Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 GDAP1-204ENST00000521096 806 ntTSL 311.55□□□□□ -0.564e-115■■■■■ 753.4
RPS3P23396 GDAP1-203ENST00000520797 735 ntTSL 37.85□□□□□ -1.154e-115■■■■■ 753.4
RPS3P23396 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)21.48■■□□□ 1.037e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 218.82■□□□□ 0.67e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 217.98■□□□□ 0.477e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.437e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.077e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.397e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.817e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 38.91□□□□□ -0.987e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 58.91□□□□□ -0.987e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 37.9□□□□□ -1.147e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 41.57□□□□□ -2.167e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 5-0.04□□□□□ -2.427e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 5-0.16□□□□□ -2.447e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.477e-64■■■■■ 337.8
RPS3P23396 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.432e-8■■■■■ 200
RPS3P23396 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 192.4
RPS3P23396 TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 840 ntTSL 315.46■□□□□ 0.072e-15■■■■■ 159.5
RPS3P23396 PNPLA4-201ENST00000381042 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.661e-14■■■■■ 129.1
RPS3P23396 PNPLA4-202ENST00000442940 652 ntTSL 29.11□□□□□ -0.951e-14■■■■■ 129.1
RPS3P23396 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.461e-14■■■■■ 129.1
RPS3P23396 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.551e-14■■■■■ 129.1
RPS3P23396 RPSA-208ENST00000487876 572 ntTSL 412.51□□□□□ -0.414e-18■■■■■ 121.3
RPS3P23396 RPSA-204ENST00000458478 874 ntTSL 210.78□□□□□ -0.684e-18■■■■■ 121.3
RPS3P23396 RPSA-201ENST00000301821 1171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.864e-18■■■■■ 121.3
RPS3P23396 RPSA-206ENST00000477325 596 ntTSL 28.77□□□□□ -1.014e-18■■■■■ 121.3
RPS3P23396 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.264e-18■■■■■ 121.3
RPS3P23396 RPSA-205ENST00000475346 622 ntTSL 1 (best)2.9□□□□□ -1.954e-18■■■■■ 121.3
RPS3P23396 DAD1-202ENST00000489532 339 ntTSL 31.92□□□□□ -2.12e-17■■■■■ 116.3
RPS3P23396 AHCYL1-204ENST00000469401 575 ntTSL 29.08□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 106.8
RPS3P23396 AHCYL1-206ENST00000481423 732 ntTSL 31.93□□□□□ -2.11e-7■■■■■ 106.8
RPS3P23396 HIST1H4C-201ENST00000377803 435 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.555e-40■■■■■ 98.6
RPS3P23396 IL12RB1-204ENST00000594176 557 ntTSL 414.65□□□□□ -0.061e-27■■■■■ 96.1
RPS3P23396 IL12RB1-206ENST00000598019 595 ntTSL 413.49□□□□□ -0.251e-27■■■■■ 96.1
RPS3P23396 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.291e-27■■■■■ 96.1
RPS3P23396 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.021e-13■■■■■ 91.2
RPS3P23396 CA9-203ENST00000493245 697 ntTSL 510.24□□□□□ -0.772e-17■■■■■ 90.5
RPS3P23396 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.881e-12■■■■■ 84.1
RPS3P23396 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.073e-37■■■■■ 82.4
RPS3P23396 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.023e-37■■■■■ 82.4
RPS3P23396 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.853e-37■■■■■ 82.4
RPS3P23396 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.714e-12■■■■■ 81.1
RPS3P23396 GALNT16-203ENST00000553471 5548 ntTSL 515.31■□□□□ 0.044e-12■■■■■ 81.1
RPS3P23396 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.034e-12■■■■■ 81.1
RPS3P23396 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.164e-12■■■■■ 81.1
RPS3P23396 THSD4-204ENST00000567745 1218 ntTSL 213.85□□□□□ -0.194e-12■■■■■ 81.1
RPS3P23396 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.214e-12■■■■■ 81.1
RPS3P23396 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.254e-12■■■■■ 81.1
RPS3P23396 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.344e-12■■■■■ 81.1
RPS3P23396 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.414e-12■■■■■ 81.1
RPS3P23396 THSD4-203ENST00000357769 3403 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.924e-12■■■■■ 81.1
RPS3P23396 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.043e-37■■■■■ 79.3
RPS3P23396 TBL3-204ENST00000567615 1047 ntTSL 216.26■□□□□ 0.192e-20■■■■■ 78.1
RPS3P23396 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.321e-323■■■■■ 77
RPS3P23396 UCP2-204ENST00000539764 464 ntTSL 33.92□□□□□ -1.785e-13■■■■■ 75.9
RPS3P23396 POLR2L-202ENST00000534030 585 ntTSL 418.58■□□□□ 0.568e-13■■■■■ 74.5
RPS3P23396 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.298e-13■■■■■ 74.5
RPS3P23396 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.024e-7■■■■■ 73.4
RPS3P23396 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.152e-10■■■■■ 73.1
RPS3P23396 NDUFB9-203ENST00000517830 320 ntTSL 39□□□□□ -0.972e-9■■■■■ 71.9
RPS3P23396 PEPD-206ENST00000589598 596 ntTSL 39.27□□□□□ -0.932e-13■■■■■ 71.8
RPS3P23396 PIH1D1-223ENST00000602076 474 ntTSL 216.73■□□□□ 0.277e-8■■■■■ 70.9
RPS3P23396 MRPS9-203ENST00000472220 982 ntTSL 216.06■□□□□ 0.161e-10■■■■■ 70.8
RPS3P23396 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.251e-10■■■■■ 70.8
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RPS3P23396 MT1G-204ENST00000569500 305 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.524e-10■■■■■ 70.8
RPS3P23396 MT1G-201ENST00000379811 405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.744e-10■■■■■ 70.8
RPS3P23396 MRPS9-202ENST00000413583 652 ntTSL 39.05□□□□□ -0.961e-10■■■■■ 70.8
RPS3P23396 MT1G-202ENST00000444837 406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.074e-10■■■■■ 70.8
RPS3P23396 SLC31A1-201ENST00000374212 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.091e-10■■■■■ 70.8
RPS3P23396 MRPS30-203ENST00000508129 560 ntTSL 21.52□□□□□ -2.171e-10■■■■■ 70.8
RPS3P23396 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.124e-15■■■■■ 70.3
RPS3P23396 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.424e-15■■■■■ 70.3
RPS3P23396 DAD1-204ENST00000538631 441 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.924e-15■■■■■ 70.3
RPS3P23396 DAD1-203ENST00000535847 591 ntTSL 28.79□□□□□ -14e-15■■■■■ 70.3
RPS3P23396 SOX5-215ENST00000545921 2589 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.875e-10■■■■■ 68.3
RPS3P23396 SOX5-212ENST00000541536 2365 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.895e-10■■■■■ 68.3
RPS3P23396 SOX5-209ENST00000536911 855 ntTSL 39.13□□□□□ -0.955e-10■■■■■ 68.3
RPS3P23396 SOX5-210ENST00000537393 2769 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -15e-10■■■■■ 68.3
RPS3P23396 SOX5-206ENST00000535530 576 ntTSL 48.67□□□□□ -1.025e-10■■■■■ 68.3
RPS3P23396 SOX5-207ENST00000536629 570 ntTSL 48.11□□□□□ -1.115e-10■■■■■ 68.3
RPS3P23396 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.135e-10■■■■■ 68.3
RPS3P23396 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.375e-10■■■■■ 68.3
RPS3P23396 SOX5-201ENST00000367206 1816 ntTSL 26.5□□□□□ -1.375e-10■■■■■ 68.3
RPS3P23396 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.535e-10■■■■■ 68.3
RPS3P23396 RPL9-209ENST00000511075 1028 ntTSL 24.94□□□□□ -1.623e-7■■■■■ 67.1
RPS3P23396 RPL9-202ENST00000437992 579 ntTSL 43.11□□□□□ -1.913e-7■■■■■ 67.1
RPS3P23396 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.085e-9■■■■■ 66.8
RPS3P23396 ERO1A-207ENST00000556223 567 ntTSL 415.73■□□□□ 0.116e-10■■■■■ 66.6
RPS3P23396 ERO1A-204ENST00000554251 555 ntTSL 515.73■□□□□ 0.116e-10■■■■■ 66.6
RPS3P23396 SRRT-204ENST00000448764 1607 ntTSL 516.86■□□□□ 0.298e-10■■■■■ 65.9
RPS3P23396 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.088e-10■■■■■ 65.9
RPS3P23396 SRRT-210ENST00000477529 540 ntTSL 213.72□□□□□ -0.218e-10■■■■■ 65.9
RPS3P23396 SRRT-213ENST00000611405 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.528e-10■■■■■ 65.9
RPS3P23396 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.68e-10■■■■■ 65.9
RPS3P23396 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.68e-10■■■■■ 65.9
RPS3P23396 SRRT-211ENST00000478693 655 ntTSL 211.16□□□□□ -0.628e-10■■■■■ 65.9
RPS3P23396 NBAS-208ENST00000442506 4391 ntTSL 1 (best)10.63□□□□□ -0.718e-10■■■■■ 65.9
RPS3P23396 SRRT-203ENST00000445337 446 ntTSL 36.21□□□□□ -1.428e-10■■■■■ 65.9
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