Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.232e-7■■■■■ 47.7
RPS3P23396 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 47.7
RPS3P23396 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 47.7
RPS3P23396 GPX3-203ENST00000519214 834 ntTSL 513.65□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 47.7
RPS3P23396 GPX3-207ENST00000521650 467 ntTSL 212.73□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 47.7
RPS3P23396 GPX3-208ENST00000521722 464 ntTSL 312.48□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 47.7
RPS3P23396 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 47.7
RPS3P23396 EMC4-204ENST00000557941 1201 ntTSL 215.71■□□□□ 0.114e-10■■■■■ 47.6
RPS3P23396 EMC4-210ENST00000560911 579 ntTSL 215.06■□□□□ 04e-10■■■■■ 47.6
RPS3P23396 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.184e-10■■■■■ 47.6
RPS3P23396 EMC4-213ENST00000561372 466 ntTSL 312.96□□□□□ -0.334e-10■■■■■ 47.6
RPS3P23396 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.494e-10■■■■■ 47.6
RPS3P23396 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.042e-17■■■■■ 47.5
RPS3P23396 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 47.5
RPS3P23396 NDUFS8-204ENST00000524810 616 ntTSL 215.1■□□□□ 0.013e-19■■■■■ 47.4
RPS3P23396 SSR2-204ENST00000467041 577 ntTSL 321.88■■□□□ 1.091e-13■■■■■ 47.2
RPS3P23396 RAB11A-205ENST00000566233 588 ntTSL 411.52□□□□□ -0.579e-8■■■■■ 47.1
RPS3P23396 RAB11A-204ENST00000565075 711 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.619e-8■■■■■ 47.1
RPS3P23396 RAB11A-203ENST00000564910 978 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.739e-8■■■■■ 47.1
RPS3P23396 RAB11A-209ENST00000569896 1396 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.159e-8■■■■■ 47.1
RPS3P23396 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.29e-8■■■■■ 47.1
RPS3P23396 RAB11A-206ENST00000567671 635 ntTSL 37.26□□□□□ -1.259e-8■■■■■ 47.1
RPS3P23396 RAB11A-208ENST00000569304 347 ntTSL 31.03□□□□□ -2.249e-8■■■■■ 47.1
RPS3P23396 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.911e-11■■■■■ 47
RPS3P23396 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.131e-11■■■■■ 47
RPS3P23396 APOC3-201ENST00000227667 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.751e-11■■■■■ 47
RPS3P23396 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.336e-9■■■■■ 47
RPS3P23396 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.336e-9■■■■■ 47
RPS3P23396 LDHA-207ENST00000460405 680 ntTSL 39.77□□□□□ -0.851e-12■■■■■ 47
RPS3P23396 PRDX1-204ENST00000424390 795 ntTSL 213.51□□□□□ -0.254e-13■■■■■ 46.9
RPS3P23396 PRDX1-205ENST00000447184 606 ntTSL 57.95□□□□□ -1.144e-13■■■■■ 46.9
RPS3P23396 COPB1-207ENST00000529866 729 ntTSL 29.77□□□□□ -0.857e-8■■■■■ 46.8
RPS3P23396 COPB1-212ENST00000534771 576 ntTSL 4-1.04□□□□□ -2.587e-8■■■■■ 46.8
RPS3P23396 LDHAP7-201ENST00000398295 965 ntBASIC9.26□□□□□ -0.931e-13■■■■■ 46.8
RPS3P23396 NPM3-202ENST00000462391 481 ntTSL 320.6■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 46.8
RPS3P23396 NPM3-204ENST00000474993 755 ntTSL 220.33■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 46.8
RPS3P23396 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 46.8
RPS3P23396 SNRPG-208ENST00000482975 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 46.8
RPS3P23396 SNRPG-204ENST00000438261 515 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.943e-6■■■■■ 46.8
RPS3P23396 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.273e-6■■■■■ 46.8
RPS3P23396 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.293e-6■■■■■ 46.8
RPS3P23396 MRPS30-204ENST00000515647 733 ntTSL 36.12□□□□□ -1.439e-11■■■■■ 46.8
RPS3P23396 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.693e-7■■■■■ 46.4
RPS3P23396 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.323e-7■■■■■ 46.4
RPS3P23396 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.033e-7■■■■■ 46.4
RPS3P23396 NDUFB5-212ENST00000491054 1014 ntTSL 21.11□□□□□ -2.231e-8■■■■■ 46.2
RPS3P23396 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.395e-8■■■■■ 46.1
RPS3P23396 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.265e-8■■■■■ 46.1
RPS3P23396 APOC3-204ENST00000470144 269 ntTSL 512.55□□□□□ -0.42e-11■■■■■ 46.1
RPS3P23396 APOC3-203ENST00000433777 359 ntTSL 59.51□□□□□ -0.892e-11■■■■■ 46.1
RPS3P23396 NDUFA4-205ENST00000486007 434 ntTSL 24.99□□□□□ -1.618e-10■■■■■ 46
RPS3P23396 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.187e-7■■■■■ 46
RPS3P23396 VPS25-203ENST00000589520 639 ntTSL 310.37□□□□□ -0.757e-7■■■■■ 46
RPS3P23396 VPS25-206ENST00000591584 667 ntTSL 210.37□□□□□ -0.754e-10■■■■■ 46
RPS3P23396 VPS25-202ENST00000589219 914 ntTSL 29.88□□□□□ -0.834e-10■■■■■ 46
RPS3P23396 VPS25-205ENST00000590339 668 ntTSL 29.34□□□□□ -0.911e-7■■■■■ 46
RPS3P23396 VPS25-204ENST00000589577 603 ntTSL 55.59□□□□□ -1.512e-7■■■■■ 46
RPS3P23396 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.264e-8■■■■■ 45.8
RPS3P23396 TRAPPC4-208ENST00000527680 569 ntTSL 221.42■■□□□ 1.022e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 TRAPPC4-210ENST00000531290 1135 ntTSL 221.4■■□□□ 1.022e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 TRAPPC4-203ENST00000447216 980 ntTSL 217.74■□□□□ 0.432e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.42e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.192e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.152e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.132e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.082e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.042e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.012e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.092e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 BAG6-259ENST00000464869 488 ntTSL 214.43□□□□□ -0.12e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.292e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 TSFM-204ENST00000454289 2192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.332e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 TSFM-206ENST00000497617 770 ntTSL 312.88□□□□□ -0.352e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.352e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.392e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 TRAPPC4-205ENST00000525079 768 ntTSL 312.44□□□□□ -0.422e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 TRAPPC4-209ENST00000528230 583 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 TRAPPC4-211ENST00000533012 817 ntTSL 211.05□□□□□ -0.642e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 TRAPPC4-201ENST00000359005 849 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.72e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 TSFM-209ENST00000548851 794 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.852e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 AC005833.3-201ENST00000543979 864 ntTSL 29.19□□□□□ -0.942e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 TRAPPC4-206ENST00000525303 654 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.962e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 NDUFA9-201ENST00000266544 8363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.072e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.342e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 ATP6V1B2-206ENST00000523482 6907 ntTSL 25.92□□□□□ -1.462e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 NDUFA9-208ENST00000544675 857 ntTSL 45.35□□□□□ -1.552e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 CTNNA3-204ENST00000494580 470 ntTSL 34.89□□□□□ -1.632e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 UGT2A3-202ENST00000503012 1645 ntTSL 24.79□□□□□ -1.642e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.682e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.72e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 SYPL1-203ENST00000460770 545 ntTSL 1 (best)0.89□□□□□ -2.272e-8■■■■■ 45.7
RPS3P23396 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.88e-8■■■■■ 45.6
RPS3P23396 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.678e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 CRMP1-203ENST00000506216 1876 ntTSL 524.85■■□□□ 1.578e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.354e-9■■■■■ 45.6
RPS3P23396 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.194e-9■■■■■ 45.6
RPS3P23396 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.128e-7■■■■■ 45.6
RPS3P23396 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.14e-9■■■■■ 45.6
RPS3P23396 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.988e-7■■■■■ 45.6
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