RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584600.5

CENPX-210, Transcript of centromere protein X, humanhuman

TSL 2

Gene CENPX, Length 730 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPX-210ENST00000584600 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.81■■■■□ 3.96
CENPX-210ENST00000584600 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.44■■■■□ 3.26
CENPX-210ENST00000584600 ABCC9O60706 1549 aa35.42■■■■□ 3.26
CENPX-210ENST00000584600 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.81■■■■□ 3
CENPX-210ENST00000584600 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.51■■■□□ 2.95
CENPX-210ENST00000584600 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.43■■■□□ 2.94
CENPX-210ENST00000584600 NACADO15069 1562 aa33.41■■■□□ 2.94
CENPX-210ENST00000584600 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.12■■■□□ 2.89
CENPX-210ENST00000584600 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.1■■■□□ 2.89
CENPX-210ENST00000584600 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.98■■■□□ 2.874e-7■■■■■ 35.2
CENPX-210ENST00000584600 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.89■■■□□ 2.86
CENPX-210ENST00000584600 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.76■■■□□ 2.83
CENPX-210ENST00000584600 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.6■■■□□ 2.81
CENPX-210ENST00000584600 SCRIBQ14160 1630 aa32.38■■■□□ 2.77
CENPX-210ENST00000584600 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.1■■■□□ 2.73
CENPX-210ENST00000584600 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.97■■■□□ 2.71
CENPX-210ENST00000584600 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.94■■■□□ 2.7
CENPX-210ENST00000584600 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
CENPX-210ENST00000584600 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.31■■■□□ 2.6
CENPX-210ENST00000584600 SMARCA4P51532 1647 aa30.93■■■□□ 2.54
CENPX-210ENST00000584600 NCAPD3P42695 1498 aa30.86■■■□□ 2.53
CENPX-210ENST00000584600 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.85■■■□□ 2.53
CENPX-210ENST00000584600 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
CENPX-210ENST00000584600 SMARCA2P51531 1590 aa30.77■■■□□ 2.52
CENPX-210ENST00000584600 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.71■■■□□ 2.51
CENPX-210ENST00000584600 CUX2O14529 1486 aa30.67■■■□□ 2.5
CENPX-210ENST00000584600 HMGXB3Q12766 1538 aa30.66■■■□□ 2.5
CENPX-210ENST00000584600 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.62■■■□□ 2.49
CENPX-210ENST00000584600 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
CENPX-210ENST00000584600 ERCC6Q03468 1493 aa30.53■■■□□ 2.48
CENPX-210ENST00000584600 WIZO95785 1651 aa30.34■■■□□ 2.45
CENPX-210ENST00000584600 NESP48681 1621 aa30.33■■■□□ 2.45
CENPX-210ENST00000584600 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
CENPX-210ENST00000584600 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.06■■■□□ 2.4
CENPX-210ENST00000584600 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
CENPX-210ENST00000584600 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
CENPX-210ENST00000584600 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.96■■■□□ 2.39
CENPX-210ENST00000584600 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.88■■■□□ 2.37
CENPX-210ENST00000584600 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.86■■■□□ 2.37
CENPX-210ENST00000584600 CFTRP13569 1480 aa29.72■■■□□ 2.35
CENPX-210ENST00000584600 TRIM41Q8WV44 630 aa29.67■■■□□ 2.34
CENPX-210ENST00000584600 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.67■■■□□ 2.34
CENPX-210ENST00000584600 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.61■■■□□ 2.33
CENPX-210ENST00000584600 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.6■■■□□ 2.33
CENPX-210ENST00000584600 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.59■■■□□ 2.33
CENPX-210ENST00000584600 WDR62O43379 1518 aa29.53■■■□□ 2.32
CENPX-210ENST00000584600 PRDM2Q13029 1718 aa29.4■■■□□ 2.3
CENPX-210ENST00000584600 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
CENPX-210ENST00000584600 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
CENPX-210ENST00000584600 OSCARQ8IYS5 282 aa29.29■■■□□ 2.28
CENPX-210ENST00000584600 TOPBP1Q92547 1522 aa29.11■■■□□ 2.25
CENPX-210ENST00000584600 ABCC8Q09428 1581 aa29.05■■■□□ 2.24
CENPX-210ENST00000584600 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.03■■■□□ 2.24
CENPX-210ENST00000584600 IFT140Q96RY7 1462 aa28.97■■■□□ 2.23
CENPX-210ENST00000584600 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
CENPX-210ENST00000584600 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.89■■■□□ 2.22
CENPX-210ENST00000584600 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.89■■■□□ 2.22
CENPX-210ENST00000584600 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.89■■■□□ 2.22
CENPX-210ENST00000584600 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
CENPX-210ENST00000584600 CUX1P39880 1505 aa28.81■■■□□ 2.2
CENPX-210ENST00000584600 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
CENPX-210ENST00000584600 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.75■■■□□ 2.19
CENPX-210ENST00000584600 ARHGEF11O15085 1522 aa28.74■■■□□ 2.19
CENPX-210ENST00000584600 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.74■■■□□ 2.19
CENPX-210ENST00000584600 SOGA1O94964 1423 aa28.74■■■□□ 2.19
CENPX-210ENST00000584600 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
CENPX-210ENST00000584600 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.72■■■□□ 2.192e-7■■■■□ 22.9
CENPX-210ENST00000584600 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.64■■■□□ 2.18
CENPX-210ENST00000584600 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
CENPX-210ENST00000584600 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.52■■■□□ 2.16
CENPX-210ENST00000584600 CHD1O14646 1710 aa28.5■■■□□ 2.15
CENPX-210ENST00000584600 WDR97A6NE52 1622 aa28.5■■■□□ 2.15
CENPX-210ENST00000584600 TOP2BQ02880 1626 aa28.47■■■□□ 2.15
CENPX-210ENST00000584600 SYNJ1O43426 1573 aa28.46■■■□□ 2.15
CENPX-210ENST00000584600 ARAP1Q96P48 1450 aa28.46■■■□□ 2.15
CENPX-210ENST00000584600 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.45■■■□□ 2.14
CENPX-210ENST00000584600 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.44■■■□□ 2.14
CENPX-210ENST00000584600 FBLN2P98095 1184 aa28.43■■■□□ 2.14
CENPX-210ENST00000584600 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.42■■■□□ 2.14
CENPX-210ENST00000584600 GRIN2BQ13224 1484 aa28.41■■■□□ 2.14
CENPX-210ENST00000584600 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CENPX-210ENST00000584600 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.39■■■□□ 2.13
CENPX-210ENST00000584600 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
CENPX-210ENST00000584600 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.34■■■□□ 2.13
CENPX-210ENST00000584600 PBRM1Q86U86 1689 aa28.31■■■□□ 2.12
CENPX-210ENST00000584600 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
CENPX-210ENST00000584600 SYNJ2O15056 1496 aa28.26■■■□□ 2.11
CENPX-210ENST00000584600 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.18■■■□□ 2.1
CENPX-210ENST00000584600 ADAMTS12P58397 1594 aa28.09■■■□□ 2.09
CENPX-210ENST00000584600 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.08■■■□□ 2.08
CENPX-210ENST00000584600 GRIN2AQ12879 1464 aa28.05■■■□□ 2.08
CENPX-210ENST00000584600 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.04■■■□□ 2.08
CENPX-210ENST00000584600 KIF27Q86VH2 1401 aa27.94■■■□□ 2.06
CENPX-210ENST00000584600 NUP160Q12769 1436 aa27.93■■■□□ 2.06
CENPX-210ENST00000584600 CEP170Q5SW79 1584 aa27.93■■■□□ 2.06
CENPX-210ENST00000584600 IGF1RP08069 1367 aa27.89■■■□□ 2.06
CENPX-210ENST00000584600 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
CENPX-210ENST00000584600 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.77■■■□□ 2.04
CENPX-210ENST00000584600 CUL7Q14999 1698 aa27.75■■■□□ 2.03
CENPX-210ENST00000584600 SHROOM2Q13796 1616 aa27.74■■■□□ 2.03
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