Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.692e-9■■■■■ 75.6
SUB1P53999 TXNDC17-205ENST00000573792 505 ntTSL 38.22□□□□□ -1.092e-9■■■■■ 75.6
SUB1P53999 TXNDC17-209ENST00000576020 391 ntTSL 28.1□□□□□ -1.112e-9■■■■■ 75.6
SUB1P53999 TXNDC17-210ENST00000577146 518 ntTSL 22.53□□□□□ -22e-9■■■■■ 75.6
SUB1P53999 TXNDC17-203ENST00000571029 420 ntTSL 21.92□□□□□ -2.12e-9■■■■■ 75.6
SUB1P53999 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.383e-16■■■■■ 75.5
SUB1P53999 HSPA4L-201ENST00000296464 10790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.953e-16■■■■■ 75.5
SUB1P53999 PARP1-204ENST00000463968 830 ntTSL 28.67□□□□□ -1.023e-16■■■■■ 75.5
SUB1P53999 PARP1-207ENST00000490921 3165 ntTSL 27.25□□□□□ -1.253e-16■■■■■ 75.5
SUB1P53999 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.849e-8■■■■■ 75.2
SUB1P53999 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.56□□□□□ -21e-25■■■■■ 75.1
SUB1P53999 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.041e-25■■■■■ 75.1
SUB1P53999 ABHD16A-214ENST00000495769 1892 ntTSL 515.42■□□□□ 0.062e-39■■■■■ 74.9
SUB1P53999 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.392e-39■■■■■ 74.9
SUB1P53999 ABHD16A-207ENST00000475742 1319 ntTSL 511.97□□□□□ -0.492e-39■■■■■ 74.9
SUB1P53999 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.572e-39■■■■■ 74.9
SUB1P53999 ABHD16A-212ENST00000492084 2260 ntTSL 211.26□□□□□ -0.612e-39■■■■■ 74.9
SUB1P53999 ABHD16A-204ENST00000468205 913 ntTSL 210.04□□□□□ -0.82e-39■■■■■ 74.9
SUB1P53999 ENO1-202ENST00000464920 2266 ntTSL 1 (best)10.44□□□□□ -0.747e-28■■■■■ 74.9
SUB1P53999 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.656e-14■■■■■ 74.5
SUB1P53999 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.177e-10■■■■■ 74.4
SUB1P53999 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.347e-10■■■■■ 74.4
SUB1P53999 MTHFD1L-212ENST00000618312 3159 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.327e-10■■■■■ 74.4
SUB1P53999 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.054e-7■■■■■ 74.1
SUB1P53999 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.544e-7■■■■■ 74.1
SUB1P53999 SLC25A3-203ENST00000401722 6087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.754e-7■■■■■ 74.1
SUB1P53999 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.754e-7■■■■■ 74.1
SUB1P53999 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.784e-7■■■■■ 74.1
SUB1P53999 SLC25A3-214ENST00000551123 1417 ntTSL 1 (best)9.59□□□□□ -0.874e-7■■■■■ 74.1
SUB1P53999 SLC25A3-204ENST00000546766 3236 ntTSL 1 (best)8.32□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 74.1
SUB1P53999 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.739e-11■■■■■ 74
SUB1P53999 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.819e-11■■■■■ 74
SUB1P53999 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.317e-61■■■■■ 73.9
SUB1P53999 GPI-208ENST00000588991 2021 ntTSL 216.53■□□□□ 0.247e-61■■■■■ 73.9
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SUB1P53999 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.736e-14■■■■■ 73.3
SUB1P53999 RPL9-210ENST00000511643 618 ntTSL 23.79□□□□□ -1.82e-10■■■■■ 73.2
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SUB1P53999 COPS9-204ENST00000491765 619 ntTSL 28.11□□□□□ -1.111e-15■■■■■ 73.1
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SUB1P53999 YIPF4-203ENST00000441084 312 ntTSL 33.71□□□□□ -1.821e-15■■■■■ 73.1
SUB1P53999 YIPF4-202ENST00000437765 728 ntTSL 53.29□□□□□ -1.881e-15■■■■■ 73.1
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SUB1P53999 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.883e-16■■■■■ 72.7
SUB1P53999 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.913e-16■■■■■ 72.7
SUB1P53999 SKP1-212ENST00000523966 899 ntTSL 32.62□□□□□ -1.993e-16■■■■■ 72.7
SUB1P53999 SKP1-204ENST00000517691 2033 ntTSL 1 (best)2.11□□□□□ -2.073e-16■■■■■ 72.7
SUB1P53999 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.13e-16■■■■■ 72.7
SUB1P53999 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.632e-10■■■■■ 72.7
SUB1P53999 ADH5-210ENST00000512621 1475 ntTSL 29.8□□□□□ -0.842e-10■■■■■ 72.7
SUB1P53999 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.91e-10■■■■■ 72.6
SUB1P53999 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 12e-9■■■■■ 72.4
SUB1P53999 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.822e-9■■■■■ 72.4
SUB1P53999 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.752e-9■■■■■ 72.4
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SUB1P53999 H2AFV-203ENST00000349299 596 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.212e-9■■■■■ 72.4
SUB1P53999 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.612e-9■■■■■ 72.4
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SUB1P53999 METAP2-201ENST00000261220 1836 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.811e-11■■■■■ 72.1
SUB1P53999 METAP2-210ENST00000551840 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.11e-11■■■■■ 72.1
SUB1P53999 METAP2-202ENST00000323666 3601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.211e-11■■■■■ 72.1
SUB1P53999 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.083e-8■■■■■ 71.9
SUB1P53999 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.453e-8■■■■■ 71.9
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SUB1P53999 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.954e-7■■■■■ 71.5
SUB1P53999 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.024e-7■■■■■ 71.4
SUB1P53999 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.24e-7■■■■■ 71.4
SUB1P53999 DLD-205ENST00000440410 1993 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.617e-8■■■■■ 71.3
SUB1P53999 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.776e-28■■■■■ 71.1
SUB1P53999 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.954e-40■■■■■ 70.9
SUB1P53999 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.049e-43■■■■■ 70.7
SUB1P53999 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.129e-43■■■■■ 70.7
SUB1P53999 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.269e-43■■■■■ 70.7
SUB1P53999 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.629e-43■■■■■ 70.7
SUB1P53999 ACTG1-215ENST00000576917 1958 ntTSL 511.16□□□□□ -0.629e-43■■■■■ 70.7
SUB1P53999 ACTG1-216ENST00000615544 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.829e-43■■■■■ 70.7
SUB1P53999 ACTG1-214ENST00000576544 1720 ntTSL 59.54□□□□□ -0.889e-43■■■■■ 70.7
SUB1P53999 ATP5A1-210ENST00000589869 910 ntTSL 310.62□□□□□ -0.719e-10■■■■■ 70.3
SUB1P53999 PGK1-203ENST00000476531 960 ntTSL 28.05□□□□□ -1.121e-20■■■■■ 70
SUB1P53999 POLR2G-207ENST00000531996 660 ntTSL 37.08□□□□□ -1.282e-14■■■■■ 69.8
SUB1P53999 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.542e-10■■■■■ 69.7
SUB1P53999 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 12e-10■■■■■ 69.7
SUB1P53999 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.162e-10■■■■■ 69.7
SUB1P53999 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.332e-10■■■■■ 69.7
SUB1P53999 ACOT7-206ENST00000418124 1564 ntTSL 1 (best)12.64□□□□□ -0.392e-10■■■■■ 69.7
SUB1P53999 ACOT7-205ENST00000377860 1472 ntTSL 1 (best)12.5□□□□□ -0.412e-10■■■■■ 69.7
SUB1P53999 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.462e-10■■■■■ 69.7
SUB1P53999 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.562e-10■■■■■ 69.7
SUB1P53999 MMS19-204ENST00000415383 3401 ntTSL 1 (best)8.89□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 69.4
SUB1P53999 MMS19-201ENST00000327238 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 69.4
SUB1P53999 MMS19-209ENST00000438925 3797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 69.4
SUB1P53999 MMS19-203ENST00000370782 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.052e-6■■■■■ 69.4
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