Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 ATG4A-201ENST00000343524 1941 ntTSL 28.93□□□□□ -0.986e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 STX18-208ENST00000512195 577 ntTSL 37.39□□□□□ -1.236e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.416e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 ATG4A-204ENST00000372246 2501 ntTSL 1 (best)6.03□□□□□ -1.446e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 STX18-204ENST00000503861 840 ntTSL 54.58□□□□□ -1.686e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.886e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 RAB8A-207ENST00000592971 300 ntTSL 20.3□□□□□ -2.366e-7■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 ADNP2-204ENST00000560752 880 ntTSL 533.76■■■□□ 2.999e-11■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 ADNP2-202ENST00000559951 823 ntTSL 325.7■■□□□ 1.79e-11■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 AGPAT3-206ENST00000422850 1003 ntTSL 519.42■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 AGPAT3-210ENST00000457068 924 ntTSL 319.42■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.699e-11■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 AGPAT3-209ENST00000448845 392 ntTSL 512.9□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 ADNP2-205ENST00000561195 124 ntTSL 37.38□□□□□ -1.239e-11■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 ADNP2-203ENST00000560561 647 ntTSL 34.63□□□□□ -1.679e-11■■■■■ 46.9
AATFQ9NY61 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.082e-8■■■■■ 46.6
AATFQ9NY61 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.22e-8■■■■■ 46.6
AATFQ9NY61 AGAP1-214ENST00000635100 2478 ntTSL 517.48■□□□□ 0.392e-8■■■■■ 46.6
AATFQ9NY61 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 46.6
AATFQ9NY61 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.084e-38■■■■■ 46.6
AATFQ9NY61 RPL23A-205ENST00000472628 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.253e-28■■■■■ 46.6
AATFQ9NY61 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.682e-8■■■■■ 46.6
AATFQ9NY61 C11orf24-205ENST00000530166 941 ntTSL 321.27■■□□□ 12e-8■■■■■ 46.6
AATFQ9NY61 C11orf24-202ENST00000527280 533 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.95■□□□□ 0.942e-8■■■■■ 46.6
AATFQ9NY61 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.632e-8■■■■■ 46.6
AATFQ9NY61 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 46.5
AATFQ9NY61 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.442e-7■■■■■ 46.1
AATFQ9NY61 BRD9-212ENST00000495265 2843 ntTSL 219.99■□□□□ 0.792e-7■■■■■ 46.1
AATFQ9NY61 BRD9-201ENST00000466684 1417 ntTSL 219.96■□□□□ 0.792e-7■■■■■ 46.1
AATFQ9NY61 BRD9-208ENST00000489816 3170 ntTSL 1 (best)18.07■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 46.1
AATFQ9NY61 BRD9-218ENST00000519838 396 ntTSL 217.07■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 46.1
AATFQ9NY61 BRD9-213ENST00000495794 4865 ntTSL 215.7■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 46.1
AATFQ9NY61 BRD9-204ENST00000483173 2120 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 46.1
AATFQ9NY61 BRD9-203ENST00000475706 744 ntTSL 1 (best)14.12□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 46.1
AATFQ9NY61 BRD9-209ENST00000490814 3477 ntTSL 1 (best)11.31□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 46.1
AATFQ9NY61 BRD9-211ENST00000494422 449 ntTSL 37.66□□□□□ -1.182e-7■■■■■ 46.1
AATFQ9NY61 CBFA2T3-204ENST00000563640 664 ntTSL 219.18■□□□□ 0.661e-6■■■■■ 46.1
AATFQ9NY61 MICALL2-211ENST00000487156 874 ntTSL 523.55■■□□□ 1.368e-10■■■■■ 46.1
AATFQ9NY61 ACAP3-211ENST00000479108 485 ntTSL 318.67■□□□□ 0.584e-6■■■■■ 46
AATFQ9NY61 ACAP3-203ENST00000354980 582 ntTSL 516.86■□□□□ 0.294e-6■■■■■ 46
AATFQ9NY61 ACAP3-205ENST00000438966 265 ntTSL 39.15□□□□□ -0.944e-6■■■■■ 46
AATFQ9NY61 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.489e-7■■■■■ 46
AATFQ9NY61 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.91□□□□□ -2.18e-85■■■■■ 46
AATFQ9NY61 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.483e-28■■■■■ 45.7
AATFQ9NY61 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.053e-28■■■■■ 45.7
AATFQ9NY61 RPL23A-202ENST00000394935 580 ntTSL 311.94□□□□□ -0.53e-28■■■■■ 45.7
AATFQ9NY61 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.93e-28■■■■■ 45.7
AATFQ9NY61 RPL23A-201ENST00000355731 587 ntTSL 57.58□□□□□ -1.23e-28■■■■■ 45.7
AATFQ9NY61 FZR1-207ENST00000591290 1331 ntTSL 523.95■■□□□ 1.421e-9■■■■■ 45.6
AATFQ9NY61 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.061e-9■■■■■ 45.6
AATFQ9NY61 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.81e-9■■■■■ 45.6
AATFQ9NY61 FZR1-208ENST00000592214 598 ntTSL 319.71■□□□□ 0.751e-9■■■■■ 45.6
AATFQ9NY61 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.461e-9■■■■■ 45.6
AATFQ9NY61 RNF44-207ENST00000513029 1647 ntTSL 221.58■■□□□ 1.045e-9■■■■■ 45.6
AATFQ9NY61 RNF44-202ENST00000504160 887 ntTSL 320.83■□□□□ 0.935e-9■■■■■ 45.6
AATFQ9NY61 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.155e-9■■■■■ 45.6
AATFQ9NY61 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.625e-8■■■■■ 45.5
AATFQ9NY61 TMEM91-201ENST00000342187 454 ntTSL 512.28□□□□□ -0.445e-8■■■■■ 45.5
AATFQ9NY61 TRRAP-203ENST00000417523 550 ntTSL 420.3■□□□□ 0.841e-323■■■■■ 45.4
AATFQ9NY61 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.141e-323■■■■■ 45.4
AATFQ9NY61 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.151e-323■■■■■ 45.4
AATFQ9NY61 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.181e-323■■■■■ 45.4
AATFQ9NY61 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.351e-323■■■■■ 45.4
AATFQ9NY61 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.921e-13■■■■■ 45.3
AATFQ9NY61 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.981e-13■■■■■ 45.3
AATFQ9NY61 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.341e-13■■■■■ 45.3
AATFQ9NY61 AC011476.3-201ENST00000593060 786 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.811e-12■■■■■ 45.1
AATFQ9NY61 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.061e-12■■■■■ 45.1
AATFQ9NY61 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.231e-12■■■■■ 45.1
AATFQ9NY61 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.638e-7■■■■■ 45
AATFQ9NY61 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC7.68□□□□□ -1.181e-323■■■■■ 44.6
AATFQ9NY61 RPS11-204ENST00000599167 1133 ntTSL 514□□□□□ -0.176e-14■■■■■ 44.5
AATFQ9NY61 RPS11-206ENST00000600027 944 ntTSL 514□□□□□ -0.176e-14■■■■■ 44.5
AATFQ9NY61 RPS11-207ENST00000601216 602 ntTSL 411.83□□□□□ -0.526e-14■■■■■ 44.5
AATFQ9NY61 RPS11-201ENST00000270625 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.576e-14■■■■■ 44.5
AATFQ9NY61 RPS11-209ENST00000602252 751 ntTSL 210.03□□□□□ -0.86e-14■■■■■ 44.5
AATFQ9NY61 RPS11-202ENST00000594493 575 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.956e-14■■■■■ 44.5
AATFQ9NY61 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.966e-14■■■■■ 44.5
AATFQ9NY61 RPS11-208ENST00000601306 547 ntTSL 39□□□□□ -0.976e-14■■■■■ 44.5
AATFQ9NY61 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.096e-14■■■■■ 44.5
AATFQ9NY61 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.87□□□□□ -1.636e-14■■■■■ 44.5
AATFQ9NY61 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 26e-8■■■■■ 44.5
AATFQ9NY61 SDF4-205ENST00000465727 2095 ntTSL 222.34■■□□□ 1.176e-8■■■■■ 44.5
AATFQ9NY61 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.156e-8■■■■■ 44.5
AATFQ9NY61 SDF4-203ENST00000403997 728 ntTSL 316.26■□□□□ 0.196e-8■■■■■ 44.5
AATFQ9NY61 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.885e-6■■■■■ 44.3
AATFQ9NY61 HDAC6-236ENST00000498808 566 ntTSL 519.26■□□□□ 0.672e-7■■■■■ 44.3
AATFQ9NY61 HDAC6-218ENST00000470942 668 ntTSL 319.14■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 44.3
AATFQ9NY61 HDAC6-220ENST00000477528 4832 ntTSL 1 (best)16.63■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 44.3
AATFQ9NY61 HDAC6-229ENST00000486665 598 ntTSL 215.37■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 44.3
AATFQ9NY61 HDAC6-201ENST00000334136 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 44.3
AATFQ9NY61 HDAC6-203ENST00000376619 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 44.3
AATFQ9NY61 HDAC6-228ENST00000486227 4718 ntTSL 212.56□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 44.3
AATFQ9NY61 HDAC6-223ENST00000480525 412 ntTSL 36.11□□□□□ -1.432e-7■■■■■ 44.3
AATFQ9NY61 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.462e-7■■■■■ 44.2
AATFQ9NY61 KLHDC4-207ENST00000562155 1757 ntTSL 523.83■■□□□ 1.42e-7■■■■■ 44.2
AATFQ9NY61 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.352e-7■■■■■ 44.2
AATFQ9NY61 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.342e-7■■■■■ 44.2
AATFQ9NY61 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.22e-7■■■■■ 44.2
AATFQ9NY61 KLHDC4-202ENST00000316853 1287 ntTSL 1 (best)22.1■■□□□ 1.132e-7■■■■■ 44.2
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