Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.692e-9■■■■■ 75.6
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SUB1P53999 TXNDC17-209ENST00000576020 391 ntTSL 28.1□□□□□ -1.112e-9■■■■■ 75.6
SUB1P53999 TXNDC17-210ENST00000577146 518 ntTSL 22.53□□□□□ -22e-9■■■■■ 75.6
SUB1P53999 TXNDC17-203ENST00000571029 420 ntTSL 21.92□□□□□ -2.12e-9■■■■■ 75.6
SUB1P53999 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.383e-16■■■■■ 75.5
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SUB1P53999 PARP1-207ENST00000490921 3165 ntTSL 27.25□□□□□ -1.253e-16■■■■■ 75.5
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SUB1P53999 ABHD16A-204ENST00000468205 913 ntTSL 210.04□□□□□ -0.82e-39■■■■■ 74.9
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SUB1P53999 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.656e-14■■■■■ 74.5
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SUB1P53999 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.347e-10■■■■■ 74.4
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SUB1P53999 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.754e-7■■■■■ 74.1
SUB1P53999 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.784e-7■■■■■ 74.1
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SUB1P53999 SLC25A3-204ENST00000546766 3236 ntTSL 1 (best)8.32□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 74.1
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SUB1P53999 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.453e-8■■■■■ 71.9
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SUB1P53999 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.024e-7■■■■■ 71.4
SUB1P53999 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.24e-7■■■■■ 71.4
SUB1P53999 DLD-205ENST00000440410 1993 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.617e-8■■■■■ 71.3
SUB1P53999 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.776e-28■■■■■ 71.1
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SUB1P53999 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.049e-43■■■■■ 70.7
SUB1P53999 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.129e-43■■■■■ 70.7
SUB1P53999 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.269e-43■■■■■ 70.7
SUB1P53999 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.629e-43■■■■■ 70.7
SUB1P53999 ACTG1-215ENST00000576917 1958 ntTSL 511.16□□□□□ -0.629e-43■■■■■ 70.7
SUB1P53999 ACTG1-216ENST00000615544 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.829e-43■■■■■ 70.7
SUB1P53999 ACTG1-214ENST00000576544 1720 ntTSL 59.54□□□□□ -0.889e-43■■■■■ 70.7
SUB1P53999 ATP5A1-210ENST00000589869 910 ntTSL 310.62□□□□□ -0.719e-10■■■■■ 70.3
SUB1P53999 PGK1-203ENST00000476531 960 ntTSL 28.05□□□□□ -1.121e-20■■■■■ 70
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SUB1P53999 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.542e-10■■■■■ 69.7
SUB1P53999 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 12e-10■■■■■ 69.7
SUB1P53999 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.162e-10■■■■■ 69.7
SUB1P53999 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.332e-10■■■■■ 69.7
SUB1P53999 ACOT7-206ENST00000418124 1564 ntTSL 1 (best)12.64□□□□□ -0.392e-10■■■■■ 69.7
SUB1P53999 ACOT7-205ENST00000377860 1472 ntTSL 1 (best)12.5□□□□□ -0.412e-10■■■■■ 69.7
SUB1P53999 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.462e-10■■■■■ 69.7
SUB1P53999 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.562e-10■■■■■ 69.7
SUB1P53999 MMS19-204ENST00000415383 3401 ntTSL 1 (best)8.89□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 69.4
SUB1P53999 MMS19-201ENST00000327238 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 69.4
SUB1P53999 MMS19-209ENST00000438925 3797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 69.4
SUB1P53999 MMS19-203ENST00000370782 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.052e-6■■■■■ 69.4
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