RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395422.3

CHCHD2-201, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHCHD2, Length 901 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD2-201ENST00000395422 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.55■■■■□ 3.12
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CHCHD2-201ENST00000395422 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.99■■■□□ 2.23
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CHCHD2-201ENST00000395422 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.49■■□□□ 1.83
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CHCHD2-201ENST00000395422 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.22■■□□□ 1.79
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CHCHD2-201ENST00000395422 OSCARQ8IYS5 282 aa26.1■■□□□ 1.77
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CHCHD2-201ENST00000395422 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
CHCHD2-201ENST00000395422 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
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CHCHD2-201ENST00000395422 IFT140Q96RY7 1462 aa25.72■■□□□ 1.71
CHCHD2-201ENST00000395422 ARHGEF11O15085 1522 aa25.69■■□□□ 1.7
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CHCHD2-201ENST00000395422 CHD1O14646 1710 aa25.37■■□□□ 1.65
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CHCHD2-201ENST00000395422 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CHCHD2-201ENST00000395422 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.3■■□□□ 1.64
CHCHD2-201ENST00000395422 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
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CHCHD2-201ENST00000395422 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.17■■□□□ 1.62
CHCHD2-201ENST00000395422 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.13■■□□□ 1.61
CHCHD2-201ENST00000395422 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
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CHCHD2-201ENST00000395422 GRIN2BQ13224 1484 aa25.03■■□□□ 1.6
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CHCHD2-201ENST00000395422 NUP160Q12769 1436 aa24.69■■□□□ 1.54
CHCHD2-201ENST00000395422 CEP170Q5SW79 1584 aa24.67■■□□□ 1.54
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CHCHD2-201ENST00000395422 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.57■■□□□ 1.52
CHCHD2-201ENST00000395422 SHROOM2Q13796 1616 aa24.56■■□□□ 1.52
CHCHD2-201ENST00000395422 TOP2BQ02880 1626 aa24.47■■□□□ 1.51
CHCHD2-201ENST00000395422 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
CHCHD2-201ENST00000395422 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
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CHCHD2-201ENST00000395422 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.45■■□□□ 1.5
CHCHD2-201ENST00000395422 JPH4Q96JJ6 628 aa24.42■■□□□ 1.5
CHCHD2-201ENST00000395422 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.42■■□□□ 1.5
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