RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436289.6

NELFE-204, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-204ENST00000436289 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.31■■■■□ 3.72
NELFE-204ENST00000436289 ABCC9O60706 1549 aa35.24■■■■□ 3.23
NELFE-204ENST00000436289 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.63■■■■□ 3.13
NELFE-204ENST00000436289 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.67■■■□□ 2.98
NELFE-204ENST00000436289 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.34■■■□□ 2.93
NELFE-204ENST00000436289 NACADO15069 1562 aa32.99■■■□□ 2.87
NELFE-204ENST00000436289 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.75■■■□□ 2.83
NELFE-204ENST00000436289 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.68■■■□□ 2.82
NELFE-204ENST00000436289 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.39■■■□□ 2.78
NELFE-204ENST00000436289 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.37■■■□□ 2.77
NELFE-204ENST00000436289 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.28■■■□□ 2.76
NELFE-204ENST00000436289 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32■■■□□ 2.71
NELFE-204ENST00000436289 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.89■■■□□ 2.7
NELFE-204ENST00000436289 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.8■■■□□ 2.68
NELFE-204ENST00000436289 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.69■■■□□ 2.66
NELFE-204ENST00000436289 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
NELFE-204ENST00000436289 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.57■■■□□ 2.64
NELFE-204ENST00000436289 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
NELFE-204ENST00000436289 SCRIBQ14160 1630 aa31.41■■■□□ 2.62
NELFE-204ENST00000436289 CUX2O14529 1486 aa30.77■■■□□ 2.52
NELFE-204ENST00000436289 ERCC6Q03468 1493 aa30.56■■■□□ 2.48
NELFE-204ENST00000436289 NCAPD3P42695 1498 aa30.49■■■□□ 2.47
NELFE-204ENST00000436289 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.24■■■□□ 2.43
NELFE-204ENST00000436289 SMARCA2P51531 1590 aa30.15■■■□□ 2.42
NELFE-204ENST00000436289 HMGXB3Q12766 1538 aa30.13■■■□□ 2.41
NELFE-204ENST00000436289 NESP48681 1621 aa30.04■■■□□ 2.4
NELFE-204ENST00000436289 SMARCA4P51532 1647 aa29.96■■■□□ 2.39
NELFE-204ENST00000436289 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
NELFE-204ENST00000436289 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
NELFE-204ENST00000436289 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.86■■■□□ 2.37
NELFE-204ENST00000436289 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
NELFE-204ENST00000436289 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.79■■■□□ 2.36
NELFE-204ENST00000436289 TRIM41Q8WV44 630 aa29.78■■■□□ 2.36
NELFE-204ENST00000436289 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.75■■■□□ 2.35
NELFE-204ENST00000436289 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.57■■■□□ 2.32
NELFE-204ENST00000436289 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.53■■■□□ 2.32
NELFE-204ENST00000436289 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.47■■■□□ 2.31
NELFE-204ENST00000436289 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.43■■■□□ 2.3
NELFE-204ENST00000436289 WDR62O43379 1518 aa29.4■■■□□ 2.3
NELFE-204ENST00000436289 OSCARQ8IYS5 282 aa29.35■■■□□ 2.29
NELFE-204ENST00000436289 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.22■■■□□ 2.27
NELFE-204ENST00000436289 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.12■■■□□ 2.25
NELFE-204ENST00000436289 CFTRP13569 1480 aa29.03■■■□□ 2.24
NELFE-204ENST00000436289 WIZO95785 1651 aa29■■■□□ 2.23
NELFE-204ENST00000436289 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
NELFE-204ENST00000436289 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.8■■■□□ 2.2
NELFE-204ENST00000436289 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.8■■■□□ 2.2
NELFE-204ENST00000436289 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.8■■■□□ 2.2
NELFE-204ENST00000436289 IFT140Q96RY7 1462 aa28.71■■■□□ 2.19
NELFE-204ENST00000436289 ARHGEF11O15085 1522 aa28.7■■■□□ 2.19
NELFE-204ENST00000436289 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
NELFE-204ENST00000436289 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
NELFE-204ENST00000436289 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.63■■■□□ 2.17
NELFE-204ENST00000436289 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
NELFE-204ENST00000436289 ABCC8Q09428 1581 aa28.54■■■□□ 2.16
NELFE-204ENST00000436289 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
NELFE-204ENST00000436289 PRDM2Q13029 1718 aa28.52■■■□□ 2.16
NELFE-204ENST00000436289 TOPBP1Q92547 1522 aa28.48■■■□□ 2.15
NELFE-204ENST00000436289 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
NELFE-204ENST00000436289 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.38■■■□□ 2.13
NELFE-204ENST00000436289 ARAP1Q96P48 1450 aa28.34■■■□□ 2.13
NELFE-204ENST00000436289 FBLN2P98095 1184 aa28.33■■■□□ 2.13
NELFE-204ENST00000436289 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.32■■■□□ 2.128e-7■■■□□ 14.6
NELFE-204ENST00000436289 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.31■■■□□ 2.12
NELFE-204ENST00000436289 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
NELFE-204ENST00000436289 CHD1O14646 1710 aa28.25■■■□□ 2.11
NELFE-204ENST00000436289 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
NELFE-204ENST00000436289 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
NELFE-204ENST00000436289 SOGA1O94964 1423 aa28.09■■■□□ 2.09
NELFE-204ENST00000436289 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
NELFE-204ENST00000436289 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
NELFE-204ENST00000436289 WDR97A6NE52 1622 aa28.03■■■□□ 2.08
NELFE-204ENST00000436289 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.02■■■□□ 2.08
NELFE-204ENST00000436289 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.01■■■□□ 2.07
NELFE-204ENST00000436289 SYNJ1O43426 1573 aa28■■■□□ 2.07
NELFE-204ENST00000436289 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.98■■■□□ 2.07
NELFE-204ENST00000436289 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
NELFE-204ENST00000436289 GRIN2BQ13224 1484 aa27.9■■■□□ 2.06
NELFE-204ENST00000436289 SYNJ2O15056 1496 aa27.88■■■□□ 2.05
NELFE-204ENST00000436289 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.85■■■□□ 2.05
NELFE-204ENST00000436289 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.82■■■□□ 2.04
NELFE-204ENST00000436289 CUX1P39880 1505 aa27.69■■■□□ 2.02
NELFE-204ENST00000436289 PBRM1Q86U86 1689 aa27.57■■■□□ 2
NELFE-204ENST00000436289 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.57■■■□□ 2
NELFE-204ENST00000436289 GRIN2AQ12879 1464 aa27.5■■□□□ 1.99
NELFE-204ENST00000436289 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.49■■□□□ 1.99
NELFE-204ENST00000436289 NUP160Q12769 1436 aa27.45■■□□□ 1.98
NELFE-204ENST00000436289 CEP170Q5SW79 1584 aa27.43■■□□□ 1.98
NELFE-204ENST00000436289 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.43■■□□□ 1.98
NELFE-204ENST00000436289 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.38■■□□□ 1.97
NELFE-204ENST00000436289 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.36■■□□□ 1.97
NELFE-204ENST00000436289 SHROOM2Q13796 1616 aa27.34■■□□□ 1.97
NELFE-204ENST00000436289 ADAMTS12P58397 1594 aa27.31■■□□□ 1.96
NELFE-204ENST00000436289 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.29■■□□□ 1.96
NELFE-204ENST00000436289 JPH4Q96JJ6 628 aa27.27■■□□□ 1.96
NELFE-204ENST00000436289 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.27■■□□□ 1.96
NELFE-204ENST00000436289 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.26■■□□□ 1.95
NELFE-204ENST00000436289 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
NELFE-204ENST00000436289 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.21■■□□□ 1.95
NELFE-204ENST00000436289 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.21■■□□□ 1.95
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