RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584347.1

CENPX-208, Transcript of centromere protein X, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CENPX, Length 799 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPX-208ENST00000584347 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.44■■■■□ 3.26
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CENPX-208ENST00000584347 ABCC9O60706 1549 aa31.56■■■□□ 2.64
CENPX-208ENST00000584347 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.14■■■□□ 2.42
CENPX-208ENST00000584347 NACADO15069 1562 aa29.98■■■□□ 2.39
CENPX-208ENST00000584347 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.91■■■□□ 2.38
CENPX-208ENST00000584347 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.64■■■□□ 2.34
CENPX-208ENST00000584347 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.44■■■□□ 2.34e-7■■■■■ 35.2
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CENPX-208ENST00000584347 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
CENPX-208ENST00000584347 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.33■■■□□ 2.29
CENPX-208ENST00000584347 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.3■■■□□ 2.28
CENPX-208ENST00000584347 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.19■■■□□ 2.26
CENPX-208ENST00000584347 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.91■■■□□ 2.22
CENPX-208ENST00000584347 SCRIBQ14160 1630 aa28.9■■■□□ 2.22
CENPX-208ENST00000584347 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
CENPX-208ENST00000584347 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.5■■■□□ 2.15
CENPX-208ENST00000584347 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.44■■■□□ 2.14
CENPX-208ENST00000584347 NCAPD3P42695 1498 aa27.68■■■□□ 2.02
CENPX-208ENST00000584347 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.6■■■□□ 2.01
CENPX-208ENST00000584347 SMARCA4P51532 1647 aa27.59■■■□□ 2.01
CENPX-208ENST00000584347 SMARCA2P51531 1590 aa27.56■■■□□ 2
CENPX-208ENST00000584347 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
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CENPX-208ENST00000584347 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.33■■□□□ 1.97
CENPX-208ENST00000584347 ERCC6Q03468 1493 aa27.29■■□□□ 1.96
CENPX-208ENST00000584347 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.29■■□□□ 1.96
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CENPX-208ENST00000584347 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.01■■□□□ 1.92
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CENPX-208ENST00000584347 WIZO95785 1651 aa26.94■■□□□ 1.9
CENPX-208ENST00000584347 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.91■■□□□ 1.9
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CENPX-208ENST00000584347 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CENPX-208ENST00000584347 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
CENPX-208ENST00000584347 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.76■■□□□ 1.87
CENPX-208ENST00000584347 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
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CENPX-208ENST00000584347 CFTRP13569 1480 aa26.57■■□□□ 1.84
CENPX-208ENST00000584347 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.56■■□□□ 1.84
CENPX-208ENST00000584347 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.54■■□□□ 1.84
CENPX-208ENST00000584347 WDR62O43379 1518 aa26.53■■□□□ 1.84
CENPX-208ENST00000584347 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.36■■□□□ 1.81
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CENPX-208ENST00000584347 ABCC8Q09428 1581 aa26.05■■□□□ 1.76
CENPX-208ENST00000584347 IFT140Q96RY7 1462 aa26.04■■□□□ 1.76
CENPX-208ENST00000584347 TOPBP1Q92547 1522 aa26.03■■□□□ 1.76
CENPX-208ENST00000584347 OSCARQ8IYS5 282 aa26■■□□□ 1.75
CENPX-208ENST00000584347 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.96■■□□□ 1.75
CENPX-208ENST00000584347 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CENPX-208ENST00000584347 TRIM41Q8WV44 630 aa25.87■■□□□ 1.73
CENPX-208ENST00000584347 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
CENPX-208ENST00000584347 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CENPX-208ENST00000584347 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
CENPX-208ENST00000584347 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
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CENPX-208ENST00000584347 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.67■■□□□ 1.7
CENPX-208ENST00000584347 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.65■■□□□ 1.7
CENPX-208ENST00000584347 CUX1P39880 1505 aa25.63■■□□□ 1.69
CENPX-208ENST00000584347 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CENPX-208ENST00000584347 FBLN2P98095 1184 aa25.59■■□□□ 1.69
CENPX-208ENST00000584347 WDR97A6NE52 1622 aa25.57■■□□□ 1.68
CENPX-208ENST00000584347 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.54■■□□□ 1.68
CENPX-208ENST00000584347 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.54■■□□□ 1.68
CENPX-208ENST00000584347 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.54■■□□□ 1.68
CENPX-208ENST00000584347 CHD1O14646 1710 aa25.51■■□□□ 1.68
CENPX-208ENST00000584347 ARHGEF11O15085 1522 aa25.51■■□□□ 1.67
CENPX-208ENST00000584347 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.47■■□□□ 1.67
CENPX-208ENST00000584347 GRIN2BQ13224 1484 aa25.46■■□□□ 1.67
CENPX-208ENST00000584347 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CENPX-208ENST00000584347 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CENPX-208ENST00000584347 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.39■■□□□ 1.65
CENPX-208ENST00000584347 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.37■■□□□ 1.65
CENPX-208ENST00000584347 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.36■■□□□ 1.65
CENPX-208ENST00000584347 SYNJ2O15056 1496 aa25.35■■□□□ 1.65
CENPX-208ENST00000584347 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.35■■□□□ 1.65
CENPX-208ENST00000584347 SYNJ1O43426 1573 aa25.31■■□□□ 1.64
CENPX-208ENST00000584347 PBRM1Q86U86 1689 aa25.29■■□□□ 1.64
CENPX-208ENST00000584347 TOP2BQ02880 1626 aa25.28■■□□□ 1.64
CENPX-208ENST00000584347 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.28■■□□□ 1.64
CENPX-208ENST00000584347 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.27■■□□□ 1.64
CENPX-208ENST00000584347 ARAP1Q96P48 1450 aa25.26■■□□□ 1.63
CENPX-208ENST00000584347 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.26■■□□□ 1.63
CENPX-208ENST00000584347 GRIN2AQ12879 1464 aa25.12■■□□□ 1.61
CENPX-208ENST00000584347 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.09■■□□□ 1.61
CENPX-208ENST00000584347 ADAMTS12P58397 1594 aa25.09■■□□□ 1.61
CENPX-208ENST00000584347 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.07■■□□□ 1.6
CENPX-208ENST00000584347 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CENPX-208ENST00000584347 NUP160Q12769 1436 aa25.03■■□□□ 1.6
CENPX-208ENST00000584347 CEP170Q5SW79 1584 aa24.97■■□□□ 1.59
CENPX-208ENST00000584347 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.86■■□□□ 1.57
CENPX-208ENST00000584347 KIF27Q86VH2 1401 aa24.86■■□□□ 1.57
CENPX-208ENST00000584347 SHROOM2Q13796 1616 aa24.85■■□□□ 1.57
CENPX-208ENST00000584347 JPH4Q96JJ6 628 aa24.8■■□□□ 1.56
CENPX-208ENST00000584347 IGF1RP08069 1367 aa24.8■■□□□ 1.56
CENPX-208ENST00000584347 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
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