RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392359.7

CENPX-202, Transcript of centromere protein X, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CENPX, Length 805 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPX-202ENST00000392359 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.47■■■■■ 6.95
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CENPX-202ENST00000392359 SCRIBQ14160 1630 aa47.64■■■■■ 5.22
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CENPX-202ENST00000392359 NCAPD3P42695 1498 aa45.72■■■■■ 4.91
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CENPX-202ENST00000392359 SMARCA2P51531 1590 aa45.41■■■■■ 4.86
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CENPX-202ENST00000392359 NESP48681 1621 aa44.85■■■■■ 4.77
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CENPX-202ENST00000392359 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.59■■■■■ 4.73
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CENPX-202ENST00000392359 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.31■■■■■ 4.68
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CENPX-202ENST00000392359 WDR62O43379 1518 aa43.84■■■■■ 4.61
CENPX-202ENST00000392359 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.76■■■■■ 4.6
CENPX-202ENST00000392359 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.76■■■■■ 4.6
CENPX-202ENST00000392359 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.46■■■■■ 4.55
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CENPX-202ENST00000392359 TOPBP1Q92547 1522 aa42.97■■■■■ 4.47
CENPX-202ENST00000392359 IFT140Q96RY7 1462 aa42.92■■■■■ 4.46
CENPX-202ENST00000392359 ABCC8Q09428 1581 aa42.89■■■■■ 4.46
CENPX-202ENST00000392359 OSCARQ8IYS5 282 aa42.85■■■■■ 4.45
CENPX-202ENST00000392359 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.83■■■■■ 4.45
CENPX-202ENST00000392359 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.82■■■■■ 4.44
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CENPX-202ENST00000392359 CUX1P39880 1505 aa42.3■■■■■ 4.36
CENPX-202ENST00000392359 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.29■■■■■ 4.36
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CENPX-202ENST00000392359 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.24■■■■■ 4.35
CENPX-202ENST00000392359 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.24■■■■■ 4.35
CENPX-202ENST00000392359 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.24■■■■■ 4.35
CENPX-202ENST00000392359 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
CENPX-202ENST00000392359 WDR97A6NE52 1622 aa42.17■■■■■ 4.34
CENPX-202ENST00000392359 ARHGEF11O15085 1522 aa42.17■■■■■ 4.34
CENPX-202ENST00000392359 CHD1O14646 1710 aa42.17■■■■■ 4.34
CENPX-202ENST00000392359 FBLN2P98095 1184 aa42.03■■■■■ 4.32
CENPX-202ENST00000392359 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.01■■■■■ 4.32
CENPX-202ENST00000392359 GRIN2BQ13224 1484 aa41.95■■■■■ 4.31
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CENPX-202ENST00000392359 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.86■■■■■ 4.29
CENPX-202ENST00000392359 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.82■■■■■ 4.29
CENPX-202ENST00000392359 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.82■■■■■ 4.29
CENPX-202ENST00000392359 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.8■■■■■ 4.28
CENPX-202ENST00000392359 SYNJ2O15056 1496 aa41.8■■■■■ 4.28
CENPX-202ENST00000392359 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.79■■■■■ 4.28
CENPX-202ENST00000392359 ARAP1Q96P48 1450 aa41.79■■■■■ 4.28
CENPX-202ENST00000392359 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.76■■■■■ 4.28
CENPX-202ENST00000392359 PBRM1Q86U86 1689 aa41.73■■■■■ 4.27
CENPX-202ENST00000392359 SYNJ1O43426 1573 aa41.72■■■■■ 4.27
CENPX-202ENST00000392359 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.7■■■■■ 4.27
CENPX-202ENST00000392359 TOP2BQ02880 1626 aa41.67■■■■■ 4.26
CENPX-202ENST00000392359 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.66■■■■■ 4.26
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CENPX-202ENST00000392359 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.33■■■■■ 4.21
CENPX-202ENST00000392359 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.32■■■■■ 4.21
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CENPX-202ENST00000392359 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.12■■■■■ 4.17
CENPX-202ENST00000392359 SHROOM2Q13796 1616 aa41.09■■■■■ 4.17
CENPX-202ENST00000392359 IGF1RP08069 1367 aa40.87■■■■■ 4.13
CENPX-202ENST00000392359 KIF27Q86VH2 1401 aa40.85■■■■■ 4.13
CENPX-202ENST00000392359 JPH4Q96JJ6 628 aa40.85■■■■■ 4.13
CENPX-202ENST00000392359 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
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