RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.68■■■■■ 4.26
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.32■■■■□ 3.41
ATG4B-217ENST00000475693 ABCC9O60706 1549 aa35.07■■■■□ 3.21
ATG4B-217ENST00000475693 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.93■■■■□ 3.18
ATG4B-217ENST00000475693 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
ATG4B-217ENST00000475693 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.27■■■■□ 3.08
ATG4B-217ENST00000475693 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.09■■■■□ 3.05
ATG4B-217ENST00000475693 NACADO15069 1562 aa33.99■■■■□ 3.03
ATG4B-217ENST00000475693 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.96■■■■□ 3.03
ATG4B-217ENST00000475693 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.82■■■■□ 3
ATG4B-217ENST00000475693 SCRIBQ14160 1630 aa33.65■■■□□ 2.98
ATG4B-217ENST00000475693 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.22■■■□□ 2.91
ATG4B-217ENST00000475693 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.14■■■□□ 2.9
ATG4B-217ENST00000475693 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.93■■■□□ 2.86
ATG4B-217ENST00000475693 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.6■■■□□ 2.81
ATG4B-217ENST00000475693 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
ATG4B-217ENST00000475693 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.3■■■□□ 2.76
ATG4B-217ENST00000475693 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
ATG4B-217ENST00000475693 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
ATG4B-217ENST00000475693 SMARCA4P51532 1647 aa32.11■■■□□ 2.73
ATG4B-217ENST00000475693 WIZO95785 1651 aa32.01■■■□□ 2.72
ATG4B-217ENST00000475693 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.7
ATG4B-217ENST00000475693 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.73■■■□□ 2.67
ATG4B-217ENST00000475693 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.62■■■□□ 2.65
ATG4B-217ENST00000475693 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.61■■■□□ 2.65
ATG4B-217ENST00000475693 SMARCA2P51531 1590 aa31.57■■■□□ 2.64
ATG4B-217ENST00000475693 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
ATG4B-217ENST00000475693 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
ATG4B-217ENST00000475693 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.46■■■□□ 2.63
ATG4B-217ENST00000475693 NCAPD3P42695 1498 aa31.45■■■□□ 2.62
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.33■■■□□ 2.61
ATG4B-217ENST00000475693 HMGXB3Q12766 1538 aa31.29■■■□□ 2.6
ATG4B-217ENST00000475693 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.88■■■□□ 2.53
ATG4B-217ENST00000475693 NESP48681 1621 aa30.7■■■□□ 2.51
ATG4B-217ENST00000475693 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.69■■■□□ 2.5
ATG4B-217ENST00000475693 CFTRP13569 1480 aa30.67■■■□□ 2.5
ATG4B-217ENST00000475693 ABCC8Q09428 1581 aa30.63■■■□□ 2.49
ATG4B-217ENST00000475693 TRIM41Q8WV44 630 aa30.54■■■□□ 2.48
ATG4B-217ENST00000475693 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.38■■■□□ 2.45
ATG4B-217ENST00000475693 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.36■■■□□ 2.45
ATG4B-217ENST00000475693 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.35■■■□□ 2.45
ATG4B-217ENST00000475693 PRDM2Q13029 1718 aa30.33■■■□□ 2.45
ATG4B-217ENST00000475693 SYNJ1O43426 1573 aa30.27■■■□□ 2.44
ATG4B-217ENST00000475693 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.23■■■□□ 2.43
ATG4B-217ENST00000475693 CUX1P39880 1505 aa30.19■■■□□ 2.42
ATG4B-217ENST00000475693 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.18■■■□□ 2.42
ATG4B-217ENST00000475693 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
ATG4B-217ENST00000475693 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.16■■■□□ 2.42
ATG4B-217ENST00000475693 TOP2BQ02880 1626 aa30.07■■■□□ 2.4
ATG4B-217ENST00000475693 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
ATG4B-217ENST00000475693 ERCC6Q03468 1493 aa30.02■■■□□ 2.4
ATG4B-217ENST00000475693 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30■■■□□ 2.39
ATG4B-217ENST00000475693 SOGA1O94964 1423 aa29.99■■■□□ 2.39
ATG4B-217ENST00000475693 TOPBP1Q92547 1522 aa29.98■■■□□ 2.39
ATG4B-217ENST00000475693 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.95■■■□□ 2.39
ATG4B-217ENST00000475693 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.92■■■□□ 2.38
ATG4B-217ENST00000475693 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.92■■■□□ 2.38
ATG4B-217ENST00000475693 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.91■■■□□ 2.38
ATG4B-217ENST00000475693 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.87■■■□□ 2.37
ATG4B-217ENST00000475693 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.87■■■□□ 2.37
ATG4B-217ENST00000475693 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.84■■■□□ 2.37
ATG4B-217ENST00000475693 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
ATG4B-217ENST00000475693 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
ATG4B-217ENST00000475693 WDR62O43379 1518 aa29.69■■■□□ 2.34
ATG4B-217ENST00000475693 CUX2O14529 1486 aa29.67■■■□□ 2.34
ATG4B-217ENST00000475693 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.66■■■□□ 2.34
ATG4B-217ENST00000475693 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
ATG4B-217ENST00000475693 KIF27Q86VH2 1401 aa29.58■■■□□ 2.33
ATG4B-217ENST00000475693 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.56■■■□□ 2.32
ATG4B-217ENST00000475693 EEA1Q15075 1411 aa29.53■■■□□ 2.32
ATG4B-217ENST00000475693 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
ATG4B-217ENST00000475693 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.47■■■□□ 2.318e-11■■■■□ 21.1
ATG4B-217ENST00000475693 IGF1RP08069 1367 aa29.45■■■□□ 2.31
ATG4B-217ENST00000475693 WDR97A6NE52 1622 aa29.45■■■□□ 2.3
ATG4B-217ENST00000475693 IFT140Q96RY7 1462 aa29.42■■■□□ 2.3
ATG4B-217ENST00000475693 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.37■■■□□ 2.29
ATG4B-217ENST00000475693 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.34■■■□□ 2.29
ATG4B-217ENST00000475693 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
ATG4B-217ENST00000475693 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.33■■■□□ 2.29
ATG4B-217ENST00000475693 PRXQ9BXM0 1461 aa29.29■■■□□ 2.28
ATG4B-217ENST00000475693 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.28■■■□□ 2.28
ATG4B-217ENST00000475693 GOLGA3Q08378 1498 aa29.23■■■□□ 2.27
ATG4B-217ENST00000475693 KIF21BO75037 1637 aa29.22■■■□□ 2.27
ATG4B-217ENST00000475693 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
ATG4B-217ENST00000475693 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
ATG4B-217ENST00000475693 PBRM1Q86U86 1689 aa29.16■■■□□ 2.26
ATG4B-217ENST00000475693 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.15■■■□□ 2.26
ATG4B-217ENST00000475693 GRIN2BQ13224 1484 aa29.15■■■□□ 2.26
ATG4B-217ENST00000475693 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.09■■■□□ 2.25
ATG4B-217ENST00000475693 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.09■■■□□ 2.25
ATG4B-217ENST00000475693 CUL7Q14999 1698 aa29.05■■■□□ 2.24
ATG4B-217ENST00000475693 FBLN2P98095 1184 aa29.04■■■□□ 2.24
ATG4B-217ENST00000475693 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.99■■■□□ 2.23
ATG4B-217ENST00000475693 ADAMTS12P58397 1594 aa28.99■■■□□ 2.23
ATG4B-217ENST00000475693 CEP162Q5TB80 1403 aa28.97■■■□□ 2.23
ATG4B-217ENST00000475693 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
ATG4B-217ENST00000475693 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
ATG4B-217ENST00000475693 SYNJ2O15056 1496 aa28.84■■■□□ 2.21
ATG4B-217ENST00000475693 CLIP1P30622 1438 aa28.83■■■□□ 2.21
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