RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405546.7

ATG4B-206, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 3,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-206ENST00000405546 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.07■■■□□ 2.4
ATG4B-206ENST00000405546 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.5■■□□□ 1.83
ATG4B-206ENST00000405546 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.19■■□□□ 1.78
ATG4B-206ENST00000405546 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
ATG4B-206ENST00000405546 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
ATG4B-206ENST00000405546 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.16■■□□□ 1.62
ATG4B-206ENST00000405546 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
ATG4B-206ENST00000405546 HRCP23327 699 aa24.96■■□□□ 1.59
ATG4B-206ENST00000405546 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.93■■□□□ 1.58
ATG4B-206ENST00000405546 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4B-206ENST00000405546 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.58■■□□□ 1.53
ATG4B-206ENST00000405546 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.49■■□□□ 1.51
ATG4B-206ENST00000405546 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.34■■□□□ 1.49
ATG4B-206ENST00000405546 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.3■■□□□ 1.48
ATG4B-206ENST00000405546 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
ATG4B-206ENST00000405546 ABCC9O60706 1549 aa24.19■■□□□ 1.46
ATG4B-206ENST00000405546 SCRIBQ14160 1630 aa24.18■■□□□ 1.46
ATG4B-206ENST00000405546 TRIM41Q8WV44 630 aa24.13■■□□□ 1.45
ATG4B-206ENST00000405546 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
ATG4B-206ENST00000405546 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
ATG4B-206ENST00000405546 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
ATG4B-206ENST00000405546 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
ATG4B-206ENST00000405546 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.7■■□□□ 1.38
ATG4B-206ENST00000405546 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.62■■□□□ 1.37
ATG4B-206ENST00000405546 NACADO15069 1562 aa23.52■■□□□ 1.36
ATG4B-206ENST00000405546 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.5■■□□□ 1.35
ATG4B-206ENST00000405546 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ATG4B-206ENST00000405546 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
ATG4B-206ENST00000405546 WIZO95785 1651 aa23.33■■□□□ 1.32
ATG4B-206ENST00000405546 NEUROD1Q13562 356 aa23.23■■□□□ 1.31
ATG4B-206ENST00000405546 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
ATG4B-206ENST00000405546 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
ATG4B-206ENST00000405546 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.15■■□□□ 1.3
ATG4B-206ENST00000405546 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
ATG4B-206ENST00000405546 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
ATG4B-206ENST00000405546 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
ATG4B-206ENST00000405546 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
ATG4B-206ENST00000405546 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
ATG4B-206ENST00000405546 ABCC8Q09428 1581 aa22.98■■□□□ 1.27
ATG4B-206ENST00000405546 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.96■■□□□ 1.27
ATG4B-206ENST00000405546 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ATG4B-206ENST00000405546 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.89■■□□□ 1.26
ATG4B-206ENST00000405546 SOGA1O94964 1423 aa22.86■■□□□ 1.25
ATG4B-206ENST00000405546 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
ATG4B-206ENST00000405546 SMARCA4P51532 1647 aa22.83■■□□□ 1.24
ATG4B-206ENST00000405546 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-206ENST00000405546 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
ATG4B-206ENST00000405546 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.72■■□□□ 1.23
ATG4B-206ENST00000405546 SMARCA2P51531 1590 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG4B-206ENST00000405546 CEP162Q5TB80 1403 aa22.7■■□□□ 1.23
ATG4B-206ENST00000405546 APLP2Q06481 763 aa22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-206ENST00000405546 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-206ENST00000405546 MYT1Q01538 1121 aa22.64■■□□□ 1.21
ATG4B-206ENST00000405546 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
ATG4B-206ENST00000405546 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.61■■□□□ 1.21
ATG4B-206ENST00000405546 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-206ENST00000405546 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
ATG4B-206ENST00000405546 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-206ENST00000405546 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
ATG4B-206ENST00000405546 EEA1Q15075 1411 aa22.45■■□□□ 1.18
ATG4B-206ENST00000405546 GOLGA3Q08378 1498 aa22.44■■□□□ 1.18
ATG4B-206ENST00000405546 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-206ENST00000405546 CLIP1P30622 1438 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-206ENST00000405546 MIER1Q8N108 512 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-206ENST00000405546 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-206ENST00000405546 SYNJ1O43426 1573 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-206ENST00000405546 ITGAEP38570 1179 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-206ENST00000405546 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-206ENST00000405546 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-206ENST00000405546 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4B-206ENST00000405546 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-206ENST00000405546 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-206ENST00000405546 P3H3Q8IVL6 736 aa22.01■■□□□ 1.11
ATG4B-206ENST00000405546 KIF21BO75037 1637 aa21.96■■□□□ 1.11
ATG4B-206ENST00000405546 KIF27Q86VH2 1401 aa21.94■■□□□ 1.1
ATG4B-206ENST00000405546 BCANQ96GW7 911 aa21.91■■□□□ 1.1
ATG4B-206ENST00000405546 NCAPD3P42695 1498 aa21.88■■□□□ 1.09
ATG4B-206ENST00000405546 TOP2BQ02880 1626 aa21.88■■□□□ 1.09
ATG4B-206ENST00000405546 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
ATG4B-206ENST00000405546 BCL11AQ9H165 835 aa21.83■■□□□ 1.09
ATG4B-206ENST00000405546 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
ATG4B-206ENST00000405546 CUX1P39880 1505 aa21.82■■□□□ 1.08
ATG4B-206ENST00000405546 CUX2O14529 1486 aa21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-206ENST00000405546 PRXQ9BXM0 1461 aa21.79■■□□□ 1.08
ATG4B-206ENST00000405546 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.77■■□□□ 1.08
ATG4B-206ENST00000405546 ARAP1Q96P48 1450 aa21.76■■□□□ 1.07
ATG4B-206ENST00000405546 CFTRP13569 1480 aa21.74■■□□□ 1.07
ATG4B-206ENST00000405546 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.72■■□□□ 1.07
ATG4B-206ENST00000405546 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.7■■□□□ 1.06
ATG4B-206ENST00000405546 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.7■■□□□ 1.06
ATG4B-206ENST00000405546 HMGXB3Q12766 1538 aa21.69■■□□□ 1.06
ATG4B-206ENST00000405546 IGF1RP08069 1367 aa21.69■■□□□ 1.06
ATG4B-206ENST00000405546 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
ATG4B-206ENST00000405546 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.65■■□□□ 1.06
ATG4B-206ENST00000405546 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.65■■□□□ 1.06
ATG4B-206ENST00000405546 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.64■■□□□ 1.05
ATG4B-206ENST00000405546 KCNH8Q96L42 1107 aa21.63■■□□□ 1.05
ATG4B-206ENST00000405546 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.61■■□□□ 1.05
ATG4B-206ENST00000405546 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.1 ms