RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433715.5

POLD2-204, Transcript of DNA polymerase delta 2, accessory subunit, humanhuman

TSL 3

Gene POLD2, Length 765 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2-204ENST00000433715 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.37■■■■■ 5.81
POLD2-204ENST00000433715 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.92■■■■■ 4.94
POLD2-204ENST00000433715 ABCC9O60706 1549 aa44.87■■■■■ 4.77
POLD2-204ENST00000433715 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.26■■■■■ 4.52
POLD2-204ENST00000433715 NACADO15069 1562 aa43.21■■■■■ 4.51
POLD2-204ENST00000433715 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.05■■■■■ 4.48
POLD2-204ENST00000433715 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
POLD2-204ENST00000433715 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.7■■■■■ 4.43
POLD2-204ENST00000433715 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.54■■■■■ 4.4
POLD2-204ENST00000433715 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.19■■■■■ 4.34
POLD2-204ENST00000433715 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.96■■■■■ 4.31
POLD2-204ENST00000433715 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.77■■■■■ 4.28
POLD2-204ENST00000433715 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.77■■■■■ 4.28
POLD2-204ENST00000433715 SCRIBQ14160 1630 aa41.58■■■■■ 4.25
POLD2-204ENST00000433715 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.43■■■■■ 4.22
POLD2-204ENST00000433715 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
POLD2-204ENST00000433715 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.7■■■■■ 4.11
POLD2-204ENST00000433715 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.45■■■■■ 4.07
POLD2-204ENST00000433715 SMARCA4P51532 1647 aa39.9■■■■□ 3.98
POLD2-204ENST00000433715 NCAPD3P42695 1498 aa39.88■■■■□ 3.97
POLD2-204ENST00000433715 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
POLD2-204ENST00000433715 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.76■■■■□ 3.96
POLD2-204ENST00000433715 SMARCA2P51531 1590 aa39.76■■■■□ 3.95
POLD2-204ENST00000433715 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.69■■■■□ 3.94
POLD2-204ENST00000433715 HMGXB3Q12766 1538 aa39.68■■■■□ 3.94
POLD2-204ENST00000433715 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.49■■■■□ 3.91
POLD2-204ENST00000433715 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.37■■■■□ 3.89
POLD2-204ENST00000433715 WIZO95785 1651 aa38.99■■■■□ 3.83
POLD2-204ENST00000433715 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.97■■■■□ 3.83
POLD2-204ENST00000433715 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.85■■■■□ 3.81
POLD2-204ENST00000433715 NESP48681 1621 aa38.76■■■■□ 3.8
POLD2-204ENST00000433715 ERCC6Q03468 1493 aa38.73■■■■□ 3.79
POLD2-204ENST00000433715 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.71■■■■□ 3.79
POLD2-204ENST00000433715 CUX2O14529 1486 aa38.66■■■■□ 3.78
POLD2-204ENST00000433715 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.6■■■■□ 3.77
POLD2-204ENST00000433715 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.54■■■■□ 3.76
POLD2-204ENST00000433715 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.41■■■■□ 3.74
POLD2-204ENST00000433715 CFTRP13569 1480 aa38.38■■■■□ 3.73
POLD2-204ENST00000433715 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.34■■■■□ 3.73
POLD2-204ENST00000433715 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.16■■■■□ 3.7
POLD2-204ENST00000433715 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.15■■■■□ 3.7
POLD2-204ENST00000433715 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.12■■■■□ 3.69
POLD2-204ENST00000433715 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.11■■■■□ 3.69
POLD2-204ENST00000433715 WDR62O43379 1518 aa38.1■■■■□ 3.69
POLD2-204ENST00000433715 PRDM2Q13029 1718 aa38.05■■■■□ 3.68
POLD2-204ENST00000433715 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.76■■■■□ 3.63
POLD2-204ENST00000433715 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.67■■■■□ 3.62
POLD2-204ENST00000433715 ABCC8Q09428 1581 aa37.6■■■■□ 3.61
POLD2-204ENST00000433715 TOPBP1Q92547 1522 aa37.5■■■■□ 3.59
POLD2-204ENST00000433715 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.46■■■■□ 3.59
POLD2-204ENST00000433715 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
POLD2-204ENST00000433715 IFT140Q96RY7 1462 aa37.38■■■■□ 3.57
POLD2-204ENST00000433715 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
POLD2-204ENST00000433715 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
POLD2-204ENST00000433715 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
POLD2-204ENST00000433715 CUX1P39880 1505 aa37.09■■■■□ 3.53
POLD2-204ENST00000433715 WDR97A6NE52 1622 aa37.03■■■■□ 3.52
POLD2-204ENST00000433715 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
POLD2-204ENST00000433715 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.98■■■■□ 3.51
POLD2-204ENST00000433715 SOGA1O94964 1423 aa36.94■■■■□ 3.5
POLD2-204ENST00000433715 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.88■■■■□ 3.49
POLD2-204ENST00000433715 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.82■■■■□ 3.499e-7■■■■□ 25.6
POLD2-204ENST00000433715 OSCARQ8IYS5 282 aa36.81■■■■□ 3.48
POLD2-204ENST00000433715 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.77■■■■□ 3.48
POLD2-204ENST00000433715 TOP2BQ02880 1626 aa36.76■■■■□ 3.48
POLD2-204ENST00000433715 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.73■■■■□ 3.47
POLD2-204ENST00000433715 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.73■■■■□ 3.47
POLD2-204ENST00000433715 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
POLD2-204ENST00000433715 SYNJ1O43426 1573 aa36.63■■■■□ 3.45
POLD2-204ENST00000433715 GRIN2BQ13224 1484 aa36.62■■■■□ 3.45
POLD2-204ENST00000433715 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
POLD2-204ENST00000433715 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.6■■■■□ 3.45
POLD2-204ENST00000433715 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.55■■■■□ 3.44
POLD2-204ENST00000433715 CHD1O14646 1710 aa36.54■■■■□ 3.44
POLD2-204ENST00000433715 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.53■■■■□ 3.44
POLD2-204ENST00000433715 PBRM1Q86U86 1689 aa36.47■■■■□ 3.43
POLD2-204ENST00000433715 SYNJ2O15056 1496 aa36.44■■■■□ 3.42
POLD2-204ENST00000433715 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.3■■■■□ 3.4
POLD2-204ENST00000433715 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.29■■■■□ 3.4
POLD2-204ENST00000433715 ARHGEF11O15085 1522 aa36.29■■■■□ 3.4
POLD2-204ENST00000433715 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.28■■■■□ 3.4
POLD2-204ENST00000433715 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.28■■■■□ 3.4
POLD2-204ENST00000433715 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.28■■■■□ 3.4
POLD2-204ENST00000433715 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
POLD2-204ENST00000433715 FBLN2P98095 1184 aa36.25■■■■□ 3.39
POLD2-204ENST00000433715 ADAMTS12P58397 1594 aa36.23■■■■□ 3.39
POLD2-204ENST00000433715 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.17■■■■□ 3.38
POLD2-204ENST00000433715 GRIN2AQ12879 1464 aa36.14■■■■□ 3.38
POLD2-204ENST00000433715 NUP160Q12769 1436 aa36.07■■■■□ 3.36
POLD2-204ENST00000433715 KIF27Q86VH2 1401 aa36■■■■□ 3.35
POLD2-204ENST00000433715 TRIM41Q8WV44 630 aa35.99■■■■□ 3.35
POLD2-204ENST00000433715 ARAP1Q96P48 1450 aa35.97■■■■□ 3.35
POLD2-204ENST00000433715 CEP170Q5SW79 1584 aa35.94■■■■□ 3.34
POLD2-204ENST00000433715 CUL7Q14999 1698 aa35.89■■■■□ 3.34
POLD2-204ENST00000433715 IGF1RP08069 1367 aa35.89■■■■□ 3.34
POLD2-204ENST00000433715 SHROOM2Q13796 1616 aa35.85■■■■□ 3.33
POLD2-204ENST00000433715 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.76■■■■□ 3.32
POLD2-204ENST00000433715 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.72■■■■□ 3.31
POLD2-204ENST00000433715 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.63■■■■□ 3.29
POLD2-204ENST00000433715 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.62■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms