RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589871.1

RBM42-205, Transcript of RNA binding motif protein 42, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RBM42, Length 1,487 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42-205ENST00000589871 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.59■■■■■ 6.97
RBM42-205ENST00000589871 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.16■■■■■ 5.94
RBM42-205ENST00000589871 ABCC9O60706 1549 aa51.08■■■■■ 5.77
RBM42-205ENST00000589871 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.13■■■■■ 5.46
RBM42-205ENST00000589871 NACADO15069 1562 aa49.05■■■■■ 5.44
RBM42-205ENST00000589871 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.02■■■■■ 5.44
RBM42-205ENST00000589871 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.78■■■■■ 5.4
RBM42-205ENST00000589871 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.72■■■■■ 5.39
RBM42-205ENST00000589871 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.48■■■■■ 5.35
RBM42-205ENST00000589871 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.03■■■■■ 5.28
RBM42-205ENST00000589871 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.72■■■■■ 5.23
RBM42-205ENST00000589871 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.62■■■■■ 5.21
RBM42-205ENST00000589871 SCRIBQ14160 1630 aa47.56■■■■■ 5.2
RBM42-205ENST00000589871 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.13■■■■■ 5.13
RBM42-205ENST00000589871 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.94■■■■■ 5.1
RBM42-205ENST00000589871 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.38■■■■■ 5.02
RBM42-205ENST00000589871 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.22■■■■■ 4.99
RBM42-205ENST00000589871 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.92■■■■■ 4.94
RBM42-205ENST00000589871 SMARCA4P51532 1647 aa45.49■■■■■ 4.87
RBM42-205ENST00000589871 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.44■■■■■ 4.86
RBM42-205ENST00000589871 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.25■■■■■ 4.83
RBM42-205ENST00000589871 NCAPD3P42695 1498 aa45.24■■■■■ 4.83
RBM42-205ENST00000589871 SMARCA2P51531 1590 aa45.22■■■■■ 4.83
RBM42-205ENST00000589871 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.14■■■■■ 4.82
RBM42-205ENST00000589871 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.04■■■■■ 4.8
RBM42-205ENST00000589871 HMGXB3Q12766 1538 aa45.02■■■■■ 4.8
RBM42-205ENST00000589871 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.89■■■■■ 4.78
RBM42-205ENST00000589871 WIZO95785 1651 aa44.68■■■■■ 4.74
RBM42-205ENST00000589871 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.6■■■■■ 4.73
RBM42-205ENST00000589871 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.19■■■■■ 4.66
RBM42-205ENST00000589871 NESP48681 1621 aa44.17■■■■■ 4.66
RBM42-205ENST00000589871 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.08■■■■■ 4.65
RBM42-205ENST00000589871 ERCC6Q03468 1493 aa44.07■■■■■ 4.65
RBM42-205ENST00000589871 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.92■■■■■ 4.62
RBM42-205ENST00000589871 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.79■■■■■ 4.6
RBM42-205ENST00000589871 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.68■■■■■ 4.58
RBM42-205ENST00000589871 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.66■■■■■ 4.58
RBM42-205ENST00000589871 CFTRP13569 1480 aa43.65■■■■■ 4.58
RBM42-205ENST00000589871 CUX2O14529 1486 aa43.61■■■■■ 4.57
RBM42-205ENST00000589871 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.54■■■■■ 4.56
RBM42-205ENST00000589871 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
RBM42-205ENST00000589871 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.43■■■■■ 4.54
RBM42-205ENST00000589871 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.39■■■■■ 4.54
RBM42-205ENST00000589871 PRDM2Q13029 1718 aa43.36■■■■■ 4.53
RBM42-205ENST00000589871 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.33■■■■■ 4.53
RBM42-205ENST00000589871 WDR62O43379 1518 aa43.2■■■■■ 4.51
RBM42-205ENST00000589871 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.98■■■■■ 4.47
RBM42-205ENST00000589871 ABCC8Q09428 1581 aa42.73■■■■■ 4.43
RBM42-205ENST00000589871 TOPBP1Q92547 1522 aa42.72■■■■■ 4.43
RBM42-205ENST00000589871 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.66■■■■■ 4.42
RBM42-205ENST00000589871 IFT140Q96RY7 1462 aa42.47■■■■■ 4.39
RBM42-205ENST00000589871 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.36■■■■■ 4.37
RBM42-205ENST00000589871 CUX1P39880 1505 aa42.36■■■■■ 4.37
RBM42-205ENST00000589871 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.35■■■■■ 4.37
RBM42-205ENST00000589871 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.27■■■■■ 4.36
RBM42-205ENST00000589871 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.26■■■■■ 4.36
RBM42-205ENST00000589871 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.24■■■■■ 4.35
RBM42-205ENST00000589871 SOGA1O94964 1423 aa42.18■■■■■ 4.34
RBM42-205ENST00000589871 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.16■■■■■ 4.34
RBM42-205ENST00000589871 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.33
RBM42-205ENST00000589871 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.07■■■■■ 4.33
RBM42-205ENST00000589871 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.04■■■■■ 4.322e-6■■■□□ 18.2
RBM42-205ENST00000589871 TOP2BQ02880 1626 aa41.99■■■■■ 4.31
RBM42-205ENST00000589871 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.99■■■■■ 4.31
RBM42-205ENST00000589871 SYNJ1O43426 1573 aa41.96■■■■■ 4.31
RBM42-205ENST00000589871 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
RBM42-205ENST00000589871 WDR97A6NE52 1622 aa41.94■■■■■ 4.3
RBM42-205ENST00000589871 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.82■■■■■ 4.29
RBM42-205ENST00000589871 OSCARQ8IYS5 282 aa41.81■■■■■ 4.28
RBM42-205ENST00000589871 GRIN2BQ13224 1484 aa41.7■■■■■ 4.27
RBM42-205ENST00000589871 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.7■■■■■ 4.27
RBM42-205ENST00000589871 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.67■■■■■ 4.26
RBM42-205ENST00000589871 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.65■■■■■ 4.26
RBM42-205ENST00000589871 PBRM1Q86U86 1689 aa41.63■■■■■ 4.25
RBM42-205ENST00000589871 CHD1O14646 1710 aa41.62■■■■■ 4.25
RBM42-205ENST00000589871 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
RBM42-205ENST00000589871 FBLN2P98095 1184 aa41.58■■■■■ 4.25
RBM42-205ENST00000589871 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.46■■■■■ 4.23
RBM42-205ENST00000589871 SYNJ2O15056 1496 aa41.44■■■■■ 4.22
RBM42-205ENST00000589871 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.34■■■■■ 4.21
RBM42-205ENST00000589871 ADAMTS12P58397 1594 aa41.27■■■■■ 4.2
RBM42-205ENST00000589871 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.21■■■■■ 4.19
RBM42-205ENST00000589871 KIF27Q86VH2 1401 aa41.21■■■■■ 4.19
RBM42-205ENST00000589871 GRIN2AQ12879 1464 aa41.16■■■■■ 4.18
RBM42-205ENST00000589871 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.14■■■■■ 4.18
RBM42-205ENST00000589871 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.13■■■■■ 4.18
RBM42-205ENST00000589871 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.13■■■■■ 4.18
RBM42-205ENST00000589871 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.13■■■■■ 4.18
RBM42-205ENST00000589871 ARHGEF11O15085 1522 aa41.11■■■■■ 4.17
RBM42-205ENST00000589871 TRIM41Q8WV44 630 aa41.04■■■■■ 4.16
RBM42-205ENST00000589871 IGF1RP08069 1367 aa41.03■■■■■ 4.16
RBM42-205ENST00000589871 NUP160Q12769 1436 aa40.98■■■■■ 4.15
RBM42-205ENST00000589871 CUL7Q14999 1698 aa40.96■■■■■ 4.15
RBM42-205ENST00000589871 CEP170Q5SW79 1584 aa40.96■■■■■ 4.15
RBM42-205ENST00000589871 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.8■■■■■ 4.12
RBM42-205ENST00000589871 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.77■■■■■ 4.12
RBM42-205ENST00000589871 ARAP1Q96P48 1450 aa40.77■■■■■ 4.12
RBM42-205ENST00000589871 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.75■■■■■ 4.11
RBM42-205ENST00000589871 SHROOM2Q13796 1616 aa40.69■■■■■ 4.1
RBM42-205ENST00000589871 JPH4Q96JJ6 628 aa40.58■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms