RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430570.5

CPNE1-212, Transcript of copine 1, humanhuman

TSL 5

Gene CPNE1, Length 1,332 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE1-212ENST00000430570 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.42■■■■■ 7.26
CPNE1-212ENST00000430570 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.45■■■■■ 6.15
CPNE1-212ENST00000430570 ABCC9O60706 1549 aa52.08■■■■■ 5.93
CPNE1-212ENST00000430570 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.43■■■■■ 5.66
CPNE1-212ENST00000430570 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.4■■■■■ 5.66
CPNE1-212ENST00000430570 NACADO15069 1562 aa50.2■■■■■ 5.63
CPNE1-212ENST00000430570 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.16■■■■■ 5.62
CPNE1-212ENST00000430570 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.98■■■■■ 5.59
CPNE1-212ENST00000430570 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.94■■■■■ 5.58
CPNE1-212ENST00000430570 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.09■■■■■ 5.45
CPNE1-212ENST00000430570 SCRIBQ14160 1630 aa48.9■■■■■ 5.42
CPNE1-212ENST00000430570 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.8■■■■■ 5.45e-6■■■■□ 22.2
CPNE1-212ENST00000430570 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.71■■■■■ 5.39
CPNE1-212ENST00000430570 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.06■■■■■ 5.28
CPNE1-212ENST00000430570 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.56■■■■■ 5.2
CPNE1-212ENST00000430570 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.35■■■■■ 5.17
CPNE1-212ENST00000430570 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.1■■■■■ 5.13
CPNE1-212ENST00000430570 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.09■■■■■ 5.13
CPNE1-212ENST00000430570 SMARCA4P51532 1647 aa46.78■■■■■ 5.08
CPNE1-212ENST00000430570 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.75■■■■■ 5.08
CPNE1-212ENST00000430570 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.61■■■■■ 5.05
CPNE1-212ENST00000430570 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.46■■■■■ 5.03
CPNE1-212ENST00000430570 NCAPD3P42695 1498 aa46.36■■■■■ 5.01
CPNE1-212ENST00000430570 SMARCA2P51531 1590 aa46.35■■■■■ 5.01
CPNE1-212ENST00000430570 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.29■■■■■ 5
CPNE1-212ENST00000430570 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.21■■■■■ 4.99
CPNE1-212ENST00000430570 WIZO95785 1651 aa46.13■■■■■ 4.98
CPNE1-212ENST00000430570 HMGXB3Q12766 1538 aa46.11■■■■■ 4.97
CPNE1-212ENST00000430570 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.06■■■■■ 4.96
CPNE1-212ENST00000430570 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.6■■■■■ 4.89
CPNE1-212ENST00000430570 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.4■■■■■ 4.86
CPNE1-212ENST00000430570 NESP48681 1621 aa45.2■■■■■ 4.83
CPNE1-212ENST00000430570 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.13■■■■■ 4.82
CPNE1-212ENST00000430570 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.04■■■■■ 4.8
CPNE1-212ENST00000430570 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.02■■■■■ 4.8
CPNE1-212ENST00000430570 CFTRP13569 1480 aa44.84■■■■■ 4.77
CPNE1-212ENST00000430570 ERCC6Q03468 1493 aa44.79■■■■■ 4.76
CPNE1-212ENST00000430570 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.73■■■■■ 4.75
CPNE1-212ENST00000430570 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.61■■■■■ 4.73
CPNE1-212ENST00000430570 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.52■■■■■ 4.72
CPNE1-212ENST00000430570 PRDM2Q13029 1718 aa44.46■■■■■ 4.71
CPNE1-212ENST00000430570 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.4■■■■■ 4.7
CPNE1-212ENST00000430570 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
CPNE1-212ENST00000430570 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.26■■■■■ 4.68
CPNE1-212ENST00000430570 CUX2O14529 1486 aa44.14■■■■■ 4.66
CPNE1-212ENST00000430570 WDR62O43379 1518 aa44.1■■■■■ 4.65
CPNE1-212ENST00000430570 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.08■■■■■ 4.65
CPNE1-212ENST00000430570 TOPBP1Q92547 1522 aa43.86■■■■■ 4.61
CPNE1-212ENST00000430570 ABCC8Q09428 1581 aa43.8■■■■■ 4.6
CPNE1-212ENST00000430570 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.8■■■■■ 4.6
CPNE1-212ENST00000430570 CUX1P39880 1505 aa43.69■■■■■ 4.59
CPNE1-212ENST00000430570 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.53■■■■■ 4.56
CPNE1-212ENST00000430570 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.51■■■■■ 4.56
CPNE1-212ENST00000430570 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.47■■■■■ 4.55
CPNE1-212ENST00000430570 IFT140Q96RY7 1462 aa43.45■■■■■ 4.55
CPNE1-212ENST00000430570 SYNJ1O43426 1573 aa43.43■■■■■ 4.54
CPNE1-212ENST00000430570 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.38■■■■■ 4.53
CPNE1-212ENST00000430570 TOP2BQ02880 1626 aa43.37■■■■■ 4.53
CPNE1-212ENST00000430570 SOGA1O94964 1423 aa43.36■■■■■ 4.53
CPNE1-212ENST00000430570 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.35■■■■■ 4.53
CPNE1-212ENST00000430570 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.35■■■■■ 4.53
CPNE1-212ENST00000430570 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.31■■■■■ 4.52
CPNE1-212ENST00000430570 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.12■■■■■ 4.493e-7■■■■□ 24.5
CPNE1-212ENST00000430570 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.1■■■■■ 4.49
CPNE1-212ENST00000430570 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.08■■■■■ 4.49
CPNE1-212ENST00000430570 WDR97A6NE52 1622 aa43.05■■■■■ 4.48
CPNE1-212ENST00000430570 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.04■■■■■ 4.48
CPNE1-212ENST00000430570 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.84■■■■■ 4.45
CPNE1-212ENST00000430570 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.82■■■■■ 4.45
CPNE1-212ENST00000430570 TRIM41Q8WV44 630 aa42.8■■■■■ 4.44
CPNE1-212ENST00000430570 GRIN2BQ13224 1484 aa42.76■■■■■ 4.44
CPNE1-212ENST00000430570 PBRM1Q86U86 1689 aa42.7■■■■■ 4.43
CPNE1-212ENST00000430570 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.68■■■■■ 4.42
CPNE1-212ENST00000430570 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.59■■■■■ 4.41
CPNE1-212ENST00000430570 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
CPNE1-212ENST00000430570 KIF27Q86VH2 1401 aa42.57■■■■■ 4.4
CPNE1-212ENST00000430570 FBLN2P98095 1184 aa42.52■■■■■ 4.4
CPNE1-212ENST00000430570 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.5■■■■■ 4.39
CPNE1-212ENST00000430570 CHD1O14646 1710 aa42.48■■■■■ 4.39
CPNE1-212ENST00000430570 OSCARQ8IYS5 282 aa42.46■■■■■ 4.39
CPNE1-212ENST00000430570 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.45■■■■■ 4.39
CPNE1-212ENST00000430570 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.44■■■■■ 4.38
CPNE1-212ENST00000430570 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.44■■■■■ 4.38
CPNE1-212ENST00000430570 SYNJ2O15056 1496 aa42.43■■■■■ 4.38
CPNE1-212ENST00000430570 IGF1RP08069 1367 aa42.42■■■■■ 4.38
CPNE1-212ENST00000430570 ADAMTS12P58397 1594 aa42.38■■■■■ 4.38
CPNE1-212ENST00000430570 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.34■■■■■ 4.37
CPNE1-212ENST00000430570 GRIN2AQ12879 1464 aa42.22■■■■■ 4.35
CPNE1-212ENST00000430570 CUL7Q14999 1698 aa42.17■■■■■ 4.34
CPNE1-212ENST00000430570 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.16■■■■■ 4.34
CPNE1-212ENST00000430570 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.03■■■■■ 4.32
CPNE1-212ENST00000430570 CEP170Q5SW79 1584 aa42.03■■■■■ 4.32
CPNE1-212ENST00000430570 NUP160Q12769 1436 aa42.02■■■■■ 4.32
CPNE1-212ENST00000430570 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
CPNE1-212ENST00000430570 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.96■■■■■ 4.31
CPNE1-212ENST00000430570 EEA1Q15075 1411 aa41.96■■■■■ 4.31
CPNE1-212ENST00000430570 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.91■■■■■ 4.3
CPNE1-212ENST00000430570 PRXQ9BXM0 1461 aa41.87■■■■■ 4.29
CPNE1-212ENST00000430570 ARHGEF11O15085 1522 aa41.75■■■■■ 4.27
CPNE1-212ENST00000430570 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.73■■■■■ 4.27
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