RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480567.5

SSR2-210, Transcript of signal sequence receptor subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR2, Length 895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR2-210ENST00000480567 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.68■■■■■ 6.5
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SSR2-210ENST00000480567 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47■■■■■ 5.11
SSR2-210ENST00000480567 NACADO15069 1562 aa46.85■■■■■ 5.09
SSR2-210ENST00000480567 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.76■■■■■ 5.08
SSR2-210ENST00000480567 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.43■■■■■ 5.02
SSR2-210ENST00000480567 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.26■■■■■ 5
SSR2-210ENST00000480567 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.04■■■■■ 4.96
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SSR2-210ENST00000480567 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.85■■■■■ 4.93
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SSR2-210ENST00000480567 SCRIBQ14160 1630 aa45.27■■■■■ 4.84
SSR2-210ENST00000480567 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.08■■■■■ 4.81
SSR2-210ENST00000480567 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
SSR2-210ENST00000480567 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.38■■■■■ 4.69
SSR2-210ENST00000480567 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.18■■■■■ 4.66
SSR2-210ENST00000480567 SMARCA4P51532 1647 aa43.28■■■■■ 4.52
SSR2-210ENST00000480567 NCAPD3P42695 1498 aa43.26■■■■■ 4.52
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SSR2-210ENST00000480567 SMARCA2P51531 1590 aa43.1■■■■■ 4.49
SSR2-210ENST00000480567 HMGXB3Q12766 1538 aa42.96■■■■■ 4.47
SSR2-210ENST00000480567 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.9■■■■■ 4.46
SSR2-210ENST00000480567 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.88■■■■■ 4.45
SSR2-210ENST00000480567 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.8■■■■■ 4.44
SSR2-210ENST00000480567 WIZO95785 1651 aa42.39■■■■■ 4.38
SSR2-210ENST00000480567 NESP48681 1621 aa42.35■■■■■ 4.37
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SSR2-210ENST00000480567 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.26■■■■■ 4.36
SSR2-210ENST00000480567 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.15■■■■■ 4.34
SSR2-210ENST00000480567 CUX2O14529 1486 aa42.08■■■■■ 4.33
SSR2-210ENST00000480567 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.99■■■■■ 4.31
SSR2-210ENST00000480567 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.93■■■■■ 4.3
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SSR2-210ENST00000480567 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
SSR2-210ENST00000480567 CFTRP13569 1480 aa41.62■■■■■ 4.25
SSR2-210ENST00000480567 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.49■■■■■ 4.23
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SSR2-210ENST00000480567 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.47■■■■■ 4.23
SSR2-210ENST00000480567 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.45■■■■■ 4.23
SSR2-210ENST00000480567 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.42■■■■■ 4.22
SSR2-210ENST00000480567 WDR62O43379 1518 aa41.37■■■■■ 4.21
SSR2-210ENST00000480567 PRDM2Q13029 1718 aa41.17■■■■■ 4.18
SSR2-210ENST00000480567 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
SSR2-210ENST00000480567 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
SSR2-210ENST00000480567 TOPBP1Q92547 1522 aa40.75■■■■■ 4.11
SSR2-210ENST00000480567 ABCC8Q09428 1581 aa40.74■■■■■ 4.11
SSR2-210ENST00000480567 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.65■■■■■ 4.1
SSR2-210ENST00000480567 IFT140Q96RY7 1462 aa40.62■■■■■ 4.09
SSR2-210ENST00000480567 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
SSR2-210ENST00000480567 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
SSR2-210ENST00000480567 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
SSR2-210ENST00000480567 OSCARQ8IYS5 282 aa40.31■■■■■ 4.04
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SSR2-210ENST00000480567 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
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SSR2-210ENST00000480567 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.22■■■■■ 4.03
SSR2-210ENST00000480567 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.21■■■■■ 4.03
SSR2-210ENST00000480567 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.2■■■■■ 4.03
SSR2-210ENST00000480567 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4
SSR2-210ENST00000480567 WDR97A6NE52 1622 aa39.97■■■■□ 3.99
SSR2-210ENST00000480567 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.84■■■■□ 3.97
SSR2-210ENST00000480567 FBLN2P98095 1184 aa39.84■■■■□ 3.97
SSR2-210ENST00000480567 CHD1O14646 1710 aa39.82■■■■□ 3.97
SSR2-210ENST00000480567 TRIM41Q8WV44 630 aa39.81■■■■□ 3.96
SSR2-210ENST00000480567 GRIN2BQ13224 1484 aa39.8■■■■□ 3.96
SSR2-210ENST00000480567 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.8■■■■□ 3.96
SSR2-210ENST00000480567 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.79■■■■□ 3.96
SSR2-210ENST00000480567 TOP2BQ02880 1626 aa39.78■■■■□ 3.96
SSR2-210ENST00000480567 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.76■■■■□ 3.96
SSR2-210ENST00000480567 SYNJ1O43426 1573 aa39.74■■■■□ 3.95
SSR2-210ENST00000480567 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.74■■■■□ 3.95
SSR2-210ENST00000480567 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
SSR2-210ENST00000480567 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
SSR2-210ENST00000480567 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.65■■■■□ 3.94
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SSR2-210ENST00000480567 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.64■■■■□ 3.94
SSR2-210ENST00000480567 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.64■■■■□ 3.94
SSR2-210ENST00000480567 PBRM1Q86U86 1689 aa39.61■■■■□ 3.93
SSR2-210ENST00000480567 ARHGEF11O15085 1522 aa39.6■■■■□ 3.93
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SSR2-210ENST00000480567 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.27■■■■□ 3.88
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SSR2-210ENST00000480567 NUP160Q12769 1436 aa39.14■■■■□ 3.86
SSR2-210ENST00000480567 CEP170Q5SW79 1584 aa39.08■■■■□ 3.85
SSR2-210ENST00000480567 KIF27Q86VH2 1401 aa39.06■■■■□ 3.84
SSR2-210ENST00000480567 IGF1RP08069 1367 aa38.99■■■■□ 3.83
SSR2-210ENST00000480567 SHROOM2Q13796 1616 aa38.86■■■■□ 3.81
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SSR2-210ENST00000480567 JPH4Q96JJ6 628 aa38.78■■■■□ 3.8
SSR2-210ENST00000480567 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.73■■■■□ 3.79
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