RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000350771.7

H2AFV-204, Transcript of H2A histone family member V, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene H2AFV, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFV-204ENST00000350771 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.01■■■■■ 7.68
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H2AFV-204ENST00000350771 ABCC9O60706 1549 aa55■■■■■ 6.4
H2AFV-204ENST00000350771 NACADO15069 1562 aa52.62■■■■■ 6.01
H2AFV-204ENST00000350771 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.61■■■■■ 6.01
H2AFV-204ENST00000350771 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.54■■■■■ 6
H2AFV-204ENST00000350771 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.44■■■■■ 5.98
H2AFV-204ENST00000350771 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.29■■■■■ 5.96
H2AFV-204ENST00000350771 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.24■■■■■ 5.95
H2AFV-204ENST00000350771 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.47■■■■■ 5.83
H2AFV-204ENST00000350771 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.23■■■■■ 5.79
H2AFV-204ENST00000350771 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.22■■■■■ 5.79
H2AFV-204ENST00000350771 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.07■■■■■ 5.77
H2AFV-204ENST00000350771 SCRIBQ14160 1630 aa50.99■■■■■ 5.75
H2AFV-204ENST00000350771 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.62■■■■■ 5.69
H2AFV-204ENST00000350771 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.75■■■■■ 5.56
H2AFV-204ENST00000350771 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.73■■■■■ 5.55
H2AFV-204ENST00000350771 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.56■■■■■ 5.52
H2AFV-204ENST00000350771 SMARCA4P51532 1647 aa48.87■■■■■ 5.41
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H2AFV-204ENST00000350771 NCAPD3P42695 1498 aa48.55■■■■■ 5.36
H2AFV-204ENST00000350771 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.53■■■■■ 5.36
H2AFV-204ENST00000350771 SMARCA2P51531 1590 aa48.52■■■■■ 5.36
H2AFV-204ENST00000350771 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.48■■■■■ 5.35
H2AFV-204ENST00000350771 HMGXB3Q12766 1538 aa48.35■■■■■ 5.33
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H2AFV-204ENST00000350771 WIZO95785 1651 aa48■■■■■ 5.27
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H2AFV-204ENST00000350771 NESP48681 1621 aa47.31■■■■■ 5.16
H2AFV-204ENST00000350771 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.24■■■■■ 5.15
H2AFV-204ENST00000350771 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.09■■■■■ 5.13
H2AFV-204ENST00000350771 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.94■■■■■ 5.1
H2AFV-204ENST00000350771 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.94■■■■■ 5.1
H2AFV-204ENST00000350771 CFTRP13569 1480 aa46.89■■■■■ 5.1
H2AFV-204ENST00000350771 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.88■■■■■ 5.09
H2AFV-204ENST00000350771 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.83■■■■■ 5.09
H2AFV-204ENST00000350771 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.81■■■■■ 5.08
H2AFV-204ENST00000350771 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.67■■■■■ 5.06
H2AFV-204ENST00000350771 PRDM2Q13029 1718 aa46.57■■■■■ 5.05
H2AFV-204ENST00000350771 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.53■■■■■ 5.04
H2AFV-204ENST00000350771 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.46■■■■■ 5.03
H2AFV-204ENST00000350771 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.42■■■■■ 5.02
H2AFV-204ENST00000350771 WDR62O43379 1518 aa46.29■■■■■ 5
H2AFV-204ENST00000350771 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.09■■■■■ 4.97
H2AFV-204ENST00000350771 ABCC8Q09428 1581 aa45.85■■■■■ 4.93
H2AFV-204ENST00000350771 TOPBP1Q92547 1522 aa45.82■■■■■ 4.93
H2AFV-204ENST00000350771 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.8■■■■■ 4.92
H2AFV-204ENST00000350771 CUX1P39880 1505 aa45.53■■■■■ 4.88
H2AFV-204ENST00000350771 IFT140Q96RY7 1462 aa45.51■■■■■ 4.88
H2AFV-204ENST00000350771 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.45■■■■■ 4.87
H2AFV-204ENST00000350771 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.37■■■■■ 4.85
H2AFV-204ENST00000350771 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.33■■■■■ 4.85
H2AFV-204ENST00000350771 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.27■■■■■ 4.84
H2AFV-204ENST00000350771 OSCARQ8IYS5 282 aa45.26■■■■■ 4.84
H2AFV-204ENST00000350771 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.25■■■■■ 4.83
H2AFV-204ENST00000350771 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.21■■■■■ 4.83
H2AFV-204ENST00000350771 SOGA1O94964 1423 aa45.2■■■■■ 4.83
H2AFV-204ENST00000350771 TOP2BQ02880 1626 aa45.2■■■■■ 4.83
H2AFV-204ENST00000350771 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.19■■■■■ 4.82
H2AFV-204ENST00000350771 SYNJ1O43426 1573 aa45.16■■■■■ 4.82
H2AFV-204ENST00000350771 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.13■■■■■ 4.82
H2AFV-204ENST00000350771 WDR97A6NE52 1622 aa45.07■■■■■ 4.81
H2AFV-204ENST00000350771 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.99■■■■■ 4.792e-7■■■■■ 32.8
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H2AFV-204ENST00000350771 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.96■■■■■ 4.79
H2AFV-204ENST00000350771 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.92■■■■■ 4.78
H2AFV-204ENST00000350771 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.79■■■■■ 4.76
H2AFV-204ENST00000350771 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.72■■■■■ 4.75
H2AFV-204ENST00000350771 GRIN2BQ13224 1484 aa44.71■■■■■ 4.75
H2AFV-204ENST00000350771 CHD1O14646 1710 aa44.66■■■■■ 4.74
H2AFV-204ENST00000350771 PBRM1Q86U86 1689 aa44.64■■■■■ 4.74
H2AFV-204ENST00000350771 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.61■■■■■ 4.73
H2AFV-204ENST00000350771 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.6■■■■■ 4.73
H2AFV-204ENST00000350771 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.6■■■■■ 4.73
H2AFV-204ENST00000350771 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.6■■■■■ 4.73
H2AFV-204ENST00000350771 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.6■■■■■ 4.73
H2AFV-204ENST00000350771 FBLN2P98095 1184 aa44.51■■■■■ 4.72
H2AFV-204ENST00000350771 ARHGEF11O15085 1522 aa44.48■■■■■ 4.71
H2AFV-204ENST00000350771 SYNJ2O15056 1496 aa44.42■■■■■ 4.7
H2AFV-204ENST00000350771 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.42■■■■■ 4.7
H2AFV-204ENST00000350771 ADAMTS12P58397 1594 aa44.32■■■■■ 4.69
H2AFV-204ENST00000350771 KIF27Q86VH2 1401 aa44.28■■■■■ 4.68
H2AFV-204ENST00000350771 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.28■■■■■ 4.68
H2AFV-204ENST00000350771 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.22■■■■■ 4.67
H2AFV-204ENST00000350771 GRIN2AQ12879 1464 aa44.15■■■■■ 4.66
H2AFV-204ENST00000350771 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.13■■■■■ 4.66
H2AFV-204ENST00000350771 IGF1RP08069 1367 aa44.12■■■■■ 4.65
H2AFV-204ENST00000350771 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.1■■■■■ 4.65
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H2AFV-204ENST00000350771 ARAP1Q96P48 1450 aa44.03■■■■■ 4.64
H2AFV-204ENST00000350771 NUP160Q12769 1436 aa43.99■■■■■ 4.63
H2AFV-204ENST00000350771 CEP170Q5SW79 1584 aa43.92■■■■■ 4.62
H2AFV-204ENST00000350771 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.9■■■■■ 4.62
H2AFV-204ENST00000350771 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.81■■■■■ 4.6
H2AFV-204ENST00000350771 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.73■■■■■ 4.59
H2AFV-204ENST00000350771 SHROOM2Q13796 1616 aa43.67■■■■■ 4.58
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