RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356135.9

CHKA-202, Transcript of choline kinase alpha, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHKA, Length 1,755 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKA-202ENST00000356135 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.15■■■■■ 6.58
CHKA-202ENST00000356135 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.24■■■■■ 5.47
CHKA-202ENST00000356135 ABCC9O60706 1549 aa47.43■■■■■ 5.18
CHKA-202ENST00000356135 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.98■■■■■ 5.11
CHKA-202ENST00000356135 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.78■■■■■ 5.08
CHKA-202ENST00000356135 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.35■■■■■ 5.01
CHKA-202ENST00000356135 NACADO15069 1562 aa46.09■■■■■ 4.97
CHKA-202ENST00000356135 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.09■■■■■ 4.97
CHKA-202ENST00000356135 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.89■■■■■ 4.94
CHKA-202ENST00000356135 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.36■■■■■ 4.85
CHKA-202ENST00000356135 SCRIBQ14160 1630 aa45.27■■■■■ 4.84
CHKA-202ENST00000356135 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.95■■■■■ 4.79
CHKA-202ENST00000356135 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.64■■■■■ 4.747e-8■□□□□ 9.5
CHKA-202ENST00000356135 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.57■■■■■ 4.73
CHKA-202ENST00000356135 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.76■■■■■ 4.6
CHKA-202ENST00000356135 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.38■■■■■ 4.54
CHKA-202ENST00000356135 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.38■■■■■ 4.54
CHKA-202ENST00000356135 SMARCA4P51532 1647 aa43.31■■■■■ 4.52
CHKA-202ENST00000356135 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.29■■■■■ 4.52
CHKA-202ENST00000356135 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
CHKA-202ENST00000356135 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
CHKA-202ENST00000356135 WIZO95785 1651 aa42.98■■■■■ 4.47
CHKA-202ENST00000356135 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.86■■■■■ 4.45
CHKA-202ENST00000356135 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.83■■■■■ 4.45
CHKA-202ENST00000356135 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.78■■■■■ 4.44
CHKA-202ENST00000356135 SMARCA2P51531 1590 aa42.72■■■■■ 4.43
CHKA-202ENST00000356135 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.65■■■■■ 4.42
CHKA-202ENST00000356135 NCAPD3P42695 1498 aa42.58■■■■■ 4.41
CHKA-202ENST00000356135 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
CHKA-202ENST00000356135 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
CHKA-202ENST00000356135 HMGXB3Q12766 1538 aa42.4■■■■■ 4.38
CHKA-202ENST00000356135 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.07■■■■■ 4.33
CHKA-202ENST00000356135 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.46■■■■■ 4.23
CHKA-202ENST00000356135 CFTRP13569 1480 aa41.42■■■■■ 4.22
CHKA-202ENST00000356135 NESP48681 1621 aa41.4■■■■■ 4.22
CHKA-202ENST00000356135 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.23■■■■■ 4.19
CHKA-202ENST00000356135 PRDM2Q13029 1718 aa41.06■■■■■ 4.16
CHKA-202ENST00000356135 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.99■■■■■ 4.15
CHKA-202ENST00000356135 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.97■■■■■ 4.15
CHKA-202ENST00000356135 ABCC8Q09428 1581 aa40.95■■■■■ 4.15
CHKA-202ENST00000356135 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.94■■■■■ 4.14
CHKA-202ENST00000356135 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.82■■■■■ 4.13
CHKA-202ENST00000356135 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.79■■■■■ 4.12
CHKA-202ENST00000356135 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.74■■■■■ 4.11
CHKA-202ENST00000356135 ERCC6Q03468 1493 aa40.7■■■■■ 4.11
CHKA-202ENST00000356135 TRIM41Q8WV44 630 aa40.68■■■■■ 4.1
CHKA-202ENST00000356135 SYNJ1O43426 1573 aa40.61■■■■■ 4.09
CHKA-202ENST00000356135 CUX1P39880 1505 aa40.6■■■■■ 4.09
CHKA-202ENST00000356135 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
CHKA-202ENST00000356135 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.48■■■■■ 4.07
CHKA-202ENST00000356135 TOP2BQ02880 1626 aa40.47■■■■■ 4.07
CHKA-202ENST00000356135 TOPBP1Q92547 1522 aa40.45■■■■■ 4.07
CHKA-202ENST00000356135 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.44■■■■■ 4.06
CHKA-202ENST00000356135 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.43■■■■■ 4.06
CHKA-202ENST00000356135 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
CHKA-202ENST00000356135 WDR62O43379 1518 aa40.29■■■■■ 4.04
CHKA-202ENST00000356135 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.28■■■■■ 4.04
CHKA-202ENST00000356135 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
CHKA-202ENST00000356135 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.12■■■■■ 4.01
CHKA-202ENST00000356135 SOGA1O94964 1423 aa40.09■■■■■ 4.01
CHKA-202ENST00000356135 CUX2O14529 1486 aa40.04■■■■■ 4
CHKA-202ENST00000356135 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.99■■■■□ 3.99
CHKA-202ENST00000356135 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.96■■■■□ 3.99
CHKA-202ENST00000356135 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.9■■■■□ 3.98
CHKA-202ENST00000356135 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.87■■■■□ 3.97
CHKA-202ENST00000356135 IFT140Q96RY7 1462 aa39.86■■■■□ 3.97
CHKA-202ENST00000356135 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
CHKA-202ENST00000356135 WDR97A6NE52 1622 aa39.79■■■■□ 3.96
CHKA-202ENST00000356135 KIF27Q86VH2 1401 aa39.77■■■■□ 3.96
CHKA-202ENST00000356135 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
CHKA-202ENST00000356135 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.68■■■■□ 3.945e-7■■■■□ 23.6
CHKA-202ENST00000356135 EEA1Q15075 1411 aa39.66■■■■□ 3.94
CHKA-202ENST00000356135 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.65■■■■□ 3.94
CHKA-202ENST00000356135 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.61■■■■□ 3.93
CHKA-202ENST00000356135 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.6■■■■□ 3.93
CHKA-202ENST00000356135 IGF1RP08069 1367 aa39.55■■■■□ 3.92
CHKA-202ENST00000356135 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.52■■■■□ 3.92
CHKA-202ENST00000356135 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.51■■■■□ 3.91
CHKA-202ENST00000356135 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.42■■■■□ 3.9
CHKA-202ENST00000356135 GRIN2BQ13224 1484 aa39.4■■■■□ 3.9
CHKA-202ENST00000356135 PBRM1Q86U86 1689 aa39.4■■■■□ 3.9
CHKA-202ENST00000356135 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.38■■■■□ 3.89
CHKA-202ENST00000356135 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.32■■■■□ 3.89
CHKA-202ENST00000356135 PRXQ9BXM0 1461 aa39.31■■■■□ 3.88
CHKA-202ENST00000356135 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.27■■■■□ 3.88
CHKA-202ENST00000356135 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.23■■■■□ 3.87
CHKA-202ENST00000356135 CUL7Q14999 1698 aa39.21■■■■□ 3.87
CHKA-202ENST00000356135 KIF21BO75037 1637 aa39.2■■■■□ 3.87
CHKA-202ENST00000356135 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.15■■■■□ 3.86
CHKA-202ENST00000356135 ADAMTS12P58397 1594 aa39.15■■■■□ 3.86
CHKA-202ENST00000356135 GOLGA3Q08378 1498 aa39.13■■■■□ 3.85
CHKA-202ENST00000356135 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.13■■■■□ 3.85
CHKA-202ENST00000356135 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.09■■■■□ 3.85
CHKA-202ENST00000356135 FBLN2P98095 1184 aa39.06■■■■□ 3.84
CHKA-202ENST00000356135 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.03■■■■□ 3.84
CHKA-202ENST00000356135 SYNJ2O15056 1496 aa39.01■■■■□ 3.84
CHKA-202ENST00000356135 GRIN2AQ12879 1464 aa38.93■■■■□ 3.82
CHKA-202ENST00000356135 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.87■■■■□ 3.81
CHKA-202ENST00000356135 CHD1O14646 1710 aa38.82■■■■□ 3.8
CHKA-202ENST00000356135 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.78■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms