Protein–RNA interactions for Protein: P12956

XRCC6, X-ray repair cross-complementing protein 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC6P12956 AGAP3-213ENST00000475145 413 ntTSL 213.04□□□□□ -0.326e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 GMDS-AS1-214ENST00000534468 724 ntTSL 313.02□□□□□ -0.336e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 PRPF40A-202ENST00000410080 8048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.386e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 SNAPC5-204ENST00000562411 587 ntTSL 312.15□□□□□ -0.466e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 UQCC1-212ENST00000443429 692 ntTSL 512.01□□□□□ -0.496e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 HPS4-217ENST00000496385 2772 ntTSL 211.67□□□□□ -0.546e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 HPS4-203ENST00000402105 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.556e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 GMDS-AS1-213ENST00000534441 738 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.656e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 HPS4-208ENST00000464362 4277 ntTSL 510.93□□□□□ -0.666e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 HPS4-206ENST00000439453 3936 ntTSL 1 (best)10.9□□□□□ -0.666e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 HDAC7-229ENST00000549883 537 ntTSL 310.87□□□□□ -0.676e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 HPS4-204ENST00000422379 1942 ntTSL 510.3□□□□□ -0.766e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 HPS4-201ENST00000336873 3786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.86e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 HPS4-205ENST00000429411 3492 ntTSL 29.95□□□□□ -0.826e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 AGAP3-208ENST00000468796 540 ntTSL 49.78□□□□□ -0.846e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 UQCC1-218ENST00000491040 1017 ntTSL 1 (best)9.76□□□□□ -0.856e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 HPS4-209ENST00000466781 6136 ntTSL 1 (best)9.64□□□□□ -0.876e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 UQCC1-211ENST00000438533 736 ntTSL 39.35□□□□□ -0.916e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 HPS4-207ENST00000459918 556 ntTSL 58.64□□□□□ -1.036e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 UQCC1-222ENST00000497717 471 ntTSL 58.63□□□□□ -1.036e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.066e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 NAP1L4-215ENST00000528363 685 ntTSL 28.07□□□□□ -1.126e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 NAP1L4-210ENST00000492685 850 ntTSL 57.77□□□□□ -1.176e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 PRPF40A-210ENST00000489741 776 ntTSL 37.05□□□□□ -1.286e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 UQCC1-223ENST00000498651 781 ntTSL 36.65□□□□□ -1.346e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 USP25-209ENST00000547201 757 ntTSL 26.05□□□□□ -1.446e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 USP25-210ENST00000549362 606 ntTSL 25.22□□□□□ -1.576e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.427e-13■■■■■ 31.2
XRCC6P12956 PHF3-204ENST00000481385 2787 ntTSL 217.23■□□□□ 0.357e-13■■■■■ 31.2
XRCC6P12956 PHF3-212ENST00000515594 3074 ntTSL 216.34■□□□□ 0.217e-13■■■■■ 31.2
XRCC6P12956 PHF3-205ENST00000494284 2854 ntTSL 215.31■□□□□ 0.047e-13■■■■■ 31.2
XRCC6P12956 PHF3-208ENST00000506783 3700 ntTSL 1 (best)11.92□□□□□ -0.57e-13■■■■■ 31.2
XRCC6P12956 PHF3-201ENST00000262043 8233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.557e-13■■■■■ 31.2
XRCC6P12956 PHF3-210ENST00000509876 7124 ntTSL 1 (best)5.56□□□□□ -1.527e-13■■■■■ 31.2
XRCC6P12956 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.813e-6■■■■■ 31.2
XRCC6P12956 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.462e-12■■■■■ 31
XRCC6P12956 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 30.8
XRCC6P12956 TUBA1C-209ENST00000552448 1800 ntTSL 313.92□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 30.8
XRCC6P12956 TUBA1C-202ENST00000541364 1695 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 30.8
XRCC6P12956 TUBA1C-210ENST00000639419 1075 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 30.8
XRCC6P12956 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.862e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.562e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.472e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.452e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.322e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 ZGPAT-208ENST00000472711 787 ntTSL 322.4■■□□□ 1.182e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.052e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.042e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 INSIG2-203ENST00000467223 627 ntTSL 521.38■■□□□ 1.012e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 ZGPAT-207ENST00000468235 594 ntTSL 1 (best)20.27■□□□□ 0.842e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 ZGPAT-209ENST00000477340 2831 ntTSL 220.22■□□□□ 0.832e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.822e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.792e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 ZGPAT-210ENST00000478385 935 ntTSL 219.1■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 INSIG2-202ENST00000411929 574 ntTSL 217.27■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 TFAP4-206ENST00000575320 6491 ntTSL 215.91■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 TFAP4-205ENST00000575300 1326 ntTSL 214.58□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 VTA1-203ENST00000452973 3177 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 TFAP4-204ENST00000574639 595 ntTSL 512.58□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 INSIG2-206ENST00000485520 3185 ntTSL 512.42□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 TFAP4-203ENST00000573476 785 ntTSL 312.25□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 VTA1-205ENST00000620996 3272 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 INSIG2-204ENST00000471186 2100 ntTSL 511.39□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 VTA1-201ENST00000367621 1284 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 INSIG2-201ENST00000245787 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.042e-7■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 RPS16-205ENST00000599705 407 ntTSL 310.46□□□□□ -0.733e-12■■■■■ 30.5
XRCC6P12956 HNMT-205ENST00000467390 532 ntTSL 26.06□□□□□ -1.443e-7■■■■■ 30.1
XRCC6P12956 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.513e-7■■■■■ 30.1
XRCC6P12956 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.573e-7■■■■■ 30.1
XRCC6P12956 HNMT-208ENST00000485653 675 ntTSL 53.65□□□□□ -1.833e-7■■■■■ 30.1
XRCC6P12956 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.492e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.342e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.162e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.982e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 UBE2I-215ENST00000567074 884 ntTSL 1 (best)21.15■□□□□ 0.982e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 MBD1-223ENST00000590215 749 ntTSL 520.98■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 UBE2I-212ENST00000566159 2642 nt20.02■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 MBD1-221ENST00000589867 673 ntTSL 319.32■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 MBD1-213ENST00000586118 1012 ntTSL 319.32■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 MBD1-227ENST00000592060 1952 ntTSL 1 (best)18.98■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 PFKL-209ENST00000495274 951 ntTSL 218.41■□□□□ 0.542e-17■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 MBD1-219ENST00000589733 767 ntTSL 217.04■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 29.9
Retrieved 100 of 6,788 protein–RNA pairs in 260.2 ms