RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291906.4

PKN3-201, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKN3, Length 3,375 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-201ENST00000291906 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.9■■■■□ 3.34
PKN3-201ENST00000291906 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.71■■■□□ 2.51
PKN3-201ENST00000291906 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.66■■■□□ 2.5
PKN3-201ENST00000291906 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.58■■■□□ 2.49
PKN3-201ENST00000291906 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
PKN3-201ENST00000291906 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
PKN3-201ENST00000291906 ABCC9O60706 1549 aa29.31■■■□□ 2.28
PKN3-201ENST00000291906 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.23■■■□□ 2.27
PKN3-201ENST00000291906 SCRIBQ14160 1630 aa28.91■■■□□ 2.22
PKN3-201ENST00000291906 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.56■■■□□ 2.16
PKN3-201ENST00000291906 NACADO15069 1562 aa28.54■■■□□ 2.16
PKN3-201ENST00000291906 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.53■■■□□ 2.16
PKN3-201ENST00000291906 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
PKN3-201ENST00000291906 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.27■■■□□ 2.12
PKN3-201ENST00000291906 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.18■■■□□ 2.1
PKN3-201ENST00000291906 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.07■■■□□ 2.083e-7■■■■□ 26.7
PKN3-201ENST00000291906 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.96■■■□□ 2.07
PKN3-201ENST00000291906 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.84■■■□□ 2.05
PKN3-201ENST00000291906 TRIM41Q8WV44 630 aa27.78■■■□□ 2.04
PKN3-201ENST00000291906 WIZO95785 1651 aa27.76■■■□□ 2.04
PKN3-201ENST00000291906 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
PKN3-201ENST00000291906 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.69■■■□□ 2.02
PKN3-201ENST00000291906 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.69■■■□□ 2.02
PKN3-201ENST00000291906 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
PKN3-201ENST00000291906 SMARCA4P51532 1647 aa27.43■■□□□ 1.98
PKN3-201ENST00000291906 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.43■■□□□ 1.98
PKN3-201ENST00000291906 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.28■■□□□ 1.96
PKN3-201ENST00000291906 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
PKN3-201ENST00000291906 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.23■■□□□ 1.95
PKN3-201ENST00000291906 SMARCA2P51531 1590 aa27.08■■□□□ 1.93
PKN3-201ENST00000291906 ABCC8Q09428 1581 aa27.04■■□□□ 1.92
PKN3-201ENST00000291906 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.95■■□□□ 1.9
PKN3-201ENST00000291906 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
PKN3-201ENST00000291906 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PKN3-201ENST00000291906 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PKN3-201ENST00000291906 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.75■■□□□ 1.87
PKN3-201ENST00000291906 SOGA1O94964 1423 aa26.71■■□□□ 1.87
PKN3-201ENST00000291906 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
PKN3-201ENST00000291906 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PKN3-201ENST00000291906 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.65■■□□□ 1.86
PKN3-201ENST00000291906 HRCP23327 699 aa26.64■■□□□ 1.86
PKN3-201ENST00000291906 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
PKN3-201ENST00000291906 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.6■■□□□ 1.85
PKN3-201ENST00000291906 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.59■■□□□ 1.85
PKN3-201ENST00000291906 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
PKN3-201ENST00000291906 NCAPD3P42695 1498 aa26.46■■□□□ 1.83
PKN3-201ENST00000291906 SYNJ1O43426 1573 aa26.42■■□□□ 1.82
PKN3-201ENST00000291906 HMGXB3Q12766 1538 aa26.32■■□□□ 1.8
PKN3-201ENST00000291906 EEA1Q15075 1411 aa26.3■■□□□ 1.8
PKN3-201ENST00000291906 CEP162Q5TB80 1403 aa26.29■■□□□ 1.8
PKN3-201ENST00000291906 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.22■■□□□ 1.79
PKN3-201ENST00000291906 GOLGA3Q08378 1498 aa26.19■■□□□ 1.78
PKN3-201ENST00000291906 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.17■■□□□ 1.78
PKN3-201ENST00000291906 CFTRP13569 1480 aa26.1■■□□□ 1.77
PKN3-201ENST00000291906 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.09■■□□□ 1.77
PKN3-201ENST00000291906 TOP2BQ02880 1626 aa26.07■■□□□ 1.76
PKN3-201ENST00000291906 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.05■■□□□ 1.76
PKN3-201ENST00000291906 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.04■■□□□ 1.76
PKN3-201ENST00000291906 CUX1P39880 1505 aa26.03■■□□□ 1.76
PKN3-201ENST00000291906 CLIP1P30622 1438 aa25.97■■□□□ 1.75
PKN3-201ENST00000291906 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.96■■□□□ 1.75
PKN3-201ENST00000291906 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PKN3-201ENST00000291906 APLP2Q06481 763 aa25.94■■□□□ 1.74
PKN3-201ENST00000291906 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.9■■□□□ 1.74
PKN3-201ENST00000291906 KIF27Q86VH2 1401 aa25.89■■□□□ 1.74
PKN3-201ENST00000291906 KIF21BO75037 1637 aa25.88■■□□□ 1.73
PKN3-201ENST00000291906 NESP48681 1621 aa25.87■■□□□ 1.73
PKN3-201ENST00000291906 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
PKN3-201ENST00000291906 CUX2O14529 1486 aa25.82■■□□□ 1.72
PKN3-201ENST00000291906 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
PKN3-201ENST00000291906 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.8■■□□□ 1.72
PKN3-201ENST00000291906 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
PKN3-201ENST00000291906 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.74■■□□□ 1.71
PKN3-201ENST00000291906 PRXQ9BXM0 1461 aa25.71■■□□□ 1.71
PKN3-201ENST00000291906 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.68■■□□□ 1.7
PKN3-201ENST00000291906 IGF1RP08069 1367 aa25.64■■□□□ 1.69
PKN3-201ENST00000291906 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.63■■□□□ 1.69
PKN3-201ENST00000291906 PRDM2Q13029 1718 aa25.63■■□□□ 1.69
PKN3-201ENST00000291906 P3H3Q8IVL6 736 aa25.61■■□□□ 1.69
PKN3-201ENST00000291906 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.6■■□□□ 1.69
PKN3-201ENST00000291906 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
PKN3-201ENST00000291906 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.57■■□□□ 1.68
PKN3-201ENST00000291906 TOPBP1Q92547 1522 aa25.51■■□□□ 1.67
PKN3-201ENST00000291906 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PKN3-201ENST00000291906 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PKN3-201ENST00000291906 ARAP1Q96P48 1450 aa25.47■■□□□ 1.67
PKN3-201ENST00000291906 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PKN3-201ENST00000291906 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.44■■□□□ 1.66
PKN3-201ENST00000291906 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.43■■□□□ 1.66
PKN3-201ENST00000291906 ITGAEP38570 1179 aa25.4■■□□□ 1.66
PKN3-201ENST00000291906 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
PKN3-201ENST00000291906 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.39■■□□□ 1.65
PKN3-201ENST00000291906 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.38■■□□□ 1.65
PKN3-201ENST00000291906 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.3■■□□□ 1.64
PKN3-201ENST00000291906 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.23■■□□□ 1.63
PKN3-201ENST00000291906 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.2■■□□□ 1.62
PKN3-201ENST00000291906 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.18■■□□□ 1.62
PKN3-201ENST00000291906 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PKN3-201ENST00000291906 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.612e-8■■■■■ 35.3
PKN3-201ENST00000291906 ARID3CA6NKF2 412 aa25.05■■□□□ 1.6
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