Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.66■□□□□ 0.742e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.732e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 SEPT5-214ENST00000480423 563 ntTSL 419.52■□□□□ 0.722e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 RPL27-208ENST00000593262 1872 ntTSL 219.39■□□□□ 0.692e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 USF2-211ENST00000599471 1173 ntTSL 319.35■□□□□ 0.692e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PHGDH-227ENST00000641811 1031 nt19.14■□□□□ 0.652e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PHGDH-230ENST00000641927 1678 nt19.11■□□□□ 0.652e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PHGDH-214ENST00000641314 1558 nt19.11■□□□□ 0.652e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 ZNF76-205ENST00000469195 1373 ntTSL 519■□□□□ 0.632e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PHGDH-232ENST00000641947 1774 nt18.93■□□□□ 0.622e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.622e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PHGDH-226ENST00000641756 2132 nt18.76■□□□□ 0.592e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.552e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PHGDH-213ENST00000641272 758 nt18.51■□□□□ 0.552e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.515e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.494e-8■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.492e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PHGDH-211ENST00000641213 2053 nt17.85■□□□□ 0.452e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.452e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PHGDH-229ENST00000641891 2175 nt17.67■□□□□ 0.422e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PHGDH-216ENST00000641375 2196 nt17.67■□□□□ 0.422e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.422e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.392e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.385e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 SEPT5-205ENST00000412544 1108 ntTSL 517.16■□□□□ 0.342e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.322e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 SORD-204ENST00000558789 1553 ntTSL 217.04■□□□□ 0.322e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 MLXIP-211ENST00000542417 513 ntTSL 216.76■□□□□ 0.272e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 MIIP-205ENST00000478749 779 ntTSL 216.73■□□□□ 0.272e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.244e-8■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.222e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.22e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 MNT-207ENST00000575374 936 ntTSL 316.16■□□□□ 0.182e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 TOR2A-206ENST00000472723 3496 ntTSL 216.1■□□□□ 0.172e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PNKP-223ENST00000629179 811 ntTSL 415.73■□□□□ 0.112e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.052e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PFKP-205ENST00000413079 496 ntTSL 315.37■□□□□ 0.052e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 MLXIP-202ENST00000366272 1682 ntTSL 315.3■□□□□ 0.042e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.032e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 USF2-206ENST00000594264 2742 ntTSL 215.09■□□□□ 0.012e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 TNFRSF1B-203ENST00000492361 3583 ntTSL 1 (best)15.08■□□□□ 02e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.024e-8■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 SCARB1-207ENST00000541661 476 ntTSL 514.63□□□□□ -0.074e-11■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 ZNF76-206ENST00000479226 891 ntTSL 214.56□□□□□ -0.082e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PHGDH-203ENST00000462324 767 ntTSL 514.55□□□□□ -0.082e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PTBP1-214ENST00000589575 749 ntTSL 314.51□□□□□ -0.094e-8■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PHGDH-220ENST00000641570 1036 nt14.25□□□□□ -0.132e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PHGDH-218ENST00000641491 986 nt14.25□□□□□ -0.132e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PTBP1-216ENST00000590887 642 ntTSL 314.19□□□□□ -0.144e-8■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.142e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.142e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.152e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PHGDH-233ENST00000642021 2794 nt13.96□□□□□ -0.172e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.232e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 MLXIP-210ENST00000541750 2835 ntTSL 513.55□□□□□ -0.242e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 SORD-205ENST00000559230 1502 ntTSL 1 (best)13.44□□□□□ -0.262e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.332e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 AC008537.1-201ENST00000601627 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.374e-8■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 YWHAH-206ENST00000479649 662 ntTSL 312.41□□□□□ -0.424e-8■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PHGDH-201ENST00000369407 3180 ntTSL 211.93□□□□□ -0.52e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 CDC42SE1-206ENST00000492796 1174 ntTSL 211.85□□□□□ -0.514e-8■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 EGLN2-214ENST00000597746 459 ntTSL 511.78□□□□□ -0.524e-8■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 CSNK1A1-208ENST00000523203 775 ntTSL 511.39□□□□□ -0.594e-8■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 GMPR-203ENST00000543191 675 ntTSL 211.18□□□□□ -0.622e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PHGDH-222ENST00000641587 566 nt11.05□□□□□ -0.642e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 RPL27-201ENST00000253788 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.672e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 CSNK1A1-201ENST00000261798 6067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.694e-8■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PHGDH-212ENST00000641247 710 nt10.74□□□□□ -0.692e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PHGDH-215ENST00000641371 725 nt10.59□□□□□ -0.712e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 CSNK1A1-206ENST00000515748 620 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.754e-8■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 CDC42SE1-207ENST00000540998 3181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.784e-8■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 SORD-201ENST00000267814 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.82e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 ZNF76-201ENST00000229405 4651 ntTSL 210.03□□□□□ -0.82e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 CDC42SE1-202ENST00000439374 3498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.844e-8■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PHGDH-206ENST00000493622 742 ntTSL 59.57□□□□□ -0.882e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 CDC42SE1-204ENST00000483763 2379 ntTSL 1 (best)9.37□□□□□ -0.914e-8■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 RPL27-204ENST00000588830 318 ntTSL 28.83□□□□□ -12e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 RPL27-205ENST00000589037 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.042e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 RPL14-207ENST00000465325 788 ntTSL 38.11□□□□□ -1.112e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 CDC42SE1-201ENST00000357235 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.124e-8■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.22e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 GMPR-204ENST00000544145 750 ntTSL 37.5□□□□□ -1.212e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PCMTD1-203ENST00000519559 1204 ntTSL 27.44□□□□□ -1.222e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 PCMTD1-202ENST00000519554 814 ntTSL 37.36□□□□□ -1.232e-6■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.018e-7■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 HSPB1-203ENST00000447574 1455 ntTSL 1 (best)22.31■■□□□ 1.165e-7■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.625e-7■■■□□ 14.6
PCBP1Q15365 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.152e-7■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 ATG4B-217ENST00000475693 2237 ntTSL 219.51■□□□□ 0.712e-7■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 ATG4B-201ENST00000344376 1566 ntTSL 517.87■□□□□ 0.452e-7■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 ATG4B-225ENST00000494465 2365 ntTSL 517.62■□□□□ 0.412e-7■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.012e-7■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.012e-7■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 ATG4B-220ENST00000482507 2414 ntTSL 1 (best)15.07■□□□□ 02e-7■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 CTSB-229ENST00000533572 975 ntTSL 318.94■□□□□ 0.624e-8■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.063e-26■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 ERP29-201ENST00000261735 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.43e-26■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 ERP29-205ENST00000553161 916 ntTSL 1 (best)12.35□□□□□ -0.433e-26■■□□□ 14.5
PCBP1Q15365 ERP29-204ENST00000552052 284 ntTSL 311.75□□□□□ -0.533e-26■■□□□ 14.5
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