Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.251e-6■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 EHBP1L1-211ENST00000634639 1643 ntTSL 538■■■■□ 3.676e-7■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 EHBP1L1-208ENST00000533237 2267 ntTSL 537.58■■■■□ 3.616e-7■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.896e-7■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 MYO18A-220ENST00000588791 650 ntTSL 524.38■■□□□ 1.492e-8■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 MYO18A-207ENST00000530254 6479 ntTSL 1 (best)15.33■□□□□ 0.052e-8■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 MYO18A-202ENST00000527372 9992 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.152e-8■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 MYO18A-209ENST00000531253 7504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.322e-8■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 MYO18A-223ENST00000628822 7501 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.322e-8■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 MYO18A-214ENST00000533112 7522 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.372e-8■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.171e-7■■■■□ 20.4
DROSHAQ9NRR4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.121e-7■■■■□ 20.4
DROSHAQ9NRR4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.031e-7■■■■□ 20.4
DROSHAQ9NRR4 LTBP4-211ENST00000594537 657 ntTSL 535.49■■■■□ 3.272e-6■■■■□ 20.4
DROSHAQ9NRR4 LTBP4-227ENST00000600026 723 ntTSL 333.55■■■□□ 2.962e-6■■■■□ 20.4
DROSHAQ9NRR4 LTBP4-224ENST00000599016 726 ntTSL 333.3■■■□□ 2.922e-6■■■■□ 20.4
DROSHAQ9NRR4 LTBP4-223ENST00000598717 811 ntTSL 529.34■■■□□ 2.292e-6■■■■□ 20.4
DROSHAQ9NRR4 LTBP4-208ENST00000593738 302 ntTSL 329.29■■■□□ 2.282e-6■■■■□ 20.4
DROSHAQ9NRR4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.462e-6■■■■□ 20.4
DROSHAQ9NRR4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.212e-6■■■■□ 20.4
DROSHAQ9NRR4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.062e-6■■■■□ 20.4
DROSHAQ9NRR4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.292e-7■■■■□ 20.4
DROSHAQ9NRR4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.682e-7■■■■□ 20.4
DROSHAQ9NRR4 TMC6-224ENST00000593044 3070 ntTSL 223.59■■□□□ 1.372e-7■■■■□ 20.4
DROSHAQ9NRR4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.712e-7■■■■□ 20.4
DROSHAQ9NRR4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.946e-9■■■■□ 20.4
DROSHAQ9NRR4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.816e-9■■■■□ 20.4
DROSHAQ9NRR4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.296e-9■■■■□ 20.4
DROSHAQ9NRR4 C21orf2-204ENST00000462742 4532 ntTSL 225.14■■□□□ 1.616e-9■■■■□ 20.4
DROSHAQ9NRR4 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.712e-6■■■■□ 20.4
DROSHAQ9NRR4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.916e-7■■■■□ 20.4
DROSHAQ9NRR4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.816e-7■■■■□ 20.4
DROSHAQ9NRR4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.471e-6■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 KIAA0368-206ENST00000602978 539 ntAPPRIS ALT2 TSL 431.43■■■□□ 2.624e-8■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 KIAA0368-205ENST00000602447 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 525.2■■□□□ 1.634e-8■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.324e-8■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.174e-8■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.482e-6■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.398e-7■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 TXNRD2-220ENST00000634537 1086 ntTSL 527.95■■■□□ 2.068e-7■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.798e-7■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 TXNRD2-215ENST00000494454 2004 ntTSL 1 (best)23.66■■□□□ 1.388e-7■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 PPP4R1-204ENST00000577393 531 ntTSL 440.44■■■■■ 4.061e-18■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 PPP4R1-228ENST00000584074 625 ntTSL 332.95■■■□□ 2.861e-18■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 PPP4R1-221ENST00000582240 578 ntTSL 431.56■■■□□ 2.641e-18■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 PPP4R1-215ENST00000580182 582 ntTSL 328.58■■■□□ 2.171e-18■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 PPP4R1-206ENST00000577779 481 ntTSL 223.22■■□□□ 1.311e-18■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 PPP4R1-219ENST00000581250 578 ntTSL 418.18■□□□□ 0.51e-18■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 PPP4R1-218ENST00000580745 535 ntTSL 417.37■□□□□ 0.371e-18■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.351e-18■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 PPP4R1-208ENST00000578178 468 ntTSL 416.81■□□□□ 0.281e-18■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 PPP4R1-224ENST00000583092 554 ntTSL 415.91■□□□□ 0.141e-18■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 PPP4R1-220ENST00000581835 379 ntTSL 215.75■□□□□ 0.111e-18■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 PPP4R1-203ENST00000400556 3925 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.061e-18■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 PPP4R1-201ENST00000285124 2917 ntTSL 514.35□□□□□ -0.111e-18■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 PPP4R1-211ENST00000578875 580 ntTSL 413.62□□□□□ -0.231e-18■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 PPP4R1-216ENST00000580283 378 ntTSL 210.51□□□□□ -0.731e-18■■■■□ 20.3
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DROSHAQ9NRR4 RREB1-209ENST00000491191 998 ntTSL 522.52■■□□□ 1.22e-6■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.132e-6■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.362e-6■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 SS18L1-201ENST00000331758 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.392e-6■■■■□ 20.3
DROSHAQ9NRR4 THUMPD3-AS1-204ENST00000480904 493 ntTSL 35.79□□□□□ -1.482e-8■■■■□ 20.2
DROSHAQ9NRR4 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.953e-13■■■■□ 20.2
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DROSHAQ9NRR4 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.543e-13■■■■□ 20.2
DROSHAQ9NRR4 P4HA1-202ENST00000307116 2727 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.233e-13■■■■□ 20.2
DROSHAQ9NRR4 P4HA1-203ENST00000373008 2727 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.233e-13■■■■□ 20.2
DROSHAQ9NRR4 UBE2I-216ENST00000567383 538 ntTSL 426.5■■□□□ 1.836e-7■■■■□ 20.2
DROSHAQ9NRR4 MIB1-204ENST00000578646 3306 ntTSL 215.63■□□□□ 0.092e-6■■■■□ 20.2
DROSHAQ9NRR4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.915e-20■■■■□ 20.2
DROSHAQ9NRR4 R3HDM4-206ENST00000590454 1006 ntTSL 332.94■■■□□ 2.861e-6■■■■□ 20.2
DROSHAQ9NRR4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.147e-8■■■■□ 20.2
DROSHAQ9NRR4 KMT5C-203ENST00000445196 2077 ntTSL 525.73■■□□□ 1.717e-8■■■■□ 20.2
DROSHAQ9NRR4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.861e-9■■■■□ 20.2
DROSHAQ9NRR4 RANBP1-210ENST00000435265 1879 ntTSL 229.64■■■□□ 2.331e-9■■■■□ 20.2
DROSHAQ9NRR4 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.261e-9■■■■□ 20.2
DROSHAQ9NRR4 RANBP1-203ENST00000411892 584 ntTSL 222.87■■□□□ 1.251e-9■■■■□ 20.2
DROSHAQ9NRR4 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.141e-9■■■■□ 20.2
DROSHAQ9NRR4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.111e-6■■■■□ 20.2
DROSHAQ9NRR4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.071e-6■■■■□ 20.2
DROSHAQ9NRR4 R3HDM4-204ENST00000589428 1704 ntTSL 332.37■■■□□ 2.771e-6■■■■□ 20.2
DROSHAQ9NRR4 TCEA2-213ENST00000475792 655 ntTSL 227.02■■□□□ 1.925e-7■■■■□ 20.2
DROSHAQ9NRR4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.775e-6■■■■□ 20.2
DROSHAQ9NRR4 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.675e-6■■■■□ 20.2
DROSHAQ9NRR4 LRRC41-205ENST00000498402 2068 ntTSL 225.82■■□□□ 1.722e-10■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.022e-10■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.322e-10■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 LRRC41-207ENST00000617190 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.062e-10■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 SS18L1-203ENST00000450482 781 ntTSL 518.39■□□□□ 0.532e-6■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 PTMA-208ENST00000448874 1108 ntTSL 226.06■■□□□ 1.766e-7■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 PTMA-212ENST00000481928 1635 ntTSL 325.63■■□□□ 1.696e-7■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 PTMA-211ENST00000468027 621 ntTSL 1 (best)20.11■□□□□ 0.816e-7■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 PTMA-209ENST00000466801 784 ntTSL 516.86■□□□□ 0.296e-7■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.246e-7■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 PTMA-201ENST00000341369 1212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.196e-7■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 PTMA-203ENST00000409321 735 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.156e-7■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.046e-7■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.522e-10■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.242e-10■■■■□ 20.1
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