RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611640.4

KDM4B-211, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene KDM4B, Length 5,703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-211ENST00000611640 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.38■■■□□ 2.13
KDM4B-211ENST00000611640 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.5■■□□□ 1.99
KDM4B-211ENST00000611640 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
KDM4B-211ENST00000611640 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.84■■□□□ 1.89
KDM4B-211ENST00000611640 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.37■■□□□ 1.81
KDM4B-211ENST00000611640 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
KDM4B-211ENST00000611640 APLP2Q06481 763 aa25.85■■□□□ 1.73
KDM4B-211ENST00000611640 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.8■■□□□ 1.72
KDM4B-211ENST00000611640 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
KDM4B-211ENST00000611640 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
KDM4B-211ENST00000611640 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
KDM4B-211ENST00000611640 TRIM41Q8WV44 630 aa25.32■■□□□ 1.64
KDM4B-211ENST00000611640 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
KDM4B-211ENST00000611640 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
KDM4B-211ENST00000611640 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
KDM4B-211ENST00000611640 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
KDM4B-211ENST00000611640 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.93■■□□□ 1.58
KDM4B-211ENST00000611640 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
KDM4B-211ENST00000611640 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
KDM4B-211ENST00000611640 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
KDM4B-211ENST00000611640 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
KDM4B-211ENST00000611640 NEFLP07196 543 aa24.64■■□□□ 1.53
KDM4B-211ENST00000611640 HRCP23327 699 aa24.63■■□□□ 1.53
KDM4B-211ENST00000611640 MYT1Q01538 1121 aa24.5■■□□□ 1.51
KDM4B-211ENST00000611640 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.42■■□□□ 1.5
KDM4B-211ENST00000611640 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.41■■□□□ 1.5
KDM4B-211ENST00000611640 ITGAEP38570 1179 aa24.17■■□□□ 1.46
KDM4B-211ENST00000611640 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
KDM4B-211ENST00000611640 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
KDM4B-211ENST00000611640 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.93■■□□□ 1.42
KDM4B-211ENST00000611640 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
KDM4B-211ENST00000611640 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
KDM4B-211ENST00000611640 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
KDM4B-211ENST00000611640 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.71■■□□□ 1.39
KDM4B-211ENST00000611640 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
KDM4B-211ENST00000611640 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.48■■□□□ 1.35
KDM4B-211ENST00000611640 NEUROD1Q13562 356 aa23.44■■□□□ 1.34
KDM4B-211ENST00000611640 TRIM52Q96A61 297 aa23.4■■□□□ 1.34
KDM4B-211ENST00000611640 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
KDM4B-211ENST00000611640 ABCC9O60706 1549 aa23.37■■□□□ 1.33
KDM4B-211ENST00000611640 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
KDM4B-211ENST00000611640 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
KDM4B-211ENST00000611640 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
KDM4B-211ENST00000611640 BCANQ96GW7 911 aa23.33■■□□□ 1.33
KDM4B-211ENST00000611640 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.31■■□□□ 1.32
KDM4B-211ENST00000611640 ANP32CO43423 234 aa23.29■■□□□ 1.32
KDM4B-211ENST00000611640 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
KDM4B-211ENST00000611640 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
KDM4B-211ENST00000611640 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
KDM4B-211ENST00000611640 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.11■■□□□ 1.29
KDM4B-211ENST00000611640 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.97■■□□□ 1.27
KDM4B-211ENST00000611640 P3H3Q8IVL6 736 aa22.94■■□□□ 1.26
KDM4B-211ENST00000611640 FBLN2P98095 1184 aa22.84■■□□□ 1.25
KDM4B-211ENST00000611640 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
KDM4B-211ENST00000611640 ARID3CA6NKF2 412 aa22.79■■□□□ 1.24
KDM4B-211ENST00000611640 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
KDM4B-211ENST00000611640 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
KDM4B-211ENST00000611640 SCRIBQ14160 1630 aa22.77■■□□□ 1.24
KDM4B-211ENST00000611640 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
KDM4B-211ENST00000611640 FKBP8Q14318 412 aa22.72■■□□□ 1.23
KDM4B-211ENST00000611640 TONSLQ96HA7 1378 aa22.69■■□□□ 1.22
KDM4B-211ENST00000611640 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
KDM4B-211ENST00000611640 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
KDM4B-211ENST00000611640 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
KDM4B-211ENST00000611640 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
KDM4B-211ENST00000611640 NEFMP07197 916 aa22.59■■□□□ 1.21
KDM4B-211ENST00000611640 BCL11AQ9H165 835 aa22.57■■□□□ 1.2
KDM4B-211ENST00000611640 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.52■■□□□ 1.19
KDM4B-211ENST00000611640 SLC24A1O60721 1099 aa22.49■■□□□ 1.19
KDM4B-211ENST00000611640 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
KDM4B-211ENST00000611640 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.44■■□□□ 1.18
KDM4B-211ENST00000611640 MIER1Q8N108 512 aa22.43■■□□□ 1.18
KDM4B-211ENST00000611640 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.39■■□□□ 1.17
KDM4B-211ENST00000611640 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.36■■□□□ 1.17
KDM4B-211ENST00000611640 CLIP1P30622 1438 aa22.36■■□□□ 1.17
KDM4B-211ENST00000611640 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
KDM4B-211ENST00000611640 TMC1Q8TDI8 760 aa22.33■■□□□ 1.17
KDM4B-211ENST00000611640 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.33■■□□□ 1.17
KDM4B-211ENST00000611640 MRS2Q9HD23 443 aa22.3■■□□□ 1.16
KDM4B-211ENST00000611640 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
KDM4B-211ENST00000611640 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
KDM4B-211ENST00000611640 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.26■■□□□ 1.15
KDM4B-211ENST00000611640 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
KDM4B-211ENST00000611640 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
KDM4B-211ENST00000611640 CEP162Q5TB80 1403 aa22.23■■□□□ 1.15
KDM4B-211ENST00000611640 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
KDM4B-211ENST00000611640 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
KDM4B-211ENST00000611640 GOLGA3Q08378 1498 aa22.21■■□□□ 1.15
KDM4B-211ENST00000611640 NBR1Q14596 966 aa22.2■■□□□ 1.14
KDM4B-211ENST00000611640 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
KDM4B-211ENST00000611640 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.142e-6■■□□□ 11.4
KDM4B-211ENST00000611640 EEA1Q15075 1411 aa22.19■■□□□ 1.14
KDM4B-211ENST00000611640 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
KDM4B-211ENST00000611640 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
KDM4B-211ENST00000611640 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.143e-6■■■□□ 14.8
KDM4B-211ENST00000611640 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.17■■□□□ 1.14
KDM4B-211ENST00000611640 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.145e-7■■■■■ 38.1
KDM4B-211ENST00000611640 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.14■■□□□ 1.13
KDM4B-211ENST00000611640 TSPY4P0CV99 314 aa22.13■■□□□ 1.13
KDM4B-211ENST00000611640 TSPY10P0CW01 314 aa22.13■■□□□ 1.13
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