Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 SMC4-205ENST00000465563 747 ntTSL 24□□□□□ -1.772e-12■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 SMC4-207ENST00000467263 401 ntTSL 23.53□□□□□ -1.842e-12■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 NPAS2-205ENST00000450763 607 ntTSL 414.68□□□□□ -0.063e-6■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 NPAS2-208ENST00000474550 7983 ntTSL 1 (best)10.87□□□□□ -0.673e-6■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 NAP1L4-206ENST00000469089 707 ntTSL 313.58□□□□□ -0.243e-10■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 TOP3B-205ENST00000434517 736 ntTSL 520.9■□□□□ 0.947e-36■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 TOP3B-217ENST00000489581 789 ntTSL 215.67■□□□□ 0.17e-36■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 TOP3B-211ENST00000449704 543 ntTSL 315.17■□□□□ 0.027e-36■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 TOP3B-204ENST00000430142 582 ntTSL 213.91□□□□□ -0.187e-36■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 TOP3B-207ENST00000437103 571 ntTSL 411.62□□□□□ -0.557e-36■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 TOP3B-203ENST00000424393 824 ntTSL 510.54□□□□□ -0.727e-36■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 TOP3B-212ENST00000456075 561 ntTSL 49.92□□□□□ -0.827e-36■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 TOP3B-209ENST00000442653 400 ntTSL 37.7□□□□□ -1.187e-36■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 TOP3B-208ENST00000437929 550 ntTSL 46.23□□□□□ -1.417e-36■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 TFRC-214ENST00000483983 757 ntTSL 24.79□□□□□ -1.641e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 TNFRSF14-203ENST00000426449 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.34□□□□□ -0.431e-6■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 YDJC-205ENST00000468686 1423 ntTSL 1 (best)20.43■□□□□ 0.861e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 YDJC-207ENST00000482998 1388 ntTSL 519.15■□□□□ 0.661e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 YDJC-204ENST00000464015 1613 ntTSL 1 (best)19.04■□□□□ 0.641e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 YDJC-206ENST00000473985 1494 ntTSL 518.64■□□□□ 0.571e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 YDJC-203ENST00000415762 1410 ntTSL 1 (best)17.7■□□□□ 0.421e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.271e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.251e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 FANCA-207ENST00000561667 528 ntTSL 410.94□□□□□ -0.667e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.716e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.596e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.346e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.956e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.396e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.016e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PKM-214ENST00000565143 2301 ntTSL 1 (best)13.36□□□□□ -0.276e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PKM-222ENST00000568883 1863 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.36e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PKM-202ENST00000335181 2318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.356e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PKM-219ENST00000567118 2254 ntTSL 211.57□□□□□ -0.566e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PKM-205ENST00000561609 1568 ntTSL 1 (best)11.52□□□□□ -0.576e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PKM-212ENST00000564440 3016 ntTSL 1 (best)9.44□□□□□ -0.96e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 GGA2-207ENST00000566651 332 ntTSL 37.95□□□□□ -1.144e-9■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.921e-10■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 SF3B3-215ENST00000577085 529 ntTSL 414.59□□□□□ -0.072e-17■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 SF3B3-207ENST00000566095 453 ntTSL 39.74□□□□□ -0.852e-17■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 SF3B3-210ENST00000567654 334 ntTSL 35.87□□□□□ -1.472e-17■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 USP10-216ENST00000569511 571 ntTSL 517.56■□□□□ 0.43e-16■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 USP10-211ENST00000564566 561 ntTSL 415.66■□□□□ 0.13e-16■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 SMURF2P1-202ENST00000579301 570 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.863e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 AC005562.1-202ENST00000398849 1411 ntTSL 28.01□□□□□ -1.133e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.23□□□□□ -2.053e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 DHX15-208ENST00000512903 2071 ntTSL 23.67□□□□□ -1.827e-9■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 TMEM168-204ENST00000447395 1291 ntTSL 215.6■□□□□ 0.092e-10■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.222e-10■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 TMEM168-203ENST00000441474 570 ntTSL 412.13□□□□□ -0.472e-10■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 TMEM168-206ENST00000454074 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.782e-10■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 TMEM168-205ENST00000449743 775 ntTSL 39.15□□□□□ -0.942e-10■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 NISCH-209ENST00000485765 563 ntTSL 418.14■□□□□ 0.493e-12■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.223e-12■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.153e-12■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.075e-7■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 KANK1-201ENST00000354485 6912 ntTSL 28.62□□□□□ -1.034e-16■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 AC008760.2-201ENST00000614781 1357 ntBASIC11.14□□□□□ -0.633e-8■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 WDR27-210ENST00000496752 1562 ntTSL 518.73■□□□□ 0.591e-6■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.112e-6■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PRKAA1-208ENST00000511248 668 ntTSL 29.85□□□□□ -0.832e-6■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PRKAA1-203ENST00000397006 425 ntTSL 38.4□□□□□ -1.062e-6■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PRKAA1-206ENST00000506652 1082 ntTSL 58.11□□□□□ -1.112e-6■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PRKAA1-201ENST00000296800 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.182e-6■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.542e-6■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 PRKAA1-207ENST00000509874 692 ntTSL 45.09□□□□□ -1.592e-6■□□□□ 10.1
EFTUD2Q15029 UBAP2L-213ENST00000466173 804 ntTSL 25.46□□□□□ -1.541e-14■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CDS2-206ENST00000486875 709 ntTSL 211.52□□□□□ -0.571e-11■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 NLGN2-203ENST00000572893 305 ntTSL 324.12■■□□□ 1.456e-7■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.646e-7■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.187e-15■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.037e-15■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CRLS1-207ENST00000609154 977 ntTSL 1 (best)3.51□□□□□ -1.857e-15■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CRLS1-206ENST00000489345 644 ntTSL 53.33□□□□□ -1.887e-15■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.957e-15■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 SH3TC1-214ENST00000508183 1410 ntTSL 1 (best)18.31■□□□□ 0.523e-6■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 SH3TC1-220ENST00000511002 1124 ntTSL 515.22■□□□□ 0.033e-6■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 SH3TC1-204ENST00000502350 2258 ntTSL 214.67□□□□□ -0.063e-6■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 SH3TC1-205ENST00000502559 3798 ntTSL 213.77□□□□□ -0.213e-6■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.412e-11■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 SREK1-207ENST00000520058 559 ntTSL 217.6■□□□□ 0.412e-11■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 SREK1-212ENST00000522912 2047 ntTSL 1 (best)17.35■□□□□ 0.372e-11■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 SREK1-214ENST00000523851 458 ntTSL 315.39■□□□□ 0.052e-11■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 SREK1-209ENST00000520953 2172 ntTSL 515.17■□□□□ 0.022e-11■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 SREK1-202ENST00000334121 6781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.522e-11■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 SREK1-215ENST00000524111 4074 ntTSL 59.12□□□□□ -0.952e-11■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.422e-11■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 SREK1-210ENST00000521691 580 ntTSL 32.31□□□□□ -2.042e-11■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CPSF4-203ENST00000430038 735 ntTSL 515.94■□□□□ 0.148e-6■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 WNK2-215ENST00000478583 537 ntTSL 411.12□□□□□ -0.638e-6■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 CPSF4-202ENST00000412686 745 ntTSL 57.52□□□□□ -1.218e-6■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.031e-11■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 ITIH3-209ENST00000493136 2179 ntTSL 214.35□□□□□ -0.111e-74■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC5.98□□□□□ -1.451e-11■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 GPR107-205ENST00000462907 389 ntTSL 54.32□□□□□ -1.727e-9■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 LARS-215ENST00000514104 509 ntTSL 27.41□□□□□ -1.228e-13■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 RBM39-226ENST00000468086 549 ntTSL 43.77□□□□□ -1.818e-13■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.93□□□□□ -2.268e-13■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 PFKP-210ENST00000468050 425 ntTSL 314.76□□□□□ -0.052e-6■□□□□ 10
EFTUD2Q15029 PFKP-204ENST00000407806 705 ntTSL 513.71□□□□□ -0.212e-6■□□□□ 10
Retrieved 100 of 48,698 protein–RNA pairs in 3295.9 ms