RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468050.1

PFKP-210, Transcript of phosphofructokinase, platelet, humanhuman

TSL 3

Gene PFKP, Length 425 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKP-210ENST00000468050 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.53■■■■□ 3.6
PFKP-210ENST00000468050 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.28■■■□□ 2.92
PFKP-210ENST00000468050 ABCC9O60706 1549 aa32.81■■■□□ 2.84
PFKP-210ENST00000468050 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.53■■■□□ 2.64
PFKP-210ENST00000468050 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.43■■■□□ 2.62
PFKP-210ENST00000468050 NACADO15069 1562 aa31.38■■■□□ 2.61
PFKP-210ENST00000468050 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
PFKP-210ENST00000468050 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.15■■■□□ 2.58
PFKP-210ENST00000468050 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31■■■□□ 2.55
PFKP-210ENST00000468050 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.73■■■□□ 2.51
PFKP-210ENST00000468050 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.67■■■□□ 2.5
PFKP-210ENST00000468050 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.54■■■□□ 2.48
PFKP-210ENST00000468050 SCRIBQ14160 1630 aa30.45■■■□□ 2.47
PFKP-210ENST00000468050 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.31■■■□□ 2.44
PFKP-210ENST00000468050 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.11■■■□□ 2.41
PFKP-210ENST00000468050 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
PFKP-210ENST00000468050 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.61■■■□□ 2.33
PFKP-210ENST00000468050 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.47■■■□□ 2.31
PFKP-210ENST00000468050 SMARCA4P51532 1647 aa29.1■■■□□ 2.25
PFKP-210ENST00000468050 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
PFKP-210ENST00000468050 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.03■■■□□ 2.24
PFKP-210ENST00000468050 NCAPD3P42695 1498 aa29.02■■■□□ 2.24
PFKP-210ENST00000468050 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.96■■■□□ 2.23
PFKP-210ENST00000468050 SMARCA2P51531 1590 aa28.92■■■□□ 2.22
PFKP-210ENST00000468050 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.8■■■□□ 2.2
PFKP-210ENST00000468050 HMGXB3Q12766 1538 aa28.79■■■□□ 2.2
PFKP-210ENST00000468050 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
PFKP-210ENST00000468050 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
PFKP-210ENST00000468050 WIZO95785 1651 aa28.6■■■□□ 2.17
PFKP-210ENST00000468050 NESP48681 1621 aa28.38■■■□□ 2.13
PFKP-210ENST00000468050 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
PFKP-210ENST00000468050 ERCC6Q03468 1493 aa28.24■■■□□ 2.11
PFKP-210ENST00000468050 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.19■■■□□ 2.1
PFKP-210ENST00000468050 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.19■■■□□ 2.1
PFKP-210ENST00000468050 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.06■■■□□ 2.08
PFKP-210ENST00000468050 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.01■■■□□ 2.07
PFKP-210ENST00000468050 CFTRP13569 1480 aa27.98■■■□□ 2.07
PFKP-210ENST00000468050 CUX2O14529 1486 aa27.95■■■□□ 2.06
PFKP-210ENST00000468050 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.93■■■□□ 2.06
PFKP-210ENST00000468050 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
PFKP-210ENST00000468050 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
PFKP-210ENST00000468050 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.83■■■□□ 2.05
PFKP-210ENST00000468050 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.77■■■□□ 2.04
PFKP-210ENST00000468050 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.76■■■□□ 2.04
PFKP-210ENST00000468050 WDR62O43379 1518 aa27.65■■■□□ 2.02
PFKP-210ENST00000468050 PRDM2Q13029 1718 aa27.58■■■□□ 2.01
PFKP-210ENST00000468050 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
PFKP-210ENST00000468050 TOPBP1Q92547 1522 aa27.37■■□□□ 1.97
PFKP-210ENST00000468050 ABCC8Q09428 1581 aa27.33■■□□□ 1.97
PFKP-210ENST00000468050 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.31■■□□□ 1.96
PFKP-210ENST00000468050 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.29■■□□□ 1.96
PFKP-210ENST00000468050 IFT140Q96RY7 1462 aa27.21■■□□□ 1.95
PFKP-210ENST00000468050 CUX1P39880 1505 aa27.15■■□□□ 1.94
PFKP-210ENST00000468050 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
PFKP-210ENST00000468050 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
PFKP-210ENST00000468050 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.07■■□□□ 1.92
PFKP-210ENST00000468050 SOGA1O94964 1423 aa27.07■■□□□ 1.92
PFKP-210ENST00000468050 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.06■■□□□ 1.92
PFKP-210ENST00000468050 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
PFKP-210ENST00000468050 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27■■□□□ 1.915e-9■■■■□ 20.6
PFKP-210ENST00000468050 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
PFKP-210ENST00000468050 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.95■■□□□ 1.9
PFKP-210ENST00000468050 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
PFKP-210ENST00000468050 OSCARQ8IYS5 282 aa26.88■■□□□ 1.89
PFKP-210ENST00000468050 SYNJ1O43426 1573 aa26.87■■□□□ 1.89
PFKP-210ENST00000468050 TOP2BQ02880 1626 aa26.84■■□□□ 1.89
PFKP-210ENST00000468050 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.82■■□□□ 1.88
PFKP-210ENST00000468050 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
PFKP-210ENST00000468050 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.79■■□□□ 1.88
PFKP-210ENST00000468050 WDR97A6NE52 1622 aa26.76■■□□□ 1.87
PFKP-210ENST00000468050 FBLN2P98095 1184 aa26.72■■□□□ 1.87
PFKP-210ENST00000468050 GRIN2BQ13224 1484 aa26.72■■□□□ 1.87
PFKP-210ENST00000468050 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.72■■□□□ 1.87
PFKP-210ENST00000468050 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.7■■□□□ 1.87
PFKP-210ENST00000468050 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.65■■□□□ 1.86
PFKP-210ENST00000468050 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PFKP-210ENST00000468050 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PFKP-210ENST00000468050 CHD1O14646 1710 aa26.6■■□□□ 1.85
PFKP-210ENST00000468050 PBRM1Q86U86 1689 aa26.57■■□□□ 1.84
PFKP-210ENST00000468050 SYNJ2O15056 1496 aa26.55■■□□□ 1.84
PFKP-210ENST00000468050 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.44■■□□□ 1.82
PFKP-210ENST00000468050 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.4■■□□□ 1.82
PFKP-210ENST00000468050 ADAMTS12P58397 1594 aa26.39■■□□□ 1.82
PFKP-210ENST00000468050 TRIM41Q8WV44 630 aa26.39■■□□□ 1.82
PFKP-210ENST00000468050 KIF27Q86VH2 1401 aa26.39■■□□□ 1.81
PFKP-210ENST00000468050 ARHGEF11O15085 1522 aa26.37■■□□□ 1.81
PFKP-210ENST00000468050 GRIN2AQ12879 1464 aa26.36■■□□□ 1.81
PFKP-210ENST00000468050 IGF1RP08069 1367 aa26.36■■□□□ 1.81
PFKP-210ENST00000468050 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.36■■□□□ 1.81
PFKP-210ENST00000468050 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.36■■□□□ 1.81
PFKP-210ENST00000468050 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.36■■□□□ 1.81
PFKP-210ENST00000468050 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.36■■□□□ 1.81
PFKP-210ENST00000468050 NUP160Q12769 1436 aa26.27■■□□□ 1.8
PFKP-210ENST00000468050 CEP170Q5SW79 1584 aa26.24■■□□□ 1.79
PFKP-210ENST00000468050 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.23■■□□□ 1.79
PFKP-210ENST00000468050 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.19■■□□□ 1.78
PFKP-210ENST00000468050 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.18■■□□□ 1.78
PFKP-210ENST00000468050 ARAP1Q96P48 1450 aa26.17■■□□□ 1.78
PFKP-210ENST00000468050 CUL7Q14999 1698 aa26.12■■□□□ 1.77
PFKP-210ENST00000468050 JPH4Q96JJ6 628 aa26.08■■□□□ 1.77
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