RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534468.1

GMDS-AS1-214, humanhuman

TSL 3

Gene GMDS-AS1, Length 724 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-214ENST00000534468 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.52■■■□□ 2.8
GMDS-AS1-214ENST00000534468 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.2■■■□□ 2.42
GMDS-AS1-214ENST00000534468 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
GMDS-AS1-214ENST00000534468 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ABCC9O60706 1549 aa27.78■■■□□ 2.04
GMDS-AS1-214ENST00000534468 FOXD1Q16676 465 aa27.34■■□□□ 1.97
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.26■■□□□ 1.95
GMDS-AS1-214ENST00000534468 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.54■■□□□ 1.84
GMDS-AS1-214ENST00000534468 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.23■■□□□ 1.79
GMDS-AS1-214ENST00000534468 NACADO15069 1562 aa25.95■■□□□ 1.74
GMDS-AS1-214ENST00000534468 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.9■■□□□ 1.74
GMDS-AS1-214ENST00000534468 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.73
GMDS-AS1-214ENST00000534468 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.82■■□□□ 1.72
GMDS-AS1-214ENST00000534468 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.58■■□□□ 1.69
GMDS-AS1-214ENST00000534468 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.55■■□□□ 1.68
GMDS-AS1-214ENST00000534468 MSH5O43196 834 aa25.52■■□□□ 1.68
GMDS-AS1-214ENST00000534468 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
GMDS-AS1-214ENST00000534468 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.44■■□□□ 1.66
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ADRA2BP18089 450 aa25.43■■□□□ 1.66
GMDS-AS1-214ENST00000534468 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.42■■□□□ 1.66
GMDS-AS1-214ENST00000534468 POTEDQ86YR6 584 aa25.12■■□□□ 1.61
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.09■■□□□ 1.61
GMDS-AS1-214ENST00000534468 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.09■■□□□ 1.61
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.06■■□□□ 1.6
GMDS-AS1-214ENST00000534468 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.91■■□□□ 1.58
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
GMDS-AS1-214ENST00000534468 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
GMDS-AS1-214ENST00000534468 SCRIBQ14160 1630 aa24.82■■□□□ 1.56
GMDS-AS1-214ENST00000534468 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.77■■□□□ 1.56
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CUX2O14529 1486 aa24.16■■□□□ 1.46
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ERCC6Q03468 1493 aa24.06■■□□□ 1.44
GMDS-AS1-214ENST00000534468 NCAPD3P42695 1498 aa23.98■■□□□ 1.43
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.81■■□□□ 1.4
GMDS-AS1-214ENST00000534468 SMARCA2P51531 1590 aa23.73■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-214ENST00000534468 NESP48681 1621 aa23.72■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-214ENST00000534468 HMGXB3Q12766 1538 aa23.7■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-214ENST00000534468 SMARCA4P51532 1647 aa23.63■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-214ENST00000534468 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
GMDS-AS1-214ENST00000534468 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
GMDS-AS1-214ENST00000534468 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.48■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-214ENST00000534468 TRIM41Q8WV44 630 aa23.48■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-214ENST00000534468 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-214ENST00000534468 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.42■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-214ENST00000534468 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-214ENST00000534468 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.4■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-214ENST00000534468 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.36■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-214ENST00000534468 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.25■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.25■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-214ENST00000534468 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.21■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-214ENST00000534468 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.2■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-214ENST00000534468 WDR62O43379 1518 aa23.13■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-214ENST00000534468 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-214ENST00000534468 OSCARQ8IYS5 282 aa23.07■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.01■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-214ENST00000534468 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.95■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-214ENST00000534468 WIZO95785 1651 aa22.93■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CFTRP13569 1480 aa22.85■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-214ENST00000534468 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-214ENST00000534468 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.74■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-214ENST00000534468 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.7■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-214ENST00000534468 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.7■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-214ENST00000534468 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.7■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-214ENST00000534468 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-214ENST00000534468 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ARHGEF11O15085 1522 aa22.59■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-214ENST00000534468 IFT140Q96RY7 1462 aa22.59■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.55■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-214ENST00000534468 PRDM2Q13029 1718 aa22.51■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-214ENST00000534468 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-214ENST00000534468 TOPBP1Q92547 1522 aa22.45■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ABCC8Q09428 1581 aa22.42■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.4■■□□□ 1.18
GMDS-AS1-214ENST00000534468 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-214ENST00000534468 FBLN2P98095 1184 aa22.36■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-214ENST00000534468 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-214ENST00000534468 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ARAP1Q96P48 1450 aa22.33■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CHD1O14646 1710 aa22.31■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-214ENST00000534468 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.3■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.3■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-214ENST00000534468 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-214ENST00000534468 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.23■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-214ENST00000534468 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
GMDS-AS1-214ENST00000534468 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
GMDS-AS1-214ENST00000534468 SOGA1O94964 1423 aa22.13■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-214ENST00000534468 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.12■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-214ENST00000534468 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-214ENST00000534468 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.07■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.05■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-214ENST00000534468 SYNJ1O43426 1573 aa22.04■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-214ENST00000534468 WDR97A6NE52 1622 aa22.01■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-214ENST00000534468 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-214ENST00000534468 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.97■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-214ENST00000534468 GRIN2BQ13224 1484 aa21.96■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-214ENST00000534468 SYNJ2O15056 1496 aa21.94■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-214ENST00000534468 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.9■■□□□ 1.1
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