RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.68■■■□□ 2.82
NISCH-202ENST00000420808 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.06■■■□□ 2.08
NISCH-202ENST00000420808 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.71■■■□□ 2.03
NISCH-202ENST00000420808 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
NISCH-202ENST00000420808 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
NISCH-202ENST00000420808 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.33■■□□□ 1.97
NISCH-202ENST00000420808 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.66■■□□□ 1.86
NISCH-202ENST00000420808 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.53■■□□□ 1.84
NISCH-202ENST00000420808 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.52■■□□□ 1.84
NISCH-202ENST00000420808 SCRIBQ14160 1630 aa26.18■■□□□ 1.78
NISCH-202ENST00000420808 ABCC9O60706 1549 aa26.05■■□□□ 1.76
NISCH-202ENST00000420808 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
NISCH-202ENST00000420808 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.87■■□□□ 1.73
NISCH-202ENST00000420808 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.67■■□□□ 1.7
NISCH-202ENST00000420808 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.66■■□□□ 1.7
NISCH-202ENST00000420808 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.65■■□□□ 1.7
NISCH-202ENST00000420808 NACADO15069 1562 aa25.65■■□□□ 1.7
NISCH-202ENST00000420808 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.51■■□□□ 1.67
NISCH-202ENST00000420808 HRCP23327 699 aa25.49■■□□□ 1.67
NISCH-202ENST00000420808 TRIM41Q8WV44 630 aa25.42■■□□□ 1.66
NISCH-202ENST00000420808 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
NISCH-202ENST00000420808 WIZO95785 1651 aa25.38■■□□□ 1.65
NISCH-202ENST00000420808 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.3■■□□□ 1.64
NISCH-202ENST00000420808 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
NISCH-202ENST00000420808 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
NISCH-202ENST00000420808 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.07■■□□□ 1.6
NISCH-202ENST00000420808 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
NISCH-202ENST00000420808 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
NISCH-202ENST00000420808 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
NISCH-202ENST00000420808 SMARCA4P51532 1647 aa24.92■■□□□ 1.58
NISCH-202ENST00000420808 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
NISCH-202ENST00000420808 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.83■■□□□ 1.57
NISCH-202ENST00000420808 ABCC8Q09428 1581 aa24.83■■□□□ 1.57
NISCH-202ENST00000420808 SMARCA2P51531 1590 aa24.78■■□□□ 1.56
NISCH-202ENST00000420808 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.74■■□□□ 1.55
NISCH-202ENST00000420808 SOGA1O94964 1423 aa24.56■■□□□ 1.52
NISCH-202ENST00000420808 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.49■■□□□ 1.51
NISCH-202ENST00000420808 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
NISCH-202ENST00000420808 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.36■■□□□ 1.49
NISCH-202ENST00000420808 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.32■■□□□ 1.48
NISCH-202ENST00000420808 CEP162Q5TB80 1403 aa24.31■■□□□ 1.48
NISCH-202ENST00000420808 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.29■■□□□ 1.48
NISCH-202ENST00000420808 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.48
NISCH-202ENST00000420808 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
NISCH-202ENST00000420808 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
NISCH-202ENST00000420808 SYNJ1O43426 1573 aa24.24■■□□□ 1.47
NISCH-202ENST00000420808 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
NISCH-202ENST00000420808 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
NISCH-202ENST00000420808 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.2■■□□□ 1.46
NISCH-202ENST00000420808 EEA1Q15075 1411 aa24.13■■□□□ 1.45
NISCH-202ENST00000420808 GOLGA3Q08378 1498 aa24.08■■□□□ 1.45
NISCH-202ENST00000420808 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
NISCH-202ENST00000420808 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
NISCH-202ENST00000420808 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.94■■□□□ 1.42
NISCH-202ENST00000420808 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.93■■□□□ 1.42
NISCH-202ENST00000420808 KIF21BO75037 1637 aa23.9■■□□□ 1.42
NISCH-202ENST00000420808 CLIP1P30622 1438 aa23.86■■□□□ 1.41
NISCH-202ENST00000420808 TOP2BQ02880 1626 aa23.85■■□□□ 1.41
NISCH-202ENST00000420808 NCAPD3P42695 1498 aa23.79■■□□□ 1.4
NISCH-202ENST00000420808 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.75■■□□□ 1.39
NISCH-202ENST00000420808 HMGXB3Q12766 1538 aa23.75■■□□□ 1.39
NISCH-202ENST00000420808 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
NISCH-202ENST00000420808 CUX1P39880 1505 aa23.72■■□□□ 1.39
NISCH-202ENST00000420808 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.71■■□□□ 1.39
NISCH-202ENST00000420808 CFTRP13569 1480 aa23.61■■□□□ 1.37
NISCH-202ENST00000420808 PRXQ9BXM0 1461 aa23.61■■□□□ 1.37
NISCH-202ENST00000420808 APLP2Q06481 763 aa23.55■■□□□ 1.36
NISCH-202ENST00000420808 ARAP1Q96P48 1450 aa23.53■■□□□ 1.36
NISCH-202ENST00000420808 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
NISCH-202ENST00000420808 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.51■■□□□ 1.35
NISCH-202ENST00000420808 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
NISCH-202ENST00000420808 KIF27Q86VH2 1401 aa23.48■■□□□ 1.35
NISCH-202ENST00000420808 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
NISCH-202ENST00000420808 CUX2O14529 1486 aa23.37■■□□□ 1.33
NISCH-202ENST00000420808 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.37■■□□□ 1.33
NISCH-202ENST00000420808 PRDM2Q13029 1718 aa23.35■■□□□ 1.33
NISCH-202ENST00000420808 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.34■■□□□ 1.33
NISCH-202ENST00000420808 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.34■■□□□ 1.33
NISCH-202ENST00000420808 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
NISCH-202ENST00000420808 IGF1RP08069 1367 aa23.32■■□□□ 1.32
NISCH-202ENST00000420808 NEUROD1Q13562 356 aa23.32■■□□□ 1.32
NISCH-202ENST00000420808 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.31■■□□□ 1.32
NISCH-202ENST00000420808 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
NISCH-202ENST00000420808 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.2■■□□□ 1.3
NISCH-202ENST00000420808 NESP48681 1621 aa23.19■■□□□ 1.3
NISCH-202ENST00000420808 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.18■■□□□ 1.3
NISCH-202ENST00000420808 ITGAEP38570 1179 aa23.18■■□□□ 1.3
NISCH-202ENST00000420808 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
NISCH-202ENST00000420808 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.16■■□□□ 1.3
NISCH-202ENST00000420808 P3H3Q8IVL6 736 aa23.15■■□□□ 1.3
NISCH-202ENST00000420808 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
NISCH-202ENST00000420808 MIER1Q8N108 512 aa23.1■■□□□ 1.29
NISCH-202ENST00000420808 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
NISCH-202ENST00000420808 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.07■■□□□ 1.28
NISCH-202ENST00000420808 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.07■■□□□ 1.28
NISCH-202ENST00000420808 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
NISCH-202ENST00000420808 TOPBP1Q92547 1522 aa23.03■■□□□ 1.28
NISCH-202ENST00000420808 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.02■■□□□ 1.28
NISCH-202ENST00000420808 TIAM1Q13009 1591 aa23.01■■□□□ 1.27
NISCH-202ENST00000420808 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
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