RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601261.5

GTPBP3-225, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, human

TSL 4

Gene GTPBP3, Length 606 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP3-225	ENST00000601261	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		44.96	■■■■■ 4.79
GTPBP3-225	ENST00000601261	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		40.2	■■■■■ 4.03
GTPBP3-225	ENST00000601261	ABCC9	O60706	1549 aa		39.96	■■■■□ 3.99
GTPBP3-225	ENST00000601261	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		38.18	■■■■□ 3.7
GTPBP3-225	ENST00000601261	NACAD	O15069	1562 aa		37.98	■■■■□ 3.67
GTPBP3-225	ENST00000601261	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		37.94	■■■■□ 3.66
GTPBP3-225	ENST00000601261	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		37.56	■■■■□ 3.6
GTPBP3-225	ENST00000601261	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	37.3	■■■■□ 3.56
GTPBP3-225	ENST00000601261	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	37.28	■■■■□ 3.56
GTPBP3-225	ENST00000601261	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		37.23	■■■■□ 3.55
GTPBP3-225	ENST00000601261	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		37.21	■■■■□ 3.55
GTPBP3-225	ENST00000601261	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		37.16	■■■■□ 3.54
GTPBP3-225	ENST00000601261	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		36.99	■■■■□ 3.51
GTPBP3-225	ENST00000601261	SCRIB	Q14160	1630 aa		36.64	■■■■□ 3.46
GTPBP3-225	ENST00000601261	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		36.59	■■■■□ 3.45
GTPBP3-225	ENST00000601261	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		36.09	■■■■□ 3.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	36.09	■■■■□ 3.37
GTPBP3-225	ENST00000601261	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.99	■■■■□ 3.35
GTPBP3-225	ENST00000601261	NCAPD3	P42695	1498 aa		35.07	■■■■□ 3.2
GTPBP3-225	ENST00000601261	SMARCA4	P51532	1647 aa		34.99	■■■■□ 3.19
GTPBP3-225	ENST00000601261	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.98	■■■■□ 3.19
GTPBP3-225	ENST00000601261	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.92	■■■■□ 3.18
GTPBP3-225	ENST00000601261	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	34.9	■■■■□ 3.18
GTPBP3-225	ENST00000601261	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.81	■■■■□ 3.16
GTPBP3-225	ENST00000601261	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.68	■■■■□ 3.14
GTPBP3-225	ENST00000601261	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		34.66	■■■■□ 3.14
GTPBP3-225	ENST00000601261	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		34.62	■■■■□ 3.13
GTPBP3-225	ENST00000601261	ERCC6	Q03468	1493 aa		34.53	■■■■□ 3.12
GTPBP3-225	ENST00000601261	NES	P48681	1621 aa		34.38	■■■■□ 3.09
GTPBP3-225	ENST00000601261	CUX2	O14529	1486 aa		34.36	■■■■□ 3.09
GTPBP3-225	ENST00000601261	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		34.23	■■■■□ 3.07
GTPBP3-225	ENST00000601261	WIZ	O95785	1651 aa		34.21	■■■■□ 3.07
GTPBP3-225	ENST00000601261	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		34.07	■■■■□ 3.04
GTPBP3-225	ENST00000601261	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		34.05	■■■■□ 3.04
GTPBP3-225	ENST00000601261	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		34.04	■■■■□ 3.04
GTPBP3-225	ENST00000601261	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	34.04	■■■■□ 3.04
GTPBP3-225	ENST00000601261	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.95	■■■■□ 3.03
GTPBP3-225	ENST00000601261	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		33.92	■■■■□ 3.02
GTPBP3-225	ENST00000601261	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	33.83	■■■■□ 3.01
GTPBP3-225	ENST00000601261	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.71	■■■□□ 2.99
GTPBP3-225	ENST00000601261	CFTR	P13569	1480 aa		33.68	■■■□□ 2.98
GTPBP3-225	ENST00000601261	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.64	■■■□□ 2.98
GTPBP3-225	ENST00000601261	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.63	■■■□□ 2.97
GTPBP3-225	ENST00000601261	WDR62	O43379	1518 aa		33.58	■■■□□ 2.97
GTPBP3-225	ENST00000601261	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		33.45	■■■□□ 2.95
GTPBP3-225	ENST00000601261	PRDM2	Q13029	1718 aa		33.3	■■■□□ 2.92
GTPBP3-225	ENST00000601261	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
GTPBP3-225	ENST00000601261	ABCC8	Q09428	1581 aa		33.02	■■■□□ 2.88
GTPBP3-225	ENST00000601261	TOPBP1	Q92547	1522 aa		33.01	■■■□□ 2.87
GTPBP3-225	ENST00000601261	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.97	■■■□□ 2.87
GTPBP3-225	ENST00000601261	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.91	■■■□□ 2.86
GTPBP3-225	ENST00000601261	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		32.9	■■■□□ 2.86
GTPBP3-225	ENST00000601261	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
GTPBP3-225	ENST00000601261	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
GTPBP3-225	ENST00000601261	TRIM41	Q8WV44	630 aa		32.69	■■■□□ 2.82
GTPBP3-225	ENST00000601261	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
GTPBP3-225	ENST00000601261	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
GTPBP3-225	ENST00000601261	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
GTPBP3-225	ENST00000601261	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.61	■■■□□ 2.81	3e-8	■■■■■ 31.4
GTPBP3-225	ENST00000601261	SOGA1	O94964	1423 aa		32.59	■■■□□ 2.81
GTPBP3-225	ENST00000601261	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.56	■■■□□ 2.8
GTPBP3-225	ENST00000601261	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.52	■■■□□ 2.8
GTPBP3-225	ENST00000601261	CUX1	P39880	1505 aa		32.51	■■■□□ 2.8
GTPBP3-225	ENST00000601261	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
GTPBP3-225	ENST00000601261	FBLN2	P98095	1184 aa		32.42	■■■□□ 2.78
GTPBP3-225	ENST00000601261	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.39	■■■□□ 2.78
GTPBP3-225	ENST00000601261	CHD1	O14646	1710 aa		32.35	■■■□□ 2.77
GTPBP3-225	ENST00000601261	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		32.33	■■■□□ 2.77
GTPBP3-225	ENST00000601261	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		32.33	■■■□□ 2.77
GTPBP3-225	ENST00000601261	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		32.33	■■■□□ 2.77
GTPBP3-225	ENST00000601261	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		32.28	■■■□□ 2.76
GTPBP3-225	ENST00000601261	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.27	■■■□□ 2.76
GTPBP3-225	ENST00000601261	GRIN2B	Q13224	1484 aa		32.26	■■■□□ 2.75
GTPBP3-225	ENST00000601261	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
GTPBP3-225	ENST00000601261	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
GTPBP3-225	ENST00000601261	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		32.18	■■■□□ 2.74
GTPBP3-225	ENST00000601261	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		32.18	■■■□□ 2.74
GTPBP3-225	ENST00000601261	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	32.15	■■■□□ 2.74
GTPBP3-225	ENST00000601261	SYNJ2	O15056	1496 aa		32.11	■■■□□ 2.73
GTPBP3-225	ENST00000601261	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		32.1	■■■□□ 2.73
GTPBP3-225	ENST00000601261	PBRM1	Q86U86	1689 aa		32.08	■■■□□ 2.73
GTPBP3-225	ENST00000601261	TOP2B	Q02880	1626 aa		32.08	■■■□□ 2.73
GTPBP3-225	ENST00000601261	SYNJ1	O43426	1573 aa		32.07	■■■□□ 2.72
GTPBP3-225	ENST00000601261	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GTPBP3-225	ENST00000601261	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GTPBP3-225	ENST00000601261	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		32	■■■□□ 2.71
GTPBP3-225	ENST00000601261	ARAP1	Q96P48	1450 aa		31.97	■■■□□ 2.71
GTPBP3-225	ENST00000601261	GRIN2A	Q12879	1464 aa		31.83	■■■□□ 2.69
GTPBP3-225	ENST00000601261	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.81	■■■□□ 2.68
GTPBP3-225	ENST00000601261	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.8	■■■□□ 2.68
GTPBP3-225	ENST00000601261	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		31.79	■■■□□ 2.68
GTPBP3-225	ENST00000601261	NUP160	Q12769	1436 aa		31.71	■■■□□ 2.67
GTPBP3-225	ENST00000601261	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	31.68	■■■□□ 2.66
GTPBP3-225	ENST00000601261	CEP170	Q5SW79	1584 aa		31.66	■■■□□ 2.66
GTPBP3-225	ENST00000601261	KIF27	Q86VH2	1401 aa		31.53	■■■□□ 2.64
GTPBP3-225	ENST00000601261	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		31.51	■■■□□ 2.63
GTPBP3-225	ENST00000601261	SHROOM2	Q13796	1616 aa		31.49	■■■□□ 2.63
GTPBP3-225	ENST00000601261	IGF1R	P08069	1367 aa		31.46	■■■□□ 2.63
GTPBP3-225	ENST00000601261	JPH4	Q96JJ6	628 aa		31.45	■■■□□ 2.63
GTPBP3-225	ENST00000601261	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	31.41	■■■□□ 2.62

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