RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409457.5

AGAP1-204, Transcript of ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AGAP1, Length 2,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1-204ENST00000409457 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.65■■■■■ 8.1
AGAP1-204ENST00000409457 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.24■■■■■ 6.75
AGAP1-204ENST00000409457 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.19■■■■■ 6.43
AGAP1-204ENST00000409457 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.33■■■■■ 6.29
AGAP1-204ENST00000409457 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54■■■■■ 6.23
AGAP1-204ENST00000409457 ABCC9O60706 1549 aa53.84■■■■■ 6.21
AGAP1-204ENST00000409457 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.62■■■■■ 6.17
AGAP1-204ENST00000409457 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.55■■■■■ 6.16
AGAP1-204ENST00000409457 NACADO15069 1562 aa53.23■■■■■ 6.11
AGAP1-204ENST00000409457 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.72■■■■■ 6.03
AGAP1-204ENST00000409457 SCRIBQ14160 1630 aa52.58■■■■■ 6.01
AGAP1-204ENST00000409457 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.76■■■■■ 5.88
AGAP1-204ENST00000409457 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.59■■■■■ 5.85
AGAP1-204ENST00000409457 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.15■■■■■ 5.78
AGAP1-204ENST00000409457 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.97■■■■■ 5.75
AGAP1-204ENST00000409457 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.96■■■■■ 5.75
AGAP1-204ENST00000409457 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.77■■■■■ 5.72
AGAP1-204ENST00000409457 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.71■■■■■ 5.71
AGAP1-204ENST00000409457 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.68■■■■■ 5.7
AGAP1-204ENST00000409457 SMARCA4P51532 1647 aa50.45■■■■■ 5.67
AGAP1-204ENST00000409457 WIZO95785 1651 aa50.33■■■■■ 5.65
AGAP1-204ENST00000409457 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.85■■■■■ 5.57
AGAP1-204ENST00000409457 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.81■■■■■ 5.57
AGAP1-204ENST00000409457 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.57■■■■■ 5.53
AGAP1-204ENST00000409457 SMARCA2P51531 1590 aa49.54■■■■■ 5.52
AGAP1-204ENST00000409457 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.54■■■■■ 5.52
AGAP1-204ENST00000409457 CHIC1Q5VXU3 224 aa49.53■■■■■ 5.52
AGAP1-204ENST00000409457 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.27■■■■■ 5.48
AGAP1-204ENST00000409457 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.26■■■■■ 5.48
AGAP1-204ENST00000409457 NCAPD3P42695 1498 aa49.1■■■■■ 5.45
AGAP1-204ENST00000409457 HMGXB3Q12766 1538 aa49.07■■■■■ 5.45
AGAP1-204ENST00000409457 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.8■■■■■ 5.4
AGAP1-204ENST00000409457 TRIM41Q8WV44 630 aa48.52■■■■■ 5.36
AGAP1-204ENST00000409457 ABCC8Q09428 1581 aa48.29■■■■■ 5.32
AGAP1-204ENST00000409457 CFTRP13569 1480 aa48.06■■■■■ 5.28
AGAP1-204ENST00000409457 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.96■■■■■ 5.27
AGAP1-204ENST00000409457 PRDM2Q13029 1718 aa47.94■■■■■ 5.27
AGAP1-204ENST00000409457 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.82■■■■■ 5.25
AGAP1-204ENST00000409457 SYNJ1O43426 1573 aa47.79■■■■■ 5.24
AGAP1-204ENST00000409457 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa47.61■■■■■ 5.21
AGAP1-204ENST00000409457 TOP2BQ02880 1626 aa47.6■■■■■ 5.21
AGAP1-204ENST00000409457 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.59■■■■■ 5.21
AGAP1-204ENST00000409457 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.59■■■■■ 5.21
AGAP1-204ENST00000409457 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.43■■■■■ 5.18
AGAP1-204ENST00000409457 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.42■■■■■ 5.18
AGAP1-204ENST00000409457 CUX1P39880 1505 aa47.41■■■■■ 5.18
AGAP1-204ENST00000409457 SOGA1O94964 1423 aa47.39■■■■■ 5.18
AGAP1-204ENST00000409457 EEA1Q15075 1411 aa47.39■■■■■ 5.18
AGAP1-204ENST00000409457 NESP48681 1621 aa47.35■■■■■ 5.17
AGAP1-204ENST00000409457 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.3■■■■■ 5.16
AGAP1-204ENST00000409457 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.22■■■■■ 5.15
AGAP1-204ENST00000409457 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.05■■■■■ 5.12
AGAP1-204ENST00000409457 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.01■■■■■ 5.12
AGAP1-204ENST00000409457 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.99■■■■■ 5.11
AGAP1-204ENST00000409457 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.96■■■■■ 5.11
AGAP1-204ENST00000409457 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.87■■■■■ 5.09
AGAP1-204ENST00000409457 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.85■■■■■ 5.09
AGAP1-204ENST00000409457 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.85■■■■■ 5.09
AGAP1-204ENST00000409457 TOPBP1Q92547 1522 aa46.83■■■■■ 5.09
AGAP1-204ENST00000409457 KIF21BO75037 1637 aa46.8■■■■■ 5.08
AGAP1-204ENST00000409457 KIF27Q86VH2 1401 aa46.73■■■■■ 5.07
AGAP1-204ENST00000409457 GOLGA3Q08378 1498 aa46.72■■■■■ 5.07
AGAP1-204ENST00000409457 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.72■■■■■ 5.07
AGAP1-204ENST00000409457 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.61■■■■■ 5.05
AGAP1-204ENST00000409457 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.61■■■■■ 5.05
AGAP1-204ENST00000409457 CUX2O14529 1486 aa46.56■■■■■ 5.04
AGAP1-204ENST00000409457 PRXQ9BXM0 1461 aa46.48■■■■■ 5.03
AGAP1-204ENST00000409457 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.47■■■■■ 5.03
AGAP1-204ENST00000409457 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.45■■■■■ 5.03
AGAP1-204ENST00000409457 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.44■■■■■ 5.02
AGAP1-204ENST00000409457 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.43■■■■■ 5.02
AGAP1-204ENST00000409457 UBTFP17480 764 aaKnown RBP46.43■■■■■ 5.02
AGAP1-204ENST00000409457 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.41■■■■■ 5.02
AGAP1-204ENST00000409457 WDR97A6NE52 1622 aa46.37■■■■■ 5.01
AGAP1-204ENST00000409457 CEP162Q5TB80 1403 aa46.35■■■■■ 5.01
AGAP1-204ENST00000409457 IGF1RP08069 1367 aa46.29■■■■■ 5
AGAP1-204ENST00000409457 WDR62O43379 1518 aa46.19■■■■■ 4.98
AGAP1-204ENST00000409457 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.16■■■■■ 4.98
AGAP1-204ENST00000409457 ERCC6Q03468 1493 aa46.14■■■■■ 4.98
AGAP1-204ENST00000409457 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.11■■■■■ 4.97
AGAP1-204ENST00000409457 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.06■■■■■ 4.96
AGAP1-204ENST00000409457 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.03■■■■■ 4.96
AGAP1-204ENST00000409457 CUL7Q14999 1698 aa46■■■■■ 4.95
AGAP1-204ENST00000409457 CLIP1P30622 1438 aa45.96■■■■■ 4.95
AGAP1-204ENST00000409457 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.94■■■■■ 4.95
AGAP1-204ENST00000409457 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.94■■■■■ 4.94
AGAP1-204ENST00000409457 IFT140Q96RY7 1462 aa45.87■■■■■ 4.93
AGAP1-204ENST00000409457 PBRM1Q86U86 1689 aa45.76■■■■■ 4.92
AGAP1-204ENST00000409457 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.64■■■■■ 4.97e-6■■□□□ 12.2
AGAP1-204ENST00000409457 VPS8Q8N3P4 1428 aa45.59■■■■■ 4.89
AGAP1-204ENST00000409457 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.59■■■■■ 4.89
AGAP1-204ENST00000409457 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP45.59■■■■■ 4.89
AGAP1-204ENST00000409457 PCGF6Q9BYE7 350 aa45.57■■■■■ 4.88
AGAP1-204ENST00000409457 GRIN2BQ13224 1484 aa45.56■■■■■ 4.88
AGAP1-204ENST00000409457 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP45.56■■■■■ 4.88
AGAP1-204ENST00000409457 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.54■■■■■ 4.88
AGAP1-204ENST00000409457 ARAP1Q96P48 1450 aa45.52■■■■■ 4.88
AGAP1-204ENST00000409457 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.49■■■■■ 4.87
AGAP1-204ENST00000409457 ADAMTS12P58397 1594 aa45.48■■■■■ 4.87
AGAP1-204ENST00000409457 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa45.47■■■■■ 4.87
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