RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375425.9

NELFE-201, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene NELFE, Length 1,405 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-201ENST00000375425 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.24■■■■□ 3.23
NELFE-201ENST00000375425 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.42■■■□□ 2.62
NELFE-201ENST00000375425 ABCC9O60706 1549 aa31.38■■■□□ 2.61
NELFE-201ENST00000375425 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.89■■■□□ 2.37
NELFE-201ENST00000375425 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.83■■■□□ 2.37
NELFE-201ENST00000375425 NACADO15069 1562 aa29.74■■■□□ 2.35
NELFE-201ENST00000375425 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.39■■■□□ 2.3
NELFE-201ENST00000375425 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.37■■■□□ 2.29
NELFE-201ENST00000375425 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.34■■■□□ 2.29
NELFE-201ENST00000375425 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
NELFE-201ENST00000375425 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.12■■■□□ 2.25
NELFE-201ENST00000375425 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.08■■■□□ 2.25
NELFE-201ENST00000375425 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.01■■■□□ 2.23
NELFE-201ENST00000375425 SCRIBQ14160 1630 aa28.72■■■□□ 2.19
NELFE-201ENST00000375425 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.62■■■□□ 2.17
NELFE-201ENST00000375425 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.31■■■□□ 2.12
NELFE-201ENST00000375425 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
NELFE-201ENST00000375425 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.25■■■□□ 2.11
NELFE-201ENST00000375425 NCAPD3P42695 1498 aa27.51■■□□□ 1.99
NELFE-201ENST00000375425 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.45■■□□□ 1.98
NELFE-201ENST00000375425 SMARCA4P51532 1647 aa27.4■■□□□ 1.98
NELFE-201ENST00000375425 SMARCA2P51531 1590 aa27.33■■□□□ 1.97
NELFE-201ENST00000375425 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
NELFE-201ENST00000375425 HMGXB3Q12766 1538 aa27.24■■□□□ 1.95
NELFE-201ENST00000375425 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
NELFE-201ENST00000375425 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.16■■□□□ 1.94
NELFE-201ENST00000375425 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.13■■□□□ 1.93
NELFE-201ENST00000375425 ERCC6Q03468 1493 aa27.08■■□□□ 1.93
NELFE-201ENST00000375425 NESP48681 1621 aa27.01■■□□□ 1.92
NELFE-201ENST00000375425 CUX2O14529 1486 aa26.92■■□□□ 1.9
NELFE-201ENST00000375425 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.82■■□□□ 1.88
NELFE-201ENST00000375425 WIZO95785 1651 aa26.81■■□□□ 1.88
NELFE-201ENST00000375425 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.79■■□□□ 1.88
NELFE-201ENST00000375425 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.72■■□□□ 1.87
NELFE-201ENST00000375425 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.71■■□□□ 1.87
NELFE-201ENST00000375425 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
NELFE-201ENST00000375425 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
NELFE-201ENST00000375425 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.57■■□□□ 1.84
NELFE-201ENST00000375425 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
NELFE-201ENST00000375425 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.42■■□□□ 1.82
NELFE-201ENST00000375425 CFTRP13569 1480 aa26.41■■□□□ 1.82
NELFE-201ENST00000375425 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.37■■□□□ 1.81
NELFE-201ENST00000375425 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.36■■□□□ 1.81
NELFE-201ENST00000375425 WDR62O43379 1518 aa26.32■■□□□ 1.8
NELFE-201ENST00000375425 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.25■■□□□ 1.79
NELFE-201ENST00000375425 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
NELFE-201ENST00000375425 PRDM2Q13029 1718 aa25.98■■□□□ 1.75
NELFE-201ENST00000375425 TOPBP1Q92547 1522 aa25.88■■□□□ 1.73
NELFE-201ENST00000375425 OSCARQ8IYS5 282 aa25.86■■□□□ 1.73
NELFE-201ENST00000375425 IFT140Q96RY7 1462 aa25.84■■□□□ 1.73
NELFE-201ENST00000375425 ABCC8Q09428 1581 aa25.84■■□□□ 1.73
NELFE-201ENST00000375425 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
NELFE-201ENST00000375425 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
NELFE-201ENST00000375425 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.76■■□□□ 1.71
NELFE-201ENST00000375425 TRIM41Q8WV44 630 aa25.72■■□□□ 1.71
NELFE-201ENST00000375425 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
NELFE-201ENST00000375425 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.62■■□□□ 1.691e-10■■■■□ 20.9
NELFE-201ENST00000375425 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
NELFE-201ENST00000375425 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
NELFE-201ENST00000375425 SOGA1O94964 1423 aa25.57■■□□□ 1.68
NELFE-201ENST00000375425 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.57■■□□□ 1.68
NELFE-201ENST00000375425 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
NELFE-201ENST00000375425 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.5■■□□□ 1.67
NELFE-201ENST00000375425 CUX1P39880 1505 aa25.49■■□□□ 1.67
NELFE-201ENST00000375425 FBLN2P98095 1184 aa25.47■■□□□ 1.67
NELFE-201ENST00000375425 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.35■■□□□ 1.65
NELFE-201ENST00000375425 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.35■■□□□ 1.65
NELFE-201ENST00000375425 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.35■■□□□ 1.65
NELFE-201ENST00000375425 CHD1O14646 1710 aa25.32■■□□□ 1.64
NELFE-201ENST00000375425 ARHGEF11O15085 1522 aa25.32■■□□□ 1.64
NELFE-201ENST00000375425 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.31■■□□□ 1.64
NELFE-201ENST00000375425 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
NELFE-201ENST00000375425 WDR97A6NE52 1622 aa25.31■■□□□ 1.64
NELFE-201ENST00000375425 GRIN2BQ13224 1484 aa25.28■■□□□ 1.64
NELFE-201ENST00000375425 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.25■■□□□ 1.63
NELFE-201ENST00000375425 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
NELFE-201ENST00000375425 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.23■■□□□ 1.63
NELFE-201ENST00000375425 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.22■■□□□ 1.63
NELFE-201ENST00000375425 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
NELFE-201ENST00000375425 SYNJ2O15056 1496 aa25.17■■□□□ 1.62
NELFE-201ENST00000375425 TOP2BQ02880 1626 aa25.11■■□□□ 1.61
NELFE-201ENST00000375425 SYNJ1O43426 1573 aa25.1■■□□□ 1.61
NELFE-201ENST00000375425 ARAP1Q96P48 1450 aa25.1■■□□□ 1.61
NELFE-201ENST00000375425 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.09■■□□□ 1.61
NELFE-201ENST00000375425 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.09■■□□□ 1.61
NELFE-201ENST00000375425 PBRM1Q86U86 1689 aa25.08■■□□□ 1.61
NELFE-201ENST00000375425 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.07■■□□□ 1.6
NELFE-201ENST00000375425 GRIN2AQ12879 1464 aa24.94■■□□□ 1.58
NELFE-201ENST00000375425 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.92■■□□□ 1.58
NELFE-201ENST00000375425 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
NELFE-201ENST00000375425 ADAMTS12P58397 1594 aa24.89■■□□□ 1.58
NELFE-201ENST00000375425 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.89■■□□□ 1.57
NELFE-201ENST00000375425 NUP160Q12769 1436 aa24.87■■□□□ 1.57
NELFE-201ENST00000375425 CEP170Q5SW79 1584 aa24.81■■□□□ 1.56
NELFE-201ENST00000375425 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.74■■□□□ 1.55
NELFE-201ENST00000375425 JPH4Q96JJ6 628 aa24.72■■□□□ 1.55
NELFE-201ENST00000375425 IGF1RP08069 1367 aa24.72■■□□□ 1.55
NELFE-201ENST00000375425 KIF27Q86VH2 1401 aa24.7■■□□□ 1.54
NELFE-201ENST00000375425 SHROOM2Q13796 1616 aa24.66■■□□□ 1.54
NELFE-201ENST00000375425 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms