RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215882.9

SLC25A1-201, Transcript of solute carrier family 25 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A1, Length 1,648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1-201ENST00000215882 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.15■■■■■ 6.26
SLC25A1-201ENST00000215882 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.85■■■■■ 5.25
SLC25A1-201ENST00000215882 ABCC9O60706 1549 aa46.17■■■■■ 4.98
SLC25A1-201ENST00000215882 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.24■■■■■ 4.83
SLC25A1-201ENST00000215882 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.01■■■■■ 4.8
SLC25A1-201ENST00000215882 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.83■■■■■ 4.77
SLC25A1-201ENST00000215882 NACADO15069 1562 aa44.82■■■■■ 4.77
SLC25A1-201ENST00000215882 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.76■■■■■ 4.76
SLC25A1-201ENST00000215882 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.71■■■■■ 4.75
SLC25A1-201ENST00000215882 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.75■■■■■ 4.59
SLC25A1-201ENST00000215882 SCRIBQ14160 1630 aa43.72■■■■■ 4.59
SLC25A1-201ENST00000215882 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.34■■■■■ 4.53
SLC25A1-201ENST00000215882 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.26■■■■■ 4.528e-6■□□□□ 8.9
SLC25A1-201ENST00000215882 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.2■■■■■ 4.51
SLC25A1-201ENST00000215882 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
SLC25A1-201ENST00000215882 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.11■■■■■ 4.33
SLC25A1-201ENST00000215882 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
SLC25A1-201ENST00000215882 SMARCA4P51532 1647 aa41.88■■■■■ 4.29
SLC25A1-201ENST00000215882 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.81■■■■■ 4.28
SLC25A1-201ENST00000215882 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.76■■■■■ 4.28
SLC25A1-201ENST00000215882 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.75■■■■■ 4.27
SLC25A1-201ENST00000215882 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
SLC25A1-201ENST00000215882 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.47■■■■■ 4.23
SLC25A1-201ENST00000215882 SMARCA2P51531 1590 aa41.46■■■■■ 4.23
SLC25A1-201ENST00000215882 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.46■■■■■ 4.23
SLC25A1-201ENST00000215882 WIZO95785 1651 aa41.36■■■■■ 4.21
SLC25A1-201ENST00000215882 NCAPD3P42695 1498 aa41.35■■■■■ 4.21
SLC25A1-201ENST00000215882 HMGXB3Q12766 1538 aa41.2■■■■■ 4.19
SLC25A1-201ENST00000215882 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
SLC25A1-201ENST00000215882 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
SLC25A1-201ENST00000215882 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
SLC25A1-201ENST00000215882 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.46■■■■■ 4.07
SLC25A1-201ENST00000215882 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.18■■■■■ 4.02
SLC25A1-201ENST00000215882 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.16■■■■■ 4.02
SLC25A1-201ENST00000215882 NESP48681 1621 aa40.16■■■■■ 4.02
SLC25A1-201ENST00000215882 CFTRP13569 1480 aa40.09■■■■■ 4.01
SLC25A1-201ENST00000215882 PRDM2Q13029 1718 aa39.88■■■■□ 3.97
SLC25A1-201ENST00000215882 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.86■■■■□ 3.97
SLC25A1-201ENST00000215882 ERCC6Q03468 1493 aa39.74■■■■□ 3.95
SLC25A1-201ENST00000215882 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.72■■■■□ 3.95
SLC25A1-201ENST00000215882 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.72■■■■□ 3.95
SLC25A1-201ENST00000215882 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.61■■■■□ 3.93
SLC25A1-201ENST00000215882 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.4■■■■□ 3.9
SLC25A1-201ENST00000215882 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.39■■■■□ 3.9
SLC25A1-201ENST00000215882 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
SLC25A1-201ENST00000215882 WDR62O43379 1518 aa39.25■■■■□ 3.87
SLC25A1-201ENST00000215882 ABCC8Q09428 1581 aa39.21■■■■□ 3.87
SLC25A1-201ENST00000215882 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.18■■■■□ 3.86
SLC25A1-201ENST00000215882 TOPBP1Q92547 1522 aa39.16■■■■□ 3.86
SLC25A1-201ENST00000215882 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.13■■■■□ 3.85
SLC25A1-201ENST00000215882 CUX1P39880 1505 aa39.12■■■■□ 3.85
SLC25A1-201ENST00000215882 CUX2O14529 1486 aa39.05■■■■□ 3.84
SLC25A1-201ENST00000215882 SYNJ1O43426 1573 aa39■■■■□ 3.83
SLC25A1-201ENST00000215882 TOP2BQ02880 1626 aa38.98■■■■□ 3.83
SLC25A1-201ENST00000215882 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.97■■■■□ 3.83
SLC25A1-201ENST00000215882 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.88■■■■□ 3.82
SLC25A1-201ENST00000215882 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.88■■■■□ 3.82
SLC25A1-201ENST00000215882 IFT140Q96RY7 1462 aa38.74■■■■□ 3.79
SLC25A1-201ENST00000215882 SOGA1O94964 1423 aa38.74■■■■□ 3.79
SLC25A1-201ENST00000215882 TRIM41Q8WV44 630 aa38.71■■■■□ 3.79
SLC25A1-201ENST00000215882 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.7■■■■□ 3.79
SLC25A1-201ENST00000215882 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.7■■■■□ 3.79
SLC25A1-201ENST00000215882 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.66■■■■□ 3.78
SLC25A1-201ENST00000215882 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.54■■■■□ 3.76
SLC25A1-201ENST00000215882 WDR97A6NE52 1622 aa38.54■■■■□ 3.76
SLC25A1-201ENST00000215882 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.52■■■■□ 3.76
SLC25A1-201ENST00000215882 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
SLC25A1-201ENST00000215882 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.41■■■■□ 3.74
SLC25A1-201ENST00000215882 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.39■■■■□ 3.745e-9■■■□□ 15.7
SLC25A1-201ENST00000215882 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.33■■■■□ 3.73
SLC25A1-201ENST00000215882 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.3■■■■□ 3.72
SLC25A1-201ENST00000215882 KIF27Q86VH2 1401 aa38.26■■■■□ 3.72
SLC25A1-201ENST00000215882 PBRM1Q86U86 1689 aa38.19■■■■□ 3.7
SLC25A1-201ENST00000215882 GRIN2BQ13224 1484 aa38.19■■■■□ 3.7
SLC25A1-201ENST00000215882 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.13■■■■□ 3.69
SLC25A1-201ENST00000215882 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.09■■■■□ 3.69
SLC25A1-201ENST00000215882 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.04■■■■□ 3.68
SLC25A1-201ENST00000215882 IGF1RP08069 1367 aa38.02■■■■□ 3.68
SLC25A1-201ENST00000215882 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.02■■■■□ 3.68
SLC25A1-201ENST00000215882 EEA1Q15075 1411 aa37.97■■■■□ 3.67
SLC25A1-201ENST00000215882 ADAMTS12P58397 1594 aa37.91■■■■□ 3.66
SLC25A1-201ENST00000215882 CUL7Q14999 1698 aa37.9■■■■□ 3.66
SLC25A1-201ENST00000215882 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.87■■■■□ 3.65
SLC25A1-201ENST00000215882 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.87■■■■□ 3.65
SLC25A1-201ENST00000215882 SYNJ2O15056 1496 aa37.87■■■■□ 3.65
SLC25A1-201ENST00000215882 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.84■■■■□ 3.65
SLC25A1-201ENST00000215882 FBLN2P98095 1184 aa37.82■■■■□ 3.64
SLC25A1-201ENST00000215882 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.64
SLC25A1-201ENST00000215882 CHD1O14646 1710 aa37.81■■■■□ 3.64
SLC25A1-201ENST00000215882 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.81■■■■□ 3.64
SLC25A1-201ENST00000215882 GRIN2AQ12879 1464 aa37.71■■■■□ 3.63
SLC25A1-201ENST00000215882 PRXQ9BXM0 1461 aa37.7■■■■□ 3.63
SLC25A1-201ENST00000215882 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.66■■■■□ 3.62
SLC25A1-201ENST00000215882 OSCARQ8IYS5 282 aa37.6■■■■□ 3.61
SLC25A1-201ENST00000215882 KIF21BO75037 1637 aa37.54■■■■□ 3.6
SLC25A1-201ENST00000215882 NUP160Q12769 1436 aa37.5■■■■□ 3.59
SLC25A1-201ENST00000215882 CEP170Q5SW79 1584 aa37.49■■■■□ 3.59
SLC25A1-201ENST00000215882 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.38■■■■□ 3.57
SLC25A1-201ENST00000215882 GOLGA3Q08378 1498 aa37.36■■■■□ 3.57
SLC25A1-201ENST00000215882 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.33■■■■□ 3.57
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