RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594537.2

LTBP4-211, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene LTBP4, Length 657 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-211ENST00000594537 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.02■■■■■ 6.4
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LTBP4-211ENST00000594537 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.99■■■■■ 4.95
LTBP4-211ENST00000594537 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.68■■■■■ 4.9
LTBP4-211ENST00000594537 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.67■■■■■ 4.9
LTBP4-211ENST00000594537 NACADO15069 1562 aa45.63■■■■■ 4.9
LTBP4-211ENST00000594537 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.52■■■■■ 4.88
LTBP4-211ENST00000594537 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.49■■■■■ 4.87
LTBP4-211ENST00000594537 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.34■■■■■ 4.69
LTBP4-211ENST00000594537 SCRIBQ14160 1630 aa44.32■■■■■ 4.68
LTBP4-211ENST00000594537 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.01■■■■■ 4.64
LTBP4-211ENST00000594537 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.83■■■■■ 4.61
LTBP4-211ENST00000594537 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.82■■■■■ 4.61
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LTBP4-211ENST00000594537 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.68■■■■■ 4.42
LTBP4-211ENST00000594537 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.64■■■■■ 4.42
LTBP4-211ENST00000594537 SMARCA4P51532 1647 aa42.53■■■■■ 4.4
LTBP4-211ENST00000594537 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.44■■■■■ 4.38
LTBP4-211ENST00000594537 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.34■■■■■ 4.37
LTBP4-211ENST00000594537 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.31■■■■■ 4.36
LTBP4-211ENST00000594537 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.2■■■■■ 4.35
LTBP4-211ENST00000594537 SMARCA2P51531 1590 aa42.19■■■■■ 4.34
LTBP4-211ENST00000594537 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.15■■■■■ 4.34
LTBP4-211ENST00000594537 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
LTBP4-211ENST00000594537 NCAPD3P42695 1498 aa42.08■■■■■ 4.33
LTBP4-211ENST00000594537 HMGXB3Q12766 1538 aa41.95■■■■■ 4.31
LTBP4-211ENST00000594537 WIZO95785 1651 aa41.89■■■■■ 4.3
LTBP4-211ENST00000594537 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
LTBP4-211ENST00000594537 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
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LTBP4-211ENST00000594537 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.04■■■■■ 4.16
LTBP4-211ENST00000594537 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.87■■■■■ 4.13
LTBP4-211ENST00000594537 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.86■■■■■ 4.13
LTBP4-211ENST00000594537 CFTRP13569 1480 aa40.77■■■■■ 4.12
LTBP4-211ENST00000594537 NESP48681 1621 aa40.69■■■■■ 4.1
LTBP4-211ENST00000594537 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.58■■■■■ 4.09
LTBP4-211ENST00000594537 PRDM2Q13029 1718 aa40.5■■■■■ 4.07
LTBP4-211ENST00000594537 ERCC6Q03468 1493 aa40.38■■■■■ 4.05
LTBP4-211ENST00000594537 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.36■■■■■ 4.05
LTBP4-211ENST00000594537 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.27■■■■■ 4.04
LTBP4-211ENST00000594537 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.27■■■■■ 4.04
LTBP4-211ENST00000594537 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.07■■■■■ 4.01
LTBP4-211ENST00000594537 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
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LTBP4-211ENST00000594537 CUX2O14529 1486 aa39.81■■■■□ 3.96
LTBP4-211ENST00000594537 TOPBP1Q92547 1522 aa39.78■■■■□ 3.96
LTBP4-211ENST00000594537 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.74■■■■□ 3.95
LTBP4-211ENST00000594537 CUX1P39880 1505 aa39.7■■■■□ 3.95
LTBP4-211ENST00000594537 TOP2BQ02880 1626 aa39.59■■■■□ 3.93
LTBP4-211ENST00000594537 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.58■■■■□ 3.93
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LTBP4-211ENST00000594537 IFT140Q96RY7 1462 aa39.43■■■■□ 3.9
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LTBP4-211ENST00000594537 TRIM41Q8WV44 630 aa39.2■■■■□ 3.87
LTBP4-211ENST00000594537 WDR97A6NE52 1622 aa39.19■■■■□ 3.86
LTBP4-211ENST00000594537 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.19■■■■□ 3.86
LTBP4-211ENST00000594537 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.13■■■■□ 3.85
LTBP4-211ENST00000594537 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
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LTBP4-211ENST00000594537 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.93■■■■□ 3.82
LTBP4-211ENST00000594537 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.92■■■■□ 3.82
LTBP4-211ENST00000594537 KIF27Q86VH2 1401 aa38.89■■■■□ 3.82
LTBP4-211ENST00000594537 GRIN2BQ13224 1484 aa38.85■■■■□ 3.81
LTBP4-211ENST00000594537 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.76■■■■□ 3.8
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LTBP4-211ENST00000594537 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.63■■■■□ 3.77
LTBP4-211ENST00000594537 IGF1RP08069 1367 aa38.59■■■■□ 3.77
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LTBP4-211ENST00000594537 OSCARQ8IYS5 282 aa38.23■■■■□ 3.71
LTBP4-211ENST00000594537 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.23■■■■□ 3.71
LTBP4-211ENST00000594537 NUP160Q12769 1436 aa38.15■■■■□ 3.7
LTBP4-211ENST00000594537 KIF21BO75037 1637 aa38.13■■■■□ 3.69
LTBP4-211ENST00000594537 CEP170Q5SW79 1584 aa38.06■■■■□ 3.68
LTBP4-211ENST00000594537 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.01■■■■□ 3.67
LTBP4-211ENST00000594537 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.96■■■■□ 3.67
LTBP4-211ENST00000594537 GOLGA3Q08378 1498 aa37.95■■■■□ 3.67
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