Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.8□□□□□ -2.286e-121■■■■■ 2049.7
DROSHAQ9NRR4 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.96□□□□□ -2.263e-87■■■■■ 886.2
DROSHAQ9NRR4 MMP25-AS1-207ENST00000573878 483 ntTSL 321.51■■□□□ 1.038e-231■■■■■ 559.8
DROSHAQ9NRR4 MMP25-AS1-205ENST00000572930 420 ntTSL 313.96□□□□□ -0.188e-231■■■■■ 559.8
DROSHAQ9NRR4 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.678e-231■■■■■ 559.8
DROSHAQ9NRR4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.371e-26■■■■■ 532.8
DROSHAQ9NRR4 COQ8A-204ENST00000476488 264 ntTSL 321.97■■□□□ 1.111e-8■■■■■ 469.5
DROSHAQ9NRR4 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.51□□□□□ -2.334e-62■■■■■ 439.2
DROSHAQ9NRR4 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.619e-25■■■■■ 436.8
DROSHAQ9NRR4 MIRLET7I-201ENST00000362309 84 ntBASIC17.56■□□□□ 0.49e-30■■■■■ 433.4
DROSHAQ9NRR4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.168e-25■■■■■ 428.2
DROSHAQ9NRR4 MIR17HG-203ENST00000582141 2845 ntTSL 1 (best)23.77■■□□□ 1.48e-25■■■■■ 428.2
DROSHAQ9NRR4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.642e-7■■■■■ 375.6
DROSHAQ9NRR4 HPCAL1-203ENST00000419810 4781 ntTSL 1 (best)16.21■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 375.6
DROSHAQ9NRR4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.363e-7■■■■■ 368.3
DROSHAQ9NRR4 HPCAL1-205ENST00000423674 586 ntTSL 435.1■■■■□ 3.213e-7■■■■■ 355.2
DROSHAQ9NRR4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.73e-7■■■■■ 355.2
DROSHAQ9NRR4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.134e-8■■■■■ 340.8
DROSHAQ9NRR4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.134e-8■■■■■ 340.8
DROSHAQ9NRR4 HDAC4-216ENST00000544989 342 ntTSL 518.11■□□□□ 0.495e-9■■■■■ 340.8
DROSHAQ9NRR4 HDAC4-210ENST00000493582 3188 ntTSL 1 (best)15.71■□□□□ 0.114e-8■■■■■ 340.8
DROSHAQ9NRR4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.027e-8■■■■■ 322.9
DROSHAQ9NRR4 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.387e-8■■■■■ 322.9
DROSHAQ9NRR4 COQ8A-209ENST00000489044 941 ntTSL 328.43■■■□□ 2.144e-7■■■■■ 320.3
DROSHAQ9NRR4 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.674e-18■■■■■ 304.4
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.972e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.012e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-215ENST00000586268 830 ntTSL 321.23■□□□□ 0.992e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-235ENST00000592601 551 ntTSL 521.23■□□□□ 0.992e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.672e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.492e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-219ENST00000587634 628 ntTSL 417.35■□□□□ 0.372e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-206ENST00000431212 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.122e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.172e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-221ENST00000588066 579 ntTSL 513.15□□□□□ -0.32e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-203ENST00000357895 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.352e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-201ENST00000256830 2920 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.412e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-214ENST00000586263 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.442e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.712e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.752e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.782e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 NEDD4L-222ENST00000588494 505 ntTSL 43.24□□□□□ -1.892e-19■■■■■ 288.6
DROSHAQ9NRR4 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.581e-23■■■■■ 283.6
DROSHAQ9NRR4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.537e-7■■■■■ 266
DROSHAQ9NRR4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.387e-7■■■■■ 266
DROSHAQ9NRR4 COQ8A-205ENST00000478406 3612 ntTSL 221.23■□□□□ 0.997e-7■■■■■ 266
DROSHAQ9NRR4 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.297e-7■■■■■ 266
DROSHAQ9NRR4 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.152e-23■■■■■ 262
DROSHAQ9NRR4 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC3.19□□□□□ -1.97e-14■■■■■ 250.8
DROSHAQ9NRR4 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.852e-46■■■■■ 248.1
DROSHAQ9NRR4 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.12□□□□□ -2.391e-24■■■■■ 247
DROSHAQ9NRR4 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.22□□□□□ -2.371e-97■■■■■ 242.2
DROSHAQ9NRR4 C22orf34-205ENST00000416411 542 ntTSL 421.33■■□□□ 13e-7■■■■■ 231.4
DROSHAQ9NRR4 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 231.4
DROSHAQ9NRR4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 18e-19■■■■■ 229.3
DROSHAQ9NRR4 MYO9B-210ENST00000597572 660 ntTSL 526.1■■□□□ 1.772e-45■■■■■ 227.3
DROSHAQ9NRR4 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81e-323■■■■■ 217.3
DROSHAQ9NRR4 WDR18-205ENST00000590354 678 ntTSL 223.37■■□□□ 1.333e-7■■■■■ 214.3
DROSHAQ9NRR4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.91■■□□□ 1.582e-37■■■■■ 209
DROSHAQ9NRR4 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.042e-51■■■■■ 208.7
DROSHAQ9NRR4 MIR135B-201ENST00000362189 97 ntBASIC12.63□□□□□ -0.393e-76■■■■■ 206.2
DROSHAQ9NRR4 MIR210-201ENST00000362168 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.114e-181■■■■■ 205.6
DROSHAQ9NRR4 WDR18-210ENST00000591997 577 ntTSL 331.56■■■□□ 2.646e-7■■■■■ 205.4
DROSHAQ9NRR4 WDR18-209ENST00000591985 1498 ntTSL 528.83■■■□□ 2.216e-7■■■■■ 205.4
DROSHAQ9NRR4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.086e-7■■■■■ 205.4
DROSHAQ9NRR4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.916e-7■■■■■ 205.4
DROSHAQ9NRR4 WDR18-211ENST00000607440 1397 ntTSL 525.88■■□□□ 1.736e-7■■■■■ 205.4
DROSHAQ9NRR4 WDR18-201ENST00000251289 1501 ntTSL 524.77■■□□□ 1.566e-7■■■■■ 205.4
DROSHAQ9NRR4 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.051e-56■■■■■ 201.8
DROSHAQ9NRR4 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC4.33□□□□□ -1.724e-166■■■■■ 200
DROSHAQ9NRR4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.56■■■□□ 2.961e-323■■■■■ 196.4
DROSHAQ9NRR4 PCGF3-206ENST00000433814 639 ntTSL 424.18■■□□□ 1.465e-7■■■■■ 192.9
DROSHAQ9NRR4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.323e-80■■■■■ 186.5
DROSHAQ9NRR4 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.77□□□□□ -2.132e-24■■■■■ 186.5
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.961e-24■■■■■ 185.6
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.851e-24■■■■■ 185.6
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP6-208ENST00000495242 5303 ntTSL 1 (best)19.74■□□□□ 0.751e-24■■■■■ 185.6
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP6-206ENST00000489330 6299 ntTSL 217.67■□□□□ 0.421e-24■■■■■ 185.6
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP6-205ENST00000380736 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.111e-24■■■■■ 185.6
DROSHAQ9NRR4 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC5.88□□□□□ -1.474e-28■■■■■ 184.5
DROSHAQ9NRR4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC24.8■■□□□ 1.561e-34■■■■■ 178.9
DROSHAQ9NRR4 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC12.7□□□□□ -0.388e-21■■■■■ 177.9
DROSHAQ9NRR4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.511e-42■■■■■ 174.2
DROSHAQ9NRR4 LRCH4-204ENST00000476881 1675 ntTSL 230.89■■■□□ 2.541e-42■■■■■ 170.5
DROSHAQ9NRR4 MIR671-201ENST00000390183 118 ntBASIC16.7■□□□□ 0.261e-43■■■■■ 169
DROSHAQ9NRR4 PFDN1-206ENST00000514611 1139 ntTSL 220.81■□□□□ 0.921e-20■■■■■ 166.9
DROSHAQ9NRR4 PFDN1-201ENST00000261813 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.421e-20■■■■■ 166.9
DROSHAQ9NRR4 PFDN1-205ENST00000512925 900 ntTSL 216.93■□□□□ 0.31e-20■■■■■ 166.9
DROSHAQ9NRR4 PFDN1-204ENST00000512707 798 ntTSL 216.48■□□□□ 0.231e-20■■■■■ 166.9
DROSHAQ9NRR4 PFDN1-203ENST00000510217 1091 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.131e-20■■■■■ 166.9
DROSHAQ9NRR4 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.061e-20■■■■■ 166.9
DROSHAQ9NRR4 LRCH4-205ENST00000485554 774 ntTSL 328■■■□□ 2.071e-42■■■■■ 166.3
DROSHAQ9NRR4 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC10.99□□□□□ -0.658e-29■■■■■ 166.2
DROSHAQ9NRR4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.138e-11■■■■■ 165.3
DROSHAQ9NRR4 SMYD3-210ENST00000470863 983 ntTSL 224.3■■□□□ 1.488e-11■■■■■ 165.3
DROSHAQ9NRR4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.338e-11■■■■■ 165.3
DROSHAQ9NRR4 SMYD3-207ENST00000462422 971 ntTSL 519.91■□□□□ 0.788e-11■■■■■ 165.3
DROSHAQ9NRR4 SMYD3-206ENST00000455277 566 ntTSL 513.83□□□□□ -0.198e-11■■■■■ 165.3
DROSHAQ9NRR4 DIP2C-203ENST00000421992 757 ntTSL 519.56■□□□□ 0.722e-9■■■■■ 162.9
DROSHAQ9NRR4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.491e-42■■■■■ 160.8
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