RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381124.9

H2AFV-205, Transcript of H2A histone family member V, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene H2AFV, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFV-205ENST00000381124 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.07■■■■■ 8.17
H2AFV-205ENST00000381124 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.89■■■■■ 7.02
H2AFV-205ENST00000381124 ABCC9O60706 1549 aa58.33■■■■■ 6.93
H2AFV-205ENST00000381124 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.78■■■■■ 6.52
H2AFV-205ENST00000381124 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.66■■■■■ 6.5
H2AFV-205ENST00000381124 NACADO15069 1562 aa55.56■■■■■ 6.48
H2AFV-205ENST00000381124 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.99■■■■■ 6.39
H2AFV-205ENST00000381124 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.91■■■■■ 6.38
H2AFV-205ENST00000381124 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.56■■■■■ 6.32
H2AFV-205ENST00000381124 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.48■■■■■ 6.31
H2AFV-205ENST00000381124 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.4■■■■■ 6.3
H2AFV-205ENST00000381124 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.07■■■■■ 6.25
H2AFV-205ENST00000381124 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.02■■■■■ 6.24
H2AFV-205ENST00000381124 SCRIBQ14160 1630 aa53.82■■■■■ 6.21
H2AFV-205ENST00000381124 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.42■■■■■ 6.14
H2AFV-205ENST00000381124 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.73■■■■■ 6.03
H2AFV-205ENST00000381124 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.66■■■■■ 6.02
H2AFV-205ENST00000381124 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.45■■■■■ 5.99
H2AFV-205ENST00000381124 SMARCA4P51532 1647 aa51.37■■■■■ 5.81
H2AFV-205ENST00000381124 NCAPD3P42695 1498 aa51.29■■■■■ 5.8
H2AFV-205ENST00000381124 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.26■■■■■ 5.8
H2AFV-205ENST00000381124 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.25■■■■■ 5.79
H2AFV-205ENST00000381124 SMARCA2P51531 1590 aa51.15■■■■■ 5.78
H2AFV-205ENST00000381124 HMGXB3Q12766 1538 aa50.96■■■■■ 5.75
H2AFV-205ENST00000381124 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.94■■■■■ 5.74
H2AFV-205ENST00000381124 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.84■■■■■ 5.73
H2AFV-205ENST00000381124 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.81■■■■■ 5.72
H2AFV-205ENST00000381124 WIZO95785 1651 aa50.35■■■■■ 5.65
H2AFV-205ENST00000381124 ERCC6Q03468 1493 aa50.34■■■■■ 5.65
H2AFV-205ENST00000381124 NESP48681 1621 aa50.29■■■■■ 5.64
H2AFV-205ENST00000381124 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.17■■■■■ 5.62
H2AFV-205ENST00000381124 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50■■■■■ 5.6
H2AFV-205ENST00000381124 CUX2O14529 1486 aa49.9■■■■■ 5.58
H2AFV-205ENST00000381124 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.81■■■■■ 5.56
H2AFV-205ENST00000381124 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.77■■■■■ 5.56
H2AFV-205ENST00000381124 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.77■■■■■ 5.56
H2AFV-205ENST00000381124 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.59■■■■■ 5.53
H2AFV-205ENST00000381124 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.56■■■■■ 5.52
H2AFV-205ENST00000381124 CFTRP13569 1480 aa49.37■■■■■ 5.49
H2AFV-205ENST00000381124 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.27■■■■■ 5.48
H2AFV-205ENST00000381124 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.25■■■■■ 5.48
H2AFV-205ENST00000381124 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.25■■■■■ 5.47
H2AFV-205ENST00000381124 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.22■■■■■ 5.47
H2AFV-205ENST00000381124 WDR62O43379 1518 aa49.08■■■■■ 5.45
H2AFV-205ENST00000381124 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.07■■■■■ 5.45
H2AFV-205ENST00000381124 PRDM2Q13029 1718 aa48.83■■■■■ 5.41
H2AFV-205ENST00000381124 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.77■■■■■ 5.4
H2AFV-205ENST00000381124 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.65■■■■■ 5.38
H2AFV-205ENST00000381124 TOPBP1Q92547 1522 aa48.38■■■■■ 5.34
H2AFV-205ENST00000381124 ABCC8Q09428 1581 aa48.32■■■■■ 5.33
H2AFV-205ENST00000381124 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.26■■■■■ 5.32
H2AFV-205ENST00000381124 IFT140Q96RY7 1462 aa48.22■■■■■ 5.31
H2AFV-205ENST00000381124 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.07■■■■■ 5.29
H2AFV-205ENST00000381124 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.94■■■■■ 5.26
H2AFV-205ENST00000381124 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.83■■■■■ 5.25
H2AFV-205ENST00000381124 OSCARQ8IYS5 282 aa47.83■■■■■ 5.25
H2AFV-205ENST00000381124 CUX1P39880 1505 aa47.81■■■■■ 5.24
H2AFV-205ENST00000381124 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.8■■■■■ 5.24
H2AFV-205ENST00000381124 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.78■■■■■ 5.24
H2AFV-205ENST00000381124 SOGA1O94964 1423 aa47.78■■■■■ 5.24
H2AFV-205ENST00000381124 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.77■■■■■ 5.24
H2AFV-205ENST00000381124 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.76■■■■■ 5.242e-7■■■■■ 32.8
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H2AFV-205ENST00000381124 FBLN2P98095 1184 aa47.4■■■■■ 5.18
H2AFV-205ENST00000381124 WDR97A6NE52 1622 aa47.39■■■■■ 5.18
H2AFV-205ENST00000381124 TRIM41Q8WV44 630 aa47.36■■■■■ 5.17
H2AFV-205ENST00000381124 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.35■■■■■ 5.17
H2AFV-205ENST00000381124 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.29■■■■■ 5.16
H2AFV-205ENST00000381124 CHD1O14646 1710 aa47.28■■■■■ 5.16
H2AFV-205ENST00000381124 GRIN2BQ13224 1484 aa47.26■■■■■ 5.16
H2AFV-205ENST00000381124 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.23■■■■■ 5.15
H2AFV-205ENST00000381124 TOP2BQ02880 1626 aa47.22■■■■■ 5.15
H2AFV-205ENST00000381124 SYNJ1O43426 1573 aa47.2■■■■■ 5.15
H2AFV-205ENST00000381124 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.19■■■■■ 5.14
H2AFV-205ENST00000381124 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.19■■■■■ 5.14
H2AFV-205ENST00000381124 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.16■■■■■ 5.14
H2AFV-205ENST00000381124 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.14■■■■■ 5.14
H2AFV-205ENST00000381124 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.05■■■■■ 5.12
H2AFV-205ENST00000381124 PBRM1Q86U86 1689 aa47.04■■■■■ 5.12
H2AFV-205ENST00000381124 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.04■■■■■ 5.12
H2AFV-205ENST00000381124 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.04■■■■■ 5.12
H2AFV-205ENST00000381124 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.04■■■■■ 5.12
H2AFV-205ENST00000381124 SYNJ2O15056 1496 aa47■■■■■ 5.11
H2AFV-205ENST00000381124 ARHGEF11O15085 1522 aa47■■■■■ 5.11
H2AFV-205ENST00000381124 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.77■■■■■ 5.08
H2AFV-205ENST00000381124 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.7■■■■■ 5.07
H2AFV-205ENST00000381124 ADAMTS12P58397 1594 aa46.68■■■■■ 5.06
H2AFV-205ENST00000381124 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.64■■■■■ 5.06
H2AFV-205ENST00000381124 GRIN2AQ12879 1464 aa46.63■■■■■ 5.06
H2AFV-205ENST00000381124 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.62■■■■■ 5.05
H2AFV-205ENST00000381124 ARAP1Q96P48 1450 aa46.59■■■■■ 5.05
H2AFV-205ENST00000381124 NUP160Q12769 1436 aa46.43■■■■■ 5.02
H2AFV-205ENST00000381124 CEP170Q5SW79 1584 aa46.41■■■■■ 5.02
H2AFV-205ENST00000381124 KIF27Q86VH2 1401 aa46.41■■■■■ 5.02
H2AFV-205ENST00000381124 IGF1RP08069 1367 aa46.26■■■■■ 5
H2AFV-205ENST00000381124 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.13■■■■■ 4.97
H2AFV-205ENST00000381124 CUL7Q14999 1698 aa46.1■■■■■ 4.97
H2AFV-205ENST00000381124 SHROOM2Q13796 1616 aa46.08■■■■■ 4.97
H2AFV-205ENST00000381124 JPH4Q96JJ6 628 aa46.03■■■■■ 4.96
H2AFV-205ENST00000381124 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.01■■■■■ 4.96
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