RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577393.1

PPP4R1-204, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 1, humanhuman

TSL 4

Gene PPP4R1, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R1-204ENST00000577393 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.52■■■■■ 7.92
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PPP4R1-204ENST00000577393 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.11■■■■■ 6.25
PPP4R1-204ENST00000577393 NACADO15069 1562 aa54.08■■■■■ 6.25
PPP4R1-204ENST00000577393 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.67■■■■■ 6.18
PPP4R1-204ENST00000577393 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.65■■■■■ 6.18
PPP4R1-204ENST00000577393 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.33■■■■■ 6.13
PPP4R1-204ENST00000577393 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.95■■■■■ 6.07
PPP4R1-204ENST00000577393 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.83■■■■■ 6.05
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PPP4R1-204ENST00000577393 SCRIBQ14160 1630 aa52.42■■■■■ 5.98
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PPP4R1-204ENST00000577393 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.95■■■■■ 5.91
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PPP4R1-204ENST00000577393 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.09■■■■■ 5.77
PPP4R1-204ENST00000577393 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.8■■■■■ 5.72
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PPP4R1-204ENST00000577393 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.93■■■■■ 5.58
PPP4R1-204ENST00000577393 SMARCA2P51531 1590 aa49.82■■■■■ 5.57
PPP4R1-204ENST00000577393 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.74■■■■■ 5.55
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PPP4R1-204ENST00000577393 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.59■■■■■ 5.53
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PPP4R1-204ENST00000577393 ERCC6Q03468 1493 aa48.72■■■■■ 5.39
PPP4R1-204ENST00000577393 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.62■■■■■ 5.37
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PPP4R1-204ENST00000577393 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.34■■■■■ 5.33
PPP4R1-204ENST00000577393 CUX2O14529 1486 aa48.28■■■■■ 5.32
PPP4R1-204ENST00000577393 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.2■■■■■ 5.31
PPP4R1-204ENST00000577393 CFTRP13569 1480 aa48.12■■■■■ 5.29
PPP4R1-204ENST00000577393 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.1■■■■■ 5.29
PPP4R1-204ENST00000577393 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.09■■■■■ 5.29
PPP4R1-204ENST00000577393 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.91■■■■■ 5.26
PPP4R1-204ENST00000577393 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.86■■■■■ 5.25
PPP4R1-204ENST00000577393 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.84■■■■■ 5.25
PPP4R1-204ENST00000577393 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.71■■■■■ 5.23
PPP4R1-204ENST00000577393 WDR62O43379 1518 aa47.68■■■■■ 5.22
PPP4R1-204ENST00000577393 PRDM2Q13029 1718 aa47.64■■■■■ 5.22
PPP4R1-204ENST00000577393 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.46■■■■■ 5.19
PPP4R1-204ENST00000577393 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.17■■■■■ 5.14
PPP4R1-204ENST00000577393 TOPBP1Q92547 1522 aa47.12■■■■■ 5.13
PPP4R1-204ENST00000577393 ABCC8Q09428 1581 aa47.07■■■■■ 5.13
PPP4R1-204ENST00000577393 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.01■■■■■ 5.12
PPP4R1-204ENST00000577393 IFT140Q96RY7 1462 aa46.88■■■■■ 5.09
PPP4R1-204ENST00000577393 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.72■■■■■ 5.07
PPP4R1-204ENST00000577393 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.7■■■■■ 5.07
PPP4R1-204ENST00000577393 CUX1P39880 1505 aa46.67■■■■■ 5.06
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PPP4R1-204ENST00000577393 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.53■■■■■ 5.04
PPP4R1-204ENST00000577393 SOGA1O94964 1423 aa46.53■■■■■ 5.04
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PPP4R1-204ENST00000577393 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.28■■■■■ 5
PPP4R1-204ENST00000577393 WDR97A6NE52 1622 aa46.17■■■■■ 4.98
PPP4R1-204ENST00000577393 TOP2BQ02880 1626 aa46.17■■■■■ 4.98
PPP4R1-204ENST00000577393 SYNJ1O43426 1573 aa46.16■■■■■ 4.98
PPP4R1-204ENST00000577393 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.15■■■■■ 4.98
PPP4R1-204ENST00000577393 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.08■■■■■ 4.97
PPP4R1-204ENST00000577393 GRIN2BQ13224 1484 aa45.99■■■■■ 4.95
PPP4R1-204ENST00000577393 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.97■■■■■ 4.95
PPP4R1-204ENST00000577393 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.97■■■■■ 4.95
PPP4R1-204ENST00000577393 FBLN2P98095 1184 aa45.96■■■■■ 4.95
PPP4R1-204ENST00000577393 CHD1O14646 1710 aa45.93■■■■■ 4.94
PPP4R1-204ENST00000577393 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.89■■■■■ 4.94
PPP4R1-204ENST00000577393 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.87■■■■■ 4.93
PPP4R1-204ENST00000577393 PBRM1Q86U86 1689 aa45.83■■■■■ 4.93
PPP4R1-204ENST00000577393 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.77■■■■■ 4.92
PPP4R1-204ENST00000577393 SYNJ2O15056 1496 aa45.71■■■■■ 4.91
PPP4R1-204ENST00000577393 TRIM41Q8WV44 630 aa45.53■■■■■ 4.88
PPP4R1-204ENST00000577393 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.52■■■■■ 4.88
PPP4R1-204ENST00000577393 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.52■■■■■ 4.88
PPP4R1-204ENST00000577393 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.52■■■■■ 4.88
PPP4R1-204ENST00000577393 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.51■■■■■ 4.88
PPP4R1-204ENST00000577393 ARHGEF11O15085 1522 aa45.5■■■■■ 4.87
PPP4R1-204ENST00000577393 ADAMTS12P58397 1594 aa45.47■■■■■ 4.87
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PPP4R1-204ENST00000577393 KIF27Q86VH2 1401 aa45.33■■■■■ 4.85
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PPP4R1-204ENST00000577393 NUP160Q12769 1436 aa45.21■■■■■ 4.83
PPP4R1-204ENST00000577393 CEP170Q5SW79 1584 aa45.18■■■■■ 4.82
PPP4R1-204ENST00000577393 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.16■■■■■ 4.82
PPP4R1-204ENST00000577393 ARAP1Q96P48 1450 aa45.12■■■■■ 4.81
PPP4R1-204ENST00000577393 CUL7Q14999 1698 aa45.02■■■■■ 4.8
PPP4R1-204ENST00000577393 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.94■■■■■ 4.78
PPP4R1-204ENST00000577393 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.88■■■■■ 4.78
PPP4R1-204ENST00000577393 SHROOM2Q13796 1616 aa44.86■■■■■ 4.77
PPP4R1-204ENST00000577393 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.83■■■■■ 4.77
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