RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375429.7

NELFE-202, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NELFE, Length 1,584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-202ENST00000375429 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.72■■■■■ 5.39
NELFE-202ENST00000375429 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.91■■■■■ 4.46
NELFE-202ENST00000375429 ABCC9O60706 1549 aa41.35■■■■■ 4.21
NELFE-202ENST00000375429 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
NELFE-202ENST00000375429 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.49■■■■■ 4.07
NELFE-202ENST00000375429 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.29■■■■■ 4.04
NELFE-202ENST00000375429 NACADO15069 1562 aa40.18■■■■■ 4.02
NELFE-202ENST00000375429 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.16■■■■■ 4.02
NELFE-202ENST00000375429 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.04■■■■■ 4
NELFE-202ENST00000375429 SCRIBQ14160 1630 aa39.29■■■■□ 3.88
NELFE-202ENST00000375429 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.23■■■■□ 3.87
NELFE-202ENST00000375429 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.04■■■■□ 3.84
NELFE-202ENST00000375429 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.87■■■■□ 3.81
NELFE-202ENST00000375429 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.82■■■■□ 3.81
NELFE-202ENST00000375429 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.92■■■■□ 3.66
NELFE-202ENST00000375429 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
NELFE-202ENST00000375429 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.67■■■■□ 3.62
NELFE-202ENST00000375429 SMARCA4P51532 1647 aa37.63■■■■□ 3.62
NELFE-202ENST00000375429 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.59■■■■□ 3.61
NELFE-202ENST00000375429 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
NELFE-202ENST00000375429 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.43■■■■□ 3.58
NELFE-202ENST00000375429 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.34■■■■□ 3.57
NELFE-202ENST00000375429 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.25■■■■□ 3.55
NELFE-202ENST00000375429 WIZO95785 1651 aa37.24■■■■□ 3.55
NELFE-202ENST00000375429 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.22■■■■□ 3.55
NELFE-202ENST00000375429 SMARCA2P51531 1590 aa37.19■■■■□ 3.54
NELFE-202ENST00000375429 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
NELFE-202ENST00000375429 NCAPD3P42695 1498 aa37.09■■■■□ 3.53
NELFE-202ENST00000375429 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
NELFE-202ENST00000375429 HMGXB3Q12766 1538 aa36.95■■■■□ 3.51
NELFE-202ENST00000375429 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
NELFE-202ENST00000375429 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.44■■■■□ 3.42
NELFE-202ENST00000375429 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.07■■■■□ 3.36
NELFE-202ENST00000375429 NESP48681 1621 aa36.03■■■■□ 3.36
NELFE-202ENST00000375429 CFTRP13569 1480 aa36■■■■□ 3.35
NELFE-202ENST00000375429 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.97■■■■□ 3.35
NELFE-202ENST00000375429 PRDM2Q13029 1718 aa35.79■■■■□ 3.32
NELFE-202ENST00000375429 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.71■■■■□ 3.31
NELFE-202ENST00000375429 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.65■■■■□ 3.3
NELFE-202ENST00000375429 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.6■■■■□ 3.29
NELFE-202ENST00000375429 ERCC6Q03468 1493 aa35.53■■■■□ 3.28
NELFE-202ENST00000375429 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.51■■■■□ 3.28
NELFE-202ENST00000375429 ABCC8Q09428 1581 aa35.36■■■■□ 3.25
NELFE-202ENST00000375429 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.3■■■■□ 3.24
NELFE-202ENST00000375429 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
NELFE-202ENST00000375429 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
NELFE-202ENST00000375429 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.25■■■■□ 3.23
NELFE-202ENST00000375429 CUX1P39880 1505 aa35.21■■■■□ 3.23
NELFE-202ENST00000375429 TOPBP1Q92547 1522 aa35.17■■■■□ 3.22
NELFE-202ENST00000375429 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.17■■■■□ 3.22
NELFE-202ENST00000375429 WDR62O43379 1518 aa35.15■■■■□ 3.22
NELFE-202ENST00000375429 SYNJ1O43426 1573 aa35.14■■■■□ 3.22
NELFE-202ENST00000375429 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.09■■■■□ 3.21
NELFE-202ENST00000375429 TOP2BQ02880 1626 aa35.08■■■■□ 3.21
NELFE-202ENST00000375429 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.07■■■■□ 3.2
NELFE-202ENST00000375429 TRIM41Q8WV44 630 aa34.99■■■■□ 3.19
NELFE-202ENST00000375429 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.95■■■■□ 3.19
NELFE-202ENST00000375429 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
NELFE-202ENST00000375429 CUX2O14529 1486 aa34.86■■■■□ 3.17
NELFE-202ENST00000375429 SOGA1O94964 1423 aa34.81■■■■□ 3.16
NELFE-202ENST00000375429 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.81■■■■□ 3.16
NELFE-202ENST00000375429 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
NELFE-202ENST00000375429 IFT140Q96RY7 1462 aa34.73■■■■□ 3.15
NELFE-202ENST00000375429 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.64■■■■□ 3.14
NELFE-202ENST00000375429 WDR97A6NE52 1622 aa34.62■■■■□ 3.13
NELFE-202ENST00000375429 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.12
NELFE-202ENST00000375429 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
NELFE-202ENST00000375429 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.48■■■■□ 3.111e-10■■■■□ 20.9
NELFE-202ENST00000375429 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.46■■■■□ 3.11
NELFE-202ENST00000375429 KIF27Q86VH2 1401 aa34.43■■■■□ 3.1
NELFE-202ENST00000375429 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.43■■■■□ 3.1
NELFE-202ENST00000375429 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
NELFE-202ENST00000375429 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.41■■■■□ 3.1
NELFE-202ENST00000375429 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
NELFE-202ENST00000375429 PBRM1Q86U86 1689 aa34.29■■■■□ 3.08
NELFE-202ENST00000375429 GRIN2BQ13224 1484 aa34.27■■■■□ 3.08
NELFE-202ENST00000375429 EEA1Q15075 1411 aa34.26■■■■□ 3.07
NELFE-202ENST00000375429 IGF1RP08069 1367 aa34.25■■■■□ 3.07
NELFE-202ENST00000375429 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.22■■■■□ 3.07
NELFE-202ENST00000375429 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.19■■■■□ 3.06
NELFE-202ENST00000375429 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.14■■■■□ 3.06
NELFE-202ENST00000375429 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
NELFE-202ENST00000375429 CUL7Q14999 1698 aa34.05■■■■□ 3.04
NELFE-202ENST00000375429 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.05■■■■□ 3.04
NELFE-202ENST00000375429 ADAMTS12P58397 1594 aa34.03■■■■□ 3.04
NELFE-202ENST00000375429 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.02■■■■□ 3.04
NELFE-202ENST00000375429 PRXQ9BXM0 1461 aa33.99■■■■□ 3.03
NELFE-202ENST00000375429 SYNJ2O15056 1496 aa33.97■■■■□ 3.03
NELFE-202ENST00000375429 FBLN2P98095 1184 aa33.94■■■■□ 3.02
NELFE-202ENST00000375429 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
NELFE-202ENST00000375429 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.91■■■■□ 3.02
NELFE-202ENST00000375429 CHD1O14646 1710 aa33.88■■■■□ 3.01
NELFE-202ENST00000375429 KIF21BO75037 1637 aa33.87■■■■□ 3.01
NELFE-202ENST00000375429 GRIN2AQ12879 1464 aa33.85■■■■□ 3.01
NELFE-202ENST00000375429 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.83■■■■□ 3.01
NELFE-202ENST00000375429 GOLGA3Q08378 1498 aa33.74■■■□□ 2.99
NELFE-202ENST00000375429 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.71■■■□□ 2.99
NELFE-202ENST00000375429 CEP170Q5SW79 1584 aa33.67■■■□□ 2.98
NELFE-202ENST00000375429 NUP160Q12769 1436 aa33.66■■■□□ 2.98
NELFE-202ENST00000375429 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.3 ms