RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449704.5

TOP3B-211, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 3

Gene TOP3B, Length 543 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-211ENST00000449704 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.82■■■■□ 3.64
TOP3B-211ENST00000449704 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.45■■■□□ 2.95
TOP3B-211ENST00000449704 ABCC9O60706 1549 aa32.89■■■□□ 2.86
TOP3B-211ENST00000449704 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.82■■■□□ 2.68
TOP3B-211ENST00000449704 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.56■■■□□ 2.64
TOP3B-211ENST00000449704 NACADO15069 1562 aa31.53■■■□□ 2.64
TOP3B-211ENST00000449704 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
TOP3B-211ENST00000449704 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.33■■■□□ 2.61
TOP3B-211ENST00000449704 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.23■■■□□ 2.59
TOP3B-211ENST00000449704 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.84■■■□□ 2.53
TOP3B-211ENST00000449704 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.7■■■□□ 2.5
TOP3B-211ENST00000449704 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.67■■■□□ 2.5
TOP3B-211ENST00000449704 SCRIBQ14160 1630 aa30.66■■■□□ 2.5
TOP3B-211ENST00000449704 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.58■■■□□ 2.49
TOP3B-211ENST00000449704 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.24■■■□□ 2.43
TOP3B-211ENST00000449704 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
TOP3B-211ENST00000449704 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.66■■■□□ 2.34
TOP3B-211ENST00000449704 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.53■■■□□ 2.32
TOP3B-211ENST00000449704 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
TOP3B-211ENST00000449704 SMARCA4P51532 1647 aa29.28■■■□□ 2.28
TOP3B-211ENST00000449704 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.18■■■□□ 2.26
TOP3B-211ENST00000449704 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.17■■■□□ 2.26
TOP3B-211ENST00000449704 NCAPD3P42695 1498 aa29.15■■■□□ 2.26
TOP3B-211ENST00000449704 SMARCA2P51531 1590 aa29.11■■■□□ 2.25
TOP3B-211ENST00000449704 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
TOP3B-211ENST00000449704 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.96■■■□□ 2.23
TOP3B-211ENST00000449704 HMGXB3Q12766 1538 aa28.94■■■□□ 2.22
TOP3B-211ENST00000449704 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
TOP3B-211ENST00000449704 WIZO95785 1651 aa28.81■■■□□ 2.2
TOP3B-211ENST00000449704 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.6■■■□□ 2.17
TOP3B-211ENST00000449704 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
TOP3B-211ENST00000449704 NESP48681 1621 aa28.46■■■□□ 2.15
TOP3B-211ENST00000449704 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
TOP3B-211ENST00000449704 ERCC6Q03468 1493 aa28.35■■■□□ 2.13
TOP3B-211ENST00000449704 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.35■■■□□ 2.13
TOP3B-211ENST00000449704 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.3■■■□□ 2.12
TOP3B-211ENST00000449704 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.24■■■□□ 2.11
TOP3B-211ENST00000449704 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.22■■■□□ 2.11
TOP3B-211ENST00000449704 CFTRP13569 1480 aa28.15■■■□□ 2.1
TOP3B-211ENST00000449704 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28■■■□□ 2.07
TOP3B-211ENST00000449704 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.99■■■□□ 2.07
TOP3B-211ENST00000449704 CUX2O14529 1486 aa27.95■■■□□ 2.06
TOP3B-211ENST00000449704 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.95■■■□□ 2.06
TOP3B-211ENST00000449704 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
TOP3B-211ENST00000449704 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.89■■■□□ 2.05
TOP3B-211ENST00000449704 WDR62O43379 1518 aa27.73■■■□□ 2.03
TOP3B-211ENST00000449704 PRDM2Q13029 1718 aa27.72■■■□□ 2.03
TOP3B-211ENST00000449704 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
TOP3B-211ENST00000449704 TOPBP1Q92547 1522 aa27.54■■■□□ 2
TOP3B-211ENST00000449704 ABCC8Q09428 1581 aa27.52■■■□□ 2
TOP3B-211ENST00000449704 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.47■■□□□ 1.99
TOP3B-211ENST00000449704 IFT140Q96RY7 1462 aa27.36■■□□□ 1.97
TOP3B-211ENST00000449704 CUX1P39880 1505 aa27.35■■□□□ 1.97
TOP3B-211ENST00000449704 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
TOP3B-211ENST00000449704 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.26■■□□□ 1.95
TOP3B-211ENST00000449704 SOGA1O94964 1423 aa27.26■■□□□ 1.95
TOP3B-211ENST00000449704 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
TOP3B-211ENST00000449704 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.25■■□□□ 1.95
TOP3B-211ENST00000449704 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.24■■□□□ 1.95
TOP3B-211ENST00000449704 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
TOP3B-211ENST00000449704 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.14■■□□□ 1.948e-7■■■■□ 23.5
TOP3B-211ENST00000449704 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
TOP3B-211ENST00000449704 SYNJ1O43426 1573 aa27.1■■□□□ 1.93
TOP3B-211ENST00000449704 TOP2BQ02880 1626 aa27.08■■□□□ 1.93
TOP3B-211ENST00000449704 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
TOP3B-211ENST00000449704 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.03■■□□□ 1.92
TOP3B-211ENST00000449704 TRIM41Q8WV44 630 aa27.02■■□□□ 1.92
TOP3B-211ENST00000449704 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.98■■□□□ 1.91
TOP3B-211ENST00000449704 OSCARQ8IYS5 282 aa26.93■■□□□ 1.9
TOP3B-211ENST00000449704 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.92■■□□□ 1.9
TOP3B-211ENST00000449704 FBLN2P98095 1184 aa26.91■■□□□ 1.9
TOP3B-211ENST00000449704 WDR97A6NE52 1622 aa26.9■■□□□ 1.9
TOP3B-211ENST00000449704 GRIN2BQ13224 1484 aa26.89■■□□□ 1.9
TOP3B-211ENST00000449704 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.86■■□□□ 1.89
TOP3B-211ENST00000449704 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
TOP3B-211ENST00000449704 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.79■■□□□ 1.88
TOP3B-211ENST00000449704 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
TOP3B-211ENST00000449704 PBRM1Q86U86 1689 aa26.7■■□□□ 1.87
TOP3B-211ENST00000449704 SYNJ2O15056 1496 aa26.69■■□□□ 1.86
TOP3B-211ENST00000449704 KIF27Q86VH2 1401 aa26.68■■□□□ 1.86
TOP3B-211ENST00000449704 CHD1O14646 1710 aa26.66■■□□□ 1.86
TOP3B-211ENST00000449704 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.64■■□□□ 1.85
TOP3B-211ENST00000449704 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.61■■□□□ 1.85
TOP3B-211ENST00000449704 IGF1RP08069 1367 aa26.58■■□□□ 1.85
TOP3B-211ENST00000449704 ADAMTS12P58397 1594 aa26.57■■□□□ 1.84
TOP3B-211ENST00000449704 GRIN2AQ12879 1464 aa26.53■■□□□ 1.84
TOP3B-211ENST00000449704 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.46■■□□□ 1.83
TOP3B-211ENST00000449704 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.45■■□□□ 1.82
TOP3B-211ENST00000449704 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.45■■□□□ 1.82
TOP3B-211ENST00000449704 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.42■■□□□ 1.82
TOP3B-211ENST00000449704 NUP160Q12769 1436 aa26.4■■□□□ 1.82
TOP3B-211ENST00000449704 ARHGEF11O15085 1522 aa26.39■■□□□ 1.81
TOP3B-211ENST00000449704 CEP170Q5SW79 1584 aa26.36■■□□□ 1.81
TOP3B-211ENST00000449704 CUL7Q14999 1698 aa26.35■■□□□ 1.81
TOP3B-211ENST00000449704 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.34■■□□□ 1.81
TOP3B-211ENST00000449704 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.34■■□□□ 1.81
TOP3B-211ENST00000449704 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.34■■□□□ 1.81
TOP3B-211ENST00000449704 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.29■■□□□ 1.8
TOP3B-211ENST00000449704 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
TOP3B-211ENST00000449704 JPH4Q96JJ6 628 aa26.25■■□□□ 1.79
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