 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.2■■■■□ 3.55
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