Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC16.81■□□□□ 0.281e-323■■■■■ 2362.2
AATFQ9NY61 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt13.43□□□□□ -0.261e-323■■■■■ 2362.2
AATFQ9NY61 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt13.19□□□□□ -0.31e-323■■■■■ 2362.2
AATFQ9NY61 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.083e-7■■■■■ 599.2
AATFQ9NY61 RN7SKP45-201ENST00000363509 304 ntBASIC11.26□□□□□ -0.611e-38■■■■■ 368.1
AATFQ9NY61 GET4-206ENST00000464468 676 ntTSL 321.3■■□□□ 15e-8■■■■■ 279.2
AATFQ9NY61 GAK-204ENST00000504435 4346 ntTSL 213.2□□□□□ -0.32e-12■■■■■ 255.2
AATFQ9NY61 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.818e-8■■■■■ 252.8
AATFQ9NY61 SUN1-222ENST00000457861 2975 ntTSL 218.03■□□□□ 0.488e-8■■■■■ 252.8
AATFQ9NY61 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.168e-8■■■■■ 252.8
AATFQ9NY61 MIR663AHG-223ENST00000601079 613 ntTSL 527.86■■■□□ 2.054e-29■■■■■ 248.2
AATFQ9NY61 MIR663AHG-236ENST00000610014 475 ntTSL 524.38■■□□□ 1.494e-29■■■■■ 248.2
AATFQ9NY61 MIR663AHG-217ENST00000598150 751 ntTSL 519.54■□□□□ 0.724e-29■■■■■ 248.2
AATFQ9NY61 MIR663AHG-221ENST00000600225 473 ntTSL 516.83■□□□□ 0.284e-29■■■■■ 248.2
AATFQ9NY61 MIR663AHG-224ENST00000601119 750 ntTSL 516.22■□□□□ 0.194e-29■■■■■ 248.2
AATFQ9NY61 MIR663AHG-226ENST00000601901 644 ntTSL 515.55■□□□□ 0.084e-29■■■■■ 248.2
AATFQ9NY61 MIR663AHG-204ENST00000594130 628 ntTSL 515.12■□□□□ 0.014e-29■■■■■ 248.2
AATFQ9NY61 MIR663AHG-234ENST00000609687 697 ntTSL 514.85□□□□□ -0.034e-29■■■■■ 248.2
AATFQ9NY61 MIR663AHG-208ENST00000596058 665 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.34e-29■■■■■ 248.2
AATFQ9NY61 MIR663AHG-230ENST00000609012 708 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.444e-29■■■■■ 248.2
AATFQ9NY61 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.974e-29■■■■■ 248.2
AATFQ9NY61 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.37e-30■■■■■ 233.7
AATFQ9NY61 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC8.48□□□□□ -1.052e-16■■■■■ 228.1
AATFQ9NY61 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.136e-29■■■■■ 227.2
AATFQ9NY61 MIR663AHG-222ENST00000600263 751 ntTSL 527.9■■■□□ 2.066e-29■■■■■ 227.2
AATFQ9NY61 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.066e-29■■■■■ 227.2
AATFQ9NY61 MIR663AHG-228ENST00000608487 486 ntTSL 527.9■■■□□ 2.066e-29■■■■■ 227.2
AATFQ9NY61 MIR663AHG-206ENST00000594150 693 ntTSL 526.8■■□□□ 1.886e-29■■■■■ 227.2
AATFQ9NY61 MIR663AHG-216ENST00000597979 568 ntTSL 525.81■■□□□ 1.726e-29■■■■■ 227.2
AATFQ9NY61 MIR663AHG-205ENST00000594135 654 ntTSL 520.98■□□□□ 0.956e-29■■■■■ 227.2
AATFQ9NY61 MIR663AHG-235ENST00000609914 644 ntTSL 520.98■□□□□ 0.956e-29■■■■■ 227.2
AATFQ9NY61 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.446e-29■■■■■ 227.2
AATFQ9NY61 MIR663AHG-215ENST00000597361 586 ntTSL 516.68■□□□□ 0.266e-29■■■■■ 227.2
AATFQ9NY61 MIR663AHG-219ENST00000598451 511 ntTSL 516.68■□□□□ 0.266e-29■■■■■ 227.2
AATFQ9NY61 MIR663AHG-202ENST00000432499 1129 ntTSL 54.13□□□□□ -1.756e-29■■■■■ 227.2
AATFQ9NY61 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.826e-29■■■■■ 227.2
AATFQ9NY61 RN7SKP90-201ENST00000363013 335 ntBASIC14.39□□□□□ -0.114e-27■■■■■ 219
AATFQ9NY61 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.994e-20■■■■■ 205.9
AATFQ9NY61 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.125e-20■■■■■ 198.1
AATFQ9NY61 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.95■□□□□ 0.36e-26■■■■■ 193.1
AATFQ9NY61 SNORD3D-202ENST00000630092 217 ntBASIC13.43□□□□□ -0.266e-26■■■■■ 193.1
AATFQ9NY61 SNORD3D-201ENST00000619178 218 ntBASIC13.19□□□□□ -0.36e-26■■■■■ 193.1
AATFQ9NY61 HFM1-204ENST00000448819 540 ntTSL 511.48□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 182.5
AATFQ9NY61 HFM1-208ENST00000488023 1699 ntTSL 53.56□□□□□ -1.841e-7■■■■■ 182.5
AATFQ9NY61 HFM1-207ENST00000481900 2020 ntTSL 52.89□□□□□ -1.951e-7■■■■■ 182.5
AATFQ9NY61 HFM1-202ENST00000427444 672 ntTSL 52.55□□□□□ -21e-7■■■■■ 182.5
AATFQ9NY61 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.151e-7■■■■■ 182.5
AATFQ9NY61 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.372e-7■■■■■ 181.2
AATFQ9NY61 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.862e-7■■■■■ 181.2
AATFQ9NY61 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 181.2
AATFQ9NY61 TXNRD2-215ENST00000494454 2004 ntTSL 1 (best)18.49■□□□□ 0.552e-7■■■■■ 181.2
AATFQ9NY61 TXNRD2-210ENST00000475995 751 ntTSL 518.18■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 181.2
AATFQ9NY61 TXNRD2-221ENST00000635155 858 ntTSL 516.88■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 181.2
AATFQ9NY61 RN7SKP79-201ENST00000363373 336 ntBASIC11.58□□□□□ -0.563e-8■■■■■ 173
AATFQ9NY61 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.782e-7■■■■■ 162
AATFQ9NY61 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 162
AATFQ9NY61 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 162
AATFQ9NY61 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.014e-7■■■■■ 160.6
AATFQ9NY61 ERICH1-202ENST00000518277 788 ntTSL 219.97■□□□□ 0.794e-7■■■■■ 160.6
AATFQ9NY61 ERICH1-211ENST00000524138 682 ntTSL 319.45■□□□□ 0.74e-7■■■■■ 160.6
AATFQ9NY61 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.224e-7■■■■■ 160.6
AATFQ9NY61 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.612e-7■■■■■ 157.2
AATFQ9NY61 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.422e-7■■■■■ 157.2
AATFQ9NY61 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.952e-7■■■■■ 157.2
AATFQ9NY61 TXNRD2-209ENST00000474308 1854 ntTSL 223.21■■□□□ 1.312e-7■■■■■ 157.2
AATFQ9NY61 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.092e-7■■■■■ 157.2
AATFQ9NY61 TF-212ENST00000493011 999 ntTSL 222.82■■□□□ 1.241e-12■■■■■ 155.5
AATFQ9NY61 TF-202ENST00000414694 546 ntTSL 422.82■■□□□ 1.241e-12■■■■■ 155.5
AATFQ9NY61 TF-213ENST00000494430 594 ntTSL 422.82■■□□□ 1.241e-12■■■■■ 155.5
AATFQ9NY61 TF-203ENST00000460531 577 ntTSL 422.82■■□□□ 1.241e-12■■■■■ 155.5
AATFQ9NY61 TF-211ENST00000485977 580 ntTSL 322.82■■□□□ 1.241e-12■■■■■ 155.5
AATFQ9NY61 TF-210ENST00000482271 659 ntTSL 422.82■■□□□ 1.241e-12■■■■■ 155.5
AATFQ9NY61 TF-208ENST00000474287 645 ntTSL 221.51■■□□□ 1.031e-12■■■■■ 155.5
AATFQ9NY61 TF-206ENST00000466911 526 ntTSL 419.47■□□□□ 0.711e-12■■■■■ 155.5
AATFQ9NY61 TF-201ENST00000402696 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.151e-12■■■■■ 155.5
AATFQ9NY61 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC8.54□□□□□ -1.041e-12■■■■■ 155.5
AATFQ9NY61 RN7SKP297-201ENST00000411270 282 ntBASIC13.84□□□□□ -0.191e-16■■■■■ 155.1
AATFQ9NY61 TF-209ENST00000475382 586 ntTSL 411.09□□□□□ -0.631e-16■■■■■ 155.1
AATFQ9NY61 TF-214ENST00000498622 719 ntTSL 210.08□□□□□ -0.81e-16■■■■■ 155.1
AATFQ9NY61 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.02□□□□□ -2.096e-51■■■■■ 152.9
AATFQ9NY61 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.852e-7■■■■■ 143.7
AATFQ9NY61 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.352e-7■■■■■ 143.7
AATFQ9NY61 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.612e-7■■■■■ 143.7
AATFQ9NY61 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.82e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.422e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-213ENST00000471793 1779 ntTSL 222.49■■□□□ 1.192e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-201ENST00000331340 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-210ENST00000439701 3572 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-212ENST00000462201 1122 ntTSL 310.4□□□□□ -0.742e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-216ENST00000492782 711 ntTSL 27.84□□□□□ -1.152e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-208ENST00000426121 201 ntTSL 1 (best)7.02□□□□□ -1.292e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 ADARB1-207ENST00000460734 2523 ntTSL 1 (best)29.05■■■□□ 2.243e-16■■■■■ 142.7
Retrieved 100 of 5,565 protein–RNA pairs in 55.2 ms