Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 EFTUD2-206ENST00000586654 585 ntTSL 211.93□□□□□ -0.51e-6■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 AHSA1-207ENST00000555473 561 ntTSL 215.39■□□□□ 0.059e-7■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.081e-6■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 ARID1A-212ENST00000636219 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.33□□□□□ -0.281e-6■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.334e-6■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.744e-6■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.494e-6■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.411e-6■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 CNDP2-202ENST00000324301 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.111e-6■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 CNDP2-209ENST00000579847 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.191e-6■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 VCP-204ENST00000466100 508 ntTSL 213.8□□□□□ -0.27e-11■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 HSPA8-219ENST00000532780 1194 ntTSL 222.21■■□□□ 1.154e-8■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 FDFT1-213ENST00000528729 570 ntTSL 38.43□□□□□ -1.061e-10■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 SPTAN1-223ENST00000630866 7498 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.712e-7■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 APEX1-205ENST00000553555 1603 ntTSL 1 (best)17.01■□□□□ 0.311e-8■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.241e-8■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 APEX1-211ENST00000555839 952 ntTSL 216.42■□□□□ 0.221e-8■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 APEX1-219ENST00000557365 831 ntTSL 314.86□□□□□ -0.031e-8■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 APEX1-216ENST00000557159 1803 ntTSL 214.52□□□□□ -0.081e-8■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 APEX1-210ENST00000555414 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.11e-8■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 APEX1-202ENST00000398030 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11e-8■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 APEX1-206ENST00000553681 899 ntTSL 313.85□□□□□ -0.191e-8■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 APEX1-214ENST00000557054 888 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.91e-8■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 HECTD1-217ENST00000557369 554 ntTSL 46.28□□□□□ -1.44e-8■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.362e-7■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.252e-7■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 XRCC6-206ENST00000428575 2148 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.282e-7■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 XRCC6-204ENST00000405506 1958 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.42e-7■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 XRCC6-203ENST00000402580 2006 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.412e-7■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 XRCC6-205ENST00000405878 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.522e-7■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 SND1-209ENST00000470723 568 ntTSL 415.68■□□□□ 0.13e-8■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 SEC23A-212ENST00000556092 571 ntTSL 417.42■□□□□ 0.381e-8■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 ANXA7-203ENST00000394847 648 ntTSL 513.22□□□□□ -0.293e-7■■■□□ 18.5
G3BP1Q13283 LAP3-204ENST00000507960 435 ntTSL 511.25□□□□□ -0.613e-6■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 PSMA6-208ENST00000554843 655 ntTSL 218.38■□□□□ 0.537e-9■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 MAP4-201ENST00000335271 1564 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.92■□□□□ 0.624e-7■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 MAP4-208ENST00000429422 3724 ntTSL 1 (best)13.53□□□□□ -0.244e-7■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 MAP4-205ENST00000420772 3478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.544e-7■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 FKBP4-207ENST00000544366 287 ntTSL 34.02□□□□□ -1.772e-6■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 UGDH-211ENST00000515021 861 ntTSL 523.05■■□□□ 1.283e-12■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 MAGED1-206ENST00000473931 950 ntTSL 210.19□□□□□ -0.786e-8■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 G6PD-205ENST00000439227 1074 ntTSL 519.68■□□□□ 0.742e-6■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 MYLK-210ENST00000504946 2404 ntTSL 1 (best)18.84■□□□□ 0.613e-7■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 FLNA-217ENST00000498411 368 ntTSL 318.83■□□□□ 0.65e-10■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.54■■□□□ 1.529e-7■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.48■■□□□ 1.199e-7■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 PHGDH-232ENST00000641947 1774 nt21.67■■□□□ 1.069e-7■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.999e-7■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 PHGDH-211ENST00000641213 2053 nt20.73■□□□□ 0.919e-7■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.919e-7■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 PHGDH-229ENST00000641891 2175 nt20.62■□□□□ 0.899e-7■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.839e-7■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 PHGDH-216ENST00000641375 2196 nt20.19■□□□□ 0.829e-7■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 PHGDH-233ENST00000642021 2794 nt16.51■□□□□ 0.239e-7■■■□□ 18.4
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G3BP1Q13283 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.317e-11■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.96e-7■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.138e-9■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.118e-9■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.468e-9■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 MYL6-208ENST00000547703 675 ntTSL 515.18■□□□□ 0.028e-9■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 MYL6-212ENST00000548725 582 ntTSL 214.98□□□□□ -0.018e-9■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 MYL6-214ENST00000549392 411 ntTSL 511.55□□□□□ -0.568e-9■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 MYL6-221ENST00000552297 454 ntTSL 37.78□□□□□ -1.168e-9■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.812e-9■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.492e-9■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 CAPN1-203ENST00000525013 643 ntTSL 222.97■■□□□ 1.272e-6■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 TALDO1-208ENST00000532685 568 ntTSL 222.42■■□□□ 1.182e-9■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 ARAP1-216ENST00000542596 699 ntTSL 518.34■□□□□ 0.533e-7■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 PPP5C-205ENST00000478046 1886 ntTSL 1 (best)18.1■□□□□ 0.492e-9■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 ARAP1-219ENST00000544721 773 ntTSL 217.3■□□□□ 0.363e-7■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 SMARCA4-211ENST00000586921 569 ntTSL 515.27■□□□□ 0.042e-9■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 HDAC2-212ENST00000521610 580 ntTSL 413.26□□□□□ -0.292e-9■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 CSE1L-203ENST00000469700 1401 ntTSL 1 (best)6.09□□□□□ -1.435e-14■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 HDAC2-204ENST00000518756 826 ntTSL 36.02□□□□□ -1.452e-9■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 HDAC2-216ENST00000523628 549 ntTSL 45.04□□□□□ -1.62e-9■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 HDAC2-202ENST00000425835 553 ntTSL 23.31□□□□□ -1.882e-9■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 NELFE-208ENST00000481121 1543 ntTSL 225.76■■□□□ 1.718e-8■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.698e-8■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 NELFE-212ENST00000492539 583 ntTSL 324.51■■□□□ 1.518e-8■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 NELFE-211ENST00000492185 1786 ntTSL 224.44■■□□□ 1.58e-8■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.498e-8■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 NELFE-207ENST00000454913 914 ntTSL 519.01■□□□□ 0.638e-8■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 NELFE-204ENST00000436289 906 ntTSL 518.34■□□□□ 0.538e-8■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.418e-8■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 NELFE-209ENST00000488426 1855 ntTSL 515.61■□□□□ 0.098e-8■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 NELFE-205ENST00000441998 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.8□□□□□ -0.28e-8■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.384e-7■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 PUF60-220ENST00000532884 819 ntTSL 517.93■□□□□ 0.465e-7■■■□□ 18.4
G3BP1Q13283 CKAP5-212ENST00000533413 3084 ntTSL 1 (best)6.14□□□□□ -1.431e-6■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 EPAS1-206ENST00000466465 3622 ntTSL 210.1□□□□□ -0.792e-6■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 PSMA4-214ENST00000559906 583 ntTSL 22.75□□□□□ -1.976e-9■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 PDCD11-206ENST00000493610 732 ntTSL 516.9■□□□□ 0.31e-6■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 WDR1-211ENST00000508079 812 ntTSL 315.32■□□□□ 0.046e-8■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.436e-11■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.026e-11■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.946e-11■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.896e-11■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 PKM-222ENST00000568883 1863 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.036e-11■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 PKM-202ENST00000335181 2318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.086e-11■■■□□ 18.3
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