Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 TRNT1-202ENST00000280591 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.041e-6■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 TRNT1-208ENST00000434583 1871 ntTSL 212.22□□□□□ -0.451e-6■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 COPS6-204ENST00000426712 716 ntTSL 310.9□□□□□ -0.661e-8■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 SUN1-222ENST00000457861 2975 ntTSL 217.46■□□□□ 0.391e-6■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 RPS17-203ENST00000559273 580 ntTSL 219.48■□□□□ 0.716e-78■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 PTTG1-206ENST00000523659 851 ntTSL 27.06□□□□□ -1.282e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.171e-13■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.021e-13■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CLK2-205ENST00000476983 1885 ntTSL 1 (best)22.51■■□□□ 1.191e-13■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.931e-13■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.581e-13■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 NTMT1-208ENST00000486391 624 ntTSL 517.39■□□□□ 0.371e-13■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CLK2-207ENST00000497188 2702 ntTSL 213.15□□□□□ -0.31e-13■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 UCHL3-206ENST00000618773 1050 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.391e-13■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 AL137782.1-201ENST00000563635 4128 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.861e-13■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 AL137782.1-202ENST00000570285 386 ntTSL 58.66□□□□□ -1.021e-13■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 UCHL3-205ENST00000607339 506 ntTSL 26.1□□□□□ -1.431e-13■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 UCHL3-202ENST00000419068 824 ntTSL 55.37□□□□□ -1.551e-13■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 UCHL3-204ENST00000606347 722 ntTSL 24.79□□□□□ -1.641e-13■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.153e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CENPX-203ENST00000577379 861 ntTSL 527.34■■□□□ 1.973e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.233e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CENPX-207ENST00000583767 894 ntTSL 322.52■■□□□ 1.23e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CENPX-205ENST00000580090 752 ntTSL 222.25■■□□□ 1.153e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.113e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CENPX-204ENST00000579520 702 ntTSL 320.38■□□□□ 0.853e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CENPX-210ENST00000584600 730 ntTSL 219.48■□□□□ 0.713e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.383e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.332e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.132e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CSRP1-215ENST00000532313 5239 ntTSL 1 (best)13.67□□□□□ -0.222e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CSRP1-211ENST00000527662 4208 ntTSL 28.88□□□□□ -0.992e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CSRP1-218ENST00000533402 8475 ntTSL 1 (best)8.6□□□□□ -1.032e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 PAXX-206ENST00000492564 701 ntTSL 324.6■■□□□ 1.531e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.481e-6■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 IDH3B-207ENST00000477689 608 ntTSL 517.07■□□□□ 0.321e-8■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 GAS5-203ENST00000416952 799 ntTSL 210.78□□□□□ -0.683e-27■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 GAS5-226ENST00000455838 632 ntTSL 29.67□□□□□ -0.863e-27■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 GAS5-227ENST00000456293 583 ntTSL 38.61□□□□□ -1.033e-27■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 HSP90AB1-202ENST00000371554 2674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.61e-323■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 HSP90AB1-203ENST00000371646 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.711e-323■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 HSP90AB1-201ENST00000353801 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.791e-323■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 HSP90AB1-204ENST00000620073 2644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.81e-323■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CPNE1-207ENST00000414664 1070 ntTSL 530.18■■■□□ 2.427e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CPNE1-212ENST00000430570 1332 ntTSL 529.62■■■□□ 2.337e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CPNE1-205ENST00000401607 1795 ntTSL 528.59■■■□□ 2.177e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CPNE1-216ENST00000437340 1755 ntTSL 1 (best)28.51■■■□□ 2.157e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CPNE1-206ENST00000412056 998 ntTSL 316.46■□□□□ 0.237e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CPNE1-226ENST00000486021 506 ntTSL 29.14□□□□□ -0.957e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 EEF1G-202ENST00000524420 557 ntTSL 413.12□□□□□ -0.318e-22■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.961e-8■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 SNF8-217ENST00000576353 700 ntTSL 528.12■■■□□ 2.092e-8■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 SNF8-209ENST00000510558 1051 ntTSL 527.79■■■□□ 2.042e-8■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 SNF8-216ENST00000573795 583 ntTSL 526.94■■□□□ 1.92e-8■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.632e-8■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 SNF8-207ENST00000509995 560 ntTSL 313.72□□□□□ -0.212e-8■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 SNF8-201ENST00000290330 951 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.382e-8■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.457e-8■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.337e-8■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.056e-8■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.856e-8■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 SLC25A1-205ENST00000470922 1598 ntTSL 226.17■■□□□ 1.786e-8■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.592e-6■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.482e-6■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.612e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.22e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.122e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 UBE2A-210ENST00000630695 1771 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.092e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 UBE2A-211ENST00000631185 1435 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.172e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 UBE2A-203ENST00000371569 2643 ntTSL 1 (best)2.38□□□□□ -2.032e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 RPLP1-204ENST00000488122 940 ntTSL 224.89■■□□□ 1.582e-44■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.015e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.985e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 PRSS21-206ENST00000574265 860 ntTSL 315.25■□□□□ 0.035e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 PRSS21-209ENST00000575739 378 ntTSL 310.99□□□□□ -0.655e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.35e-10■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 CENPU-205ENST00000510146 1549 ntTSL 1 (best)23.15■■□□□ 1.35e-10■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 CENPU-202ENST00000502461 723 ntTSL 26.81□□□□□ -1.325e-10■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.872e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.242e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.12e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.692e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.665e-9■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.021e-6■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.637e-11■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 SRSF2-204ENST00000452355 1357 ntTSL 519.19■□□□□ 0.663e-51■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.32e-8■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.552e-8■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 EMC1-207ENST00000477853 6664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.537e-13■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.941e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 EMP3-205ENST00000597057 406 ntTSL 213.95□□□□□ -0.183e-15■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 AGTRAP-209ENST00000476512 942 ntTSL 321.62■■□□□ 1.053e-6■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.93e-6■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.761e-6■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 SSR2-211ENST00000484320 1148 ntTSL 516.78■□□□□ 0.288e-8■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 SSR2-209ENST00000480176 1040 ntTSL 215.43■□□□□ 0.068e-8■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 SSR2-218ENST00000532074 1008 ntTSL 512.38□□□□□ -0.438e-8■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 SSR2-213ENST00000496742 825 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.698e-8■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 SSR2-201ENST00000295702 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.748e-8■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 SSR2-215ENST00000529008 849 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.828e-8■■■□□ 14.7
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