RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576353.5

SNF8-217, Transcript of SNF8, ESCRT-II complex subunit, humanhuman

TSL 5

Gene SNF8, Length 700 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8-217ENST00000576353 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.09■■■■■ 6.73
SNF8-217ENST00000576353 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.73■■■■■ 5.71
SNF8-217ENST00000576353 ABCC9O60706 1549 aa49.85■■■■■ 5.57
SNF8-217ENST00000576353 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.88■■■■■ 5.26
SNF8-217ENST00000576353 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.88■■■■■ 5.26
SNF8-217ENST00000576353 NACADO15069 1562 aa47.81■■■■■ 5.24
SNF8-217ENST00000576353 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.51■■■■■ 5.2
SNF8-217ENST00000576353 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.5■■■■■ 5.19
SNF8-217ENST00000576353 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.24■■■■■ 5.15
SNF8-217ENST00000576353 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.61■■■■■ 5.055e-8■■■□□ 16.1
SNF8-217ENST00000576353 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.61■■■■■ 5.05
SNF8-217ENST00000576353 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.37■■■■■ 5.01
SNF8-217ENST00000576353 SCRIBQ14160 1630 aa46.29■■■■■ 5
SNF8-217ENST00000576353 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.98■■■■■ 4.95
SNF8-217ENST00000576353 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.9■■■■■ 4.94
SNF8-217ENST00000576353 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.2■■■■■ 4.83
SNF8-217ENST00000576353 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.03■■■■■ 4.8
SNF8-217ENST00000576353 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.82■■■■■ 4.77
SNF8-217ENST00000576353 SMARCA4P51532 1647 aa44.27■■■■■ 4.68
SNF8-217ENST00000576353 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.26■■■■■ 4.68
SNF8-217ENST00000576353 NCAPD3P42695 1498 aa44.15■■■■■ 4.66
SNF8-217ENST00000576353 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.14■■■■■ 4.66
SNF8-217ENST00000576353 SMARCA2P51531 1590 aa44.07■■■■■ 4.65
SNF8-217ENST00000576353 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.97■■■■■ 4.63
SNF8-217ENST00000576353 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.87■■■■■ 4.61
SNF8-217ENST00000576353 HMGXB3Q12766 1538 aa43.86■■■■■ 4.61
SNF8-217ENST00000576353 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.76■■■■■ 4.6
SNF8-217ENST00000576353 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
SNF8-217ENST00000576353 WIZO95785 1651 aa43.43■■■■■ 4.54
SNF8-217ENST00000576353 NESP48681 1621 aa43.06■■■■■ 4.48
SNF8-217ENST00000576353 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
SNF8-217ENST00000576353 ERCC6Q03468 1493 aa43.01■■■■■ 4.48
SNF8-217ENST00000576353 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.95■■■■■ 4.47
SNF8-217ENST00000576353 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.89■■■■■ 4.46
SNF8-217ENST00000576353 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.76■■■■■ 4.44
SNF8-217ENST00000576353 CUX2O14529 1486 aa42.59■■■■■ 4.41
SNF8-217ENST00000576353 CFTRP13569 1480 aa42.56■■■■■ 4.4
SNF8-217ENST00000576353 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.55■■■■■ 4.4
SNF8-217ENST00000576353 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.46■■■■■ 4.39
SNF8-217ENST00000576353 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.37
SNF8-217ENST00000576353 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
SNF8-217ENST00000576353 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.35■■■■■ 4.37
SNF8-217ENST00000576353 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.3■■■■■ 4.36
SNF8-217ENST00000576353 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.27■■■■■ 4.36
SNF8-217ENST00000576353 WDR62O43379 1518 aa42.1■■■■■ 4.33
SNF8-217ENST00000576353 PRDM2Q13029 1718 aa42.04■■■■■ 4.32
SNF8-217ENST00000576353 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
SNF8-217ENST00000576353 ABCC8Q09428 1581 aa41.69■■■■■ 4.26
SNF8-217ENST00000576353 TOPBP1Q92547 1522 aa41.64■■■■■ 4.26
SNF8-217ENST00000576353 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.56■■■■■ 4.24
SNF8-217ENST00000576353 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.5■■■■■ 4.23
SNF8-217ENST00000576353 IFT140Q96RY7 1462 aa41.45■■■■■ 4.23
SNF8-217ENST00000576353 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
SNF8-217ENST00000576353 CUX1P39880 1505 aa41.25■■■■■ 4.19
SNF8-217ENST00000576353 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
SNF8-217ENST00000576353 SOGA1O94964 1423 aa41.18■■■■■ 4.18
SNF8-217ENST00000576353 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.15■■■■■ 4.18
SNF8-217ENST00000576353 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
SNF8-217ENST00000576353 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.1■■■■■ 4.17
SNF8-217ENST00000576353 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.02■■■■■ 4.163e-6■■■□□ 17.8
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SNF8-217ENST00000576353 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
SNF8-217ENST00000576353 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
SNF8-217ENST00000576353 OSCARQ8IYS5 282 aa40.9■■■■■ 4.14
SNF8-217ENST00000576353 TOP2BQ02880 1626 aa40.86■■■■■ 4.13
SNF8-217ENST00000576353 WDR97A6NE52 1622 aa40.85■■■■■ 4.13
SNF8-217ENST00000576353 SYNJ1O43426 1573 aa40.82■■■■■ 4.12
SNF8-217ENST00000576353 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.82■■■■■ 4.12
SNF8-217ENST00000576353 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.77■■■■■ 4.12
SNF8-217ENST00000576353 GRIN2BQ13224 1484 aa40.69■■■■■ 4.1
SNF8-217ENST00000576353 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.66■■■■■ 4.1
SNF8-217ENST00000576353 FBLN2P98095 1184 aa40.63■■■■■ 4.09
SNF8-217ENST00000576353 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.6■■■■■ 4.09
SNF8-217ENST00000576353 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
SNF8-217ENST00000576353 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.54■■■■■ 4.08
SNF8-217ENST00000576353 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
SNF8-217ENST00000576353 CHD1O14646 1710 aa40.45■■■■■ 4.07
SNF8-217ENST00000576353 PBRM1Q86U86 1689 aa40.43■■■■■ 4.06
SNF8-217ENST00000576353 SYNJ2O15056 1496 aa40.43■■■■■ 4.06
SNF8-217ENST00000576353 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.27■■■■■ 4.04
SNF8-217ENST00000576353 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.21■■■■■ 4.03
SNF8-217ENST00000576353 KIF27Q86VH2 1401 aa40.19■■■■■ 4.02
SNF8-217ENST00000576353 ADAMTS12P58397 1594 aa40.17■■■■■ 4.02
SNF8-217ENST00000576353 GRIN2AQ12879 1464 aa40.13■■■■■ 4.01
SNF8-217ENST00000576353 ARHGEF11O15085 1522 aa40.11■■■■■ 4.01
SNF8-217ENST00000576353 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.09■■■■■ 4.01
SNF8-217ENST00000576353 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.08■■■■■ 4.01
SNF8-217ENST00000576353 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.08■■■■■ 4.01
SNF8-217ENST00000576353 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.08■■■■■ 4.01
SNF8-217ENST00000576353 TRIM41Q8WV44 630 aa40.07■■■■■ 4.01
SNF8-217ENST00000576353 IGF1RP08069 1367 aa40.05■■■■■ 4
SNF8-217ENST00000576353 NUP160Q12769 1436 aa39.97■■■■□ 3.99
SNF8-217ENST00000576353 CEP170Q5SW79 1584 aa39.88■■■■□ 3.97
SNF8-217ENST00000576353 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.85■■■■□ 3.97
SNF8-217ENST00000576353 CUL7Q14999 1698 aa39.83■■■■□ 3.97
SNF8-217ENST00000576353 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.81■■■■□ 3.96
SNF8-217ENST00000576353 ARAP1Q96P48 1450 aa39.77■■■■□ 3.96
SNF8-217ENST00000576353 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.7■■■■□ 3.95
SNF8-217ENST00000576353 JPH4Q96JJ6 628 aa39.64■■■■□ 3.94
SNF8-217ENST00000576353 SHROOM2Q13796 1616 aa39.6■■■■□ 3.93
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