RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304863.5

UQCRFS1-201, Transcript of ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UQCRFS1, Length 3,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRFS1-201ENST00000304863 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.58■■□□□ 1.85
UQCRFS1-201ENST00000304863 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.52■■□□□ 1.36
UQCRFS1-201ENST00000304863 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
UQCRFS1-201ENST00000304863 HRCP23327 699 aa22.98■■□□□ 1.27
UQCRFS1-201ENST00000304863 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.79■■□□□ 1.24
UQCRFS1-201ENST00000304863 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.77■■□□□ 1.24
UQCRFS1-201ENST00000304863 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.74■■□□□ 1.23
UQCRFS1-201ENST00000304863 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
UQCRFS1-201ENST00000304863 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
UQCRFS1-201ENST00000304863 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.44■■□□□ 1.18
UQCRFS1-201ENST00000304863 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.26■■□□□ 1.15
UQCRFS1-201ENST00000304863 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.16■■□□□ 1.14
UQCRFS1-201ENST00000304863 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1-201ENST00000304863 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
UQCRFS1-201ENST00000304863 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
UQCRFS1-201ENST00000304863 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
UQCRFS1-201ENST00000304863 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
UQCRFS1-201ENST00000304863 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
UQCRFS1-201ENST00000304863 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.58■■□□□ 1.05
UQCRFS1-201ENST00000304863 TRIM41Q8WV44 630 aa21.56■■□□□ 1.04
UQCRFS1-201ENST00000304863 MYT1Q01538 1121 aa21.49■■□□□ 1.03
UQCRFS1-201ENST00000304863 ABCC9O60706 1549 aa21.38■■□□□ 1.01
UQCRFS1-201ENST00000304863 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
UQCRFS1-201ENST00000304863 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.23■□□□□ 0.99
UQCRFS1-201ENST00000304863 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
UQCRFS1-201ENST00000304863 SCRIBQ14160 1630 aa21.19■□□□□ 0.98
UQCRFS1-201ENST00000304863 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
UQCRFS1-201ENST00000304863 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
UQCRFS1-201ENST00000304863 NEUROD1Q13562 356 aa21.15■□□□□ 0.98
UQCRFS1-201ENST00000304863 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.02■□□□□ 0.96
UQCRFS1-201ENST00000304863 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
UQCRFS1-201ENST00000304863 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
UQCRFS1-201ENST00000304863 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
UQCRFS1-201ENST00000304863 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.86■□□□□ 0.93
UQCRFS1-201ENST00000304863 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.79■□□□□ 0.92
UQCRFS1-201ENST00000304863 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
UQCRFS1-201ENST00000304863 WIZO95785 1651 aa20.7■□□□□ 0.9
UQCRFS1-201ENST00000304863 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
UQCRFS1-201ENST00000304863 CEP162Q5TB80 1403 aa20.59■□□□□ 0.89
UQCRFS1-201ENST00000304863 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
UQCRFS1-201ENST00000304863 ABCC8Q09428 1581 aa20.53■□□□□ 0.88
UQCRFS1-201ENST00000304863 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.53■□□□□ 0.88
UQCRFS1-201ENST00000304863 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
UQCRFS1-201ENST00000304863 MIER1Q8N108 512 aa20.5■□□□□ 0.87
UQCRFS1-201ENST00000304863 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
UQCRFS1-201ENST00000304863 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
UQCRFS1-201ENST00000304863 SOGA1O94964 1423 aa20.47■□□□□ 0.87
UQCRFS1-201ENST00000304863 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
UQCRFS1-201ENST00000304863 NACADO15069 1562 aa20.43■□□□□ 0.86
UQCRFS1-201ENST00000304863 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.43■□□□□ 0.86
UQCRFS1-201ENST00000304863 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.39■□□□□ 0.86
UQCRFS1-201ENST00000304863 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.34■□□□□ 0.85
UQCRFS1-201ENST00000304863 BCL11AQ9H165 835 aa20.34■□□□□ 0.85
UQCRFS1-201ENST00000304863 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
UQCRFS1-201ENST00000304863 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
UQCRFS1-201ENST00000304863 GOLGA3Q08378 1498 aa20.23■□□□□ 0.83
UQCRFS1-201ENST00000304863 EEA1Q15075 1411 aa20.23■□□□□ 0.83
UQCRFS1-201ENST00000304863 SMARCA2P51531 1590 aa20.21■□□□□ 0.83
UQCRFS1-201ENST00000304863 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
UQCRFS1-201ENST00000304863 APLP2Q06481 763 aa20.15■□□□□ 0.82
UQCRFS1-201ENST00000304863 SMARCA4P51532 1647 aa20.12■□□□□ 0.81
UQCRFS1-201ENST00000304863 CLIP1P30622 1438 aa20.1■□□□□ 0.81
UQCRFS1-201ENST00000304863 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
UQCRFS1-201ENST00000304863 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.04■□□□□ 0.8
UQCRFS1-201ENST00000304863 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.02■□□□□ 0.79
UQCRFS1-201ENST00000304863 KIF21BO75037 1637 aa19.91■□□□□ 0.78
UQCRFS1-201ENST00000304863 CLSPNQ9HAW4 1339 aa19.91■□□□□ 0.78
UQCRFS1-201ENST00000304863 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.9■□□□□ 0.78
UQCRFS1-201ENST00000304863 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
UQCRFS1-201ENST00000304863 SYNJ1O43426 1573 aa19.9■□□□□ 0.78
UQCRFS1-201ENST00000304863 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa19.87■□□□□ 0.77
UQCRFS1-201ENST00000304863 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP19.85■□□□□ 0.77
UQCRFS1-201ENST00000304863 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
UQCRFS1-201ENST00000304863 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
UQCRFS1-201ENST00000304863 BCANQ96GW7 911 aa19.78■□□□□ 0.76
UQCRFS1-201ENST00000304863 KCNH8Q96L42 1107 aa19.78■□□□□ 0.76
UQCRFS1-201ENST00000304863 ITGAEP38570 1179 aa19.77■□□□□ 0.76
UQCRFS1-201ENST00000304863 ANP32EQ9BTT0 268 aa19.75■□□□□ 0.75
UQCRFS1-201ENST00000304863 UNC13AQ9UPW8 1703 aa19.75■□□□□ 0.75
UQCRFS1-201ENST00000304863 ERICH6Q7L0X2 663 aa19.71■□□□□ 0.75
UQCRFS1-201ENST00000304863 FKBP8Q14318 412 aa19.64■□□□□ 0.73
UQCRFS1-201ENST00000304863 ARAP1Q96P48 1450 aa19.64■□□□□ 0.73
UQCRFS1-201ENST00000304863 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
UQCRFS1-201ENST00000304863 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.58■□□□□ 0.72
UQCRFS1-201ENST00000304863 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
UQCRFS1-201ENST00000304863 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.56■□□□□ 0.72
UQCRFS1-201ENST00000304863 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.52■□□□□ 0.72
UQCRFS1-201ENST00000304863 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.52■□□□□ 0.71
UQCRFS1-201ENST00000304863 PRXQ9BXM0 1461 aa19.51■□□□□ 0.71
UQCRFS1-201ENST00000304863 TOP2BQ02880 1626 aa19.51■□□□□ 0.71
UQCRFS1-201ENST00000304863 BICRAQ9NZM4 1560 aa19.5■□□□□ 0.71
UQCRFS1-201ENST00000304863 NEFLP07196 543 aa19.5■□□□□ 0.71
UQCRFS1-201ENST00000304863 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.49■□□□□ 0.71
UQCRFS1-201ENST00000304863 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
UQCRFS1-201ENST00000304863 TRIM52Q96A61 297 aa19.48■□□□□ 0.71
UQCRFS1-201ENST00000304863 CUX2O14529 1486 aa19.47■□□□□ 0.71
UQCRFS1-201ENST00000304863 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.47■□□□□ 0.71
UQCRFS1-201ENST00000304863 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
UQCRFS1-201ENST00000304863 MAPKBP1O60336 1514 aa19.43■□□□□ 0.7
UQCRFS1-201ENST00000304863 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms