Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWS0

PHF6, PHD finger protein 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF6Q8IWS0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.79e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.619e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.599e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 BTG3-204ENST00000464058 531 ntTSL 218.48■□□□□ 0.559e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 UBE2J2-218ENST00000502382 530 ntTSL 418.29■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 BTG3-203ENST00000457956 511 ntTSL 318.06■□□□□ 0.489e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 UBE2J2-215ENST00000477894 767 ntTSL 517.85■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.389e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.359e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.359e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.349e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 GSE1-213ENST00000568080 289 ntTSL 517.05■□□□□ 0.329e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 EEF1D-232ENST00000530445 1217 ntTSL 217■□□□□ 0.319e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.239e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 E4F1-209ENST00000569796 5931 ntTSL 216.12■□□□□ 0.179e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.089e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.049e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 EEF1D-234ENST00000530616 749 ntTSL 315.26■□□□□ 0.039e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.049e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 PHF19-204ENST00000436309 558 ntTSL 414.02□□□□□ -0.179e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.289e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.429e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 MKNK2-209ENST00000589509 352 ntTSL 512.04□□□□□ -0.489e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 MKNK2-213ENST00000591601 3582 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.599e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 EEF1D-219ENST00000527741 3718 ntTSL 211.16□□□□□ -0.629e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 CNNM4-204ENST00000496186 748 ntTSL 39.48□□□□□ -0.899e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 PHF19-214ENST00000616568 4159 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.919e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 40
PHF6Q8IWS0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.41■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 40
PHF6Q8IWS0 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 40
PHF6Q8IWS0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 40
PHF6Q8IWS0 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.383e-8■■■■■ 39.9
PHF6Q8IWS0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.292e-6■■■■■ 39.7
PHF6Q8IWS0 SPPL2B-213ENST00000621568 1017 ntTSL 519.64■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 39.7
PHF6Q8IWS0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 39.7
PHF6Q8IWS0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 39.7
PHF6Q8IWS0 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 39.7
PHF6Q8IWS0 CBFA2T3-210ENST00000569464 1327 ntTSL 1 (best)15.46■□□□□ 0.076e-7■■■■■ 39.7
PHF6Q8IWS0 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.256e-7■■■■■ 39.7
PHF6Q8IWS0 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.031e-7■■■■■ 39.5
PHF6Q8IWS0 PUM1-202ENST00000373741 4242 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.661e-41■■■■■ 39.4
PHF6Q8IWS0 PUM1-208ENST00000471894 812 ntTSL 310.58□□□□□ -0.721e-41■■■■■ 39.4
PHF6Q8IWS0 PUM1-210ENST00000490546 707 ntTSL 410.49□□□□□ -0.731e-41■■■■■ 39.4
PHF6Q8IWS0 PUM1-201ENST00000257075 5360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.771e-41■■■■■ 39.4
PHF6Q8IWS0 PUM1-223ENST00000532678 793 ntTSL 49.33□□□□□ -0.921e-41■■■■■ 39.4
PHF6Q8IWS0 PUM1-203ENST00000373742 3515 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.061e-41■■■■■ 39.4
PHF6Q8IWS0 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.121e-41■■■■■ 39.4
PHF6Q8IWS0 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.21e-41■■■■■ 39.4
PHF6Q8IWS0 PUM1-214ENST00000525843 4528 ntTSL 57.2□□□□□ -1.261e-41■■■■■ 39.4
PHF6Q8IWS0 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.271e-41■■■■■ 39.4
PHF6Q8IWS0 PUM1-211ENST00000498419 3068 ntTSL 56.44□□□□□ -1.381e-41■■■■■ 39.4
PHF6Q8IWS0 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.411e-41■■■■■ 39.4
PHF6Q8IWS0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -02e-6■■■■■ 39.4
PHF6Q8IWS0 RXRA-203ENST00000484822 5215 ntTSL 214.34□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 39.4
PHF6Q8IWS0 SLC19A1-204ENST00000427839 648 ntTSL 319.87■□□□□ 0.773e-7■■■■■ 39.2
PHF6Q8IWS0 SLC19A1-205ENST00000443742 777 ntTSL 318.44■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 39.2
PHF6Q8IWS0 SPPL2B-206ENST00000593243 551 ntTSL 417.39■□□□□ 0.375e-7■■■■■ 39.2
PHF6Q8IWS0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.162e-7■■■■■ 39
PHF6Q8IWS0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.032e-7■■■■■ 39
PHF6Q8IWS0 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 39
PHF6Q8IWS0 CTBP1-205ENST00000504092 920 ntTSL 522.33■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 38.9
PHF6Q8IWS0 CTBP1-207ENST00000505826 657 ntTSL 518.83■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 38.9
PHF6Q8IWS0 CTBP1-216ENST00000514669 809 ntTSL 318.17■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 38.9
PHF6Q8IWS0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.983e-6■■■■■ 38.9
PHF6Q8IWS0 SDF4-207ENST00000494748 3516 ntTSL 214.62□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 38.8
PHF6Q8IWS0 SLC19A1-203ENST00000417954 3572 ntTSL 1 (best)14.3□□□□□ -0.129e-8■■■■■ 38.6
PHF6Q8IWS0 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC16.5■□□□□ 0.234e-6■■■■■ 38.6
PHF6Q8IWS0 HPCAL1-205ENST00000423674 586 ntTSL 425.92■■□□□ 1.741e-6■■■■■ 38.5
PHF6Q8IWS0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.131e-6■■■■■ 38.5
PHF6Q8IWS0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 38.5
PHF6Q8IWS0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 38.5
PHF6Q8IWS0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 38.5
PHF6Q8IWS0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 38.5
PHF6Q8IWS0 HPCAL1-203ENST00000419810 4781 ntTSL 1 (best)12.78□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 38.5
PHF6Q8IWS0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.82e-6■■■■■ 38.3
PHF6Q8IWS0 TNK2-216ENST00000468819 876 ntTSL 1 (best)21.5■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 38.3
PHF6Q8IWS0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.931e-7■■■■■ 38.3
PHF6Q8IWS0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 38.3
PHF6Q8IWS0 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.26e-12■■■■■ 38.3
PHF6Q8IWS0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.312e-10■■■■■ 38.3
PHF6Q8IWS0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.692e-10■■■■■ 38.3
PHF6Q8IWS0 PDCD6-203ENST00000505526 1484 ntTSL 1 (best)18.75■□□□□ 0.592e-10■■■■■ 38.3
PHF6Q8IWS0 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.392e-10■■■■■ 38.3
PHF6Q8IWS0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.332e-10■■■■■ 38.3
PHF6Q8IWS0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.212e-10■■■■■ 38.3
PHF6Q8IWS0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.182e-10■■■■■ 38.3
PHF6Q8IWS0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.082e-10■■■■■ 38.3
PHF6Q8IWS0 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.032e-10■■■■■ 38.3
PHF6Q8IWS0 PDCD6-204ENST00000506909 458 ntTSL 315.16■□□□□ 0.022e-10■■■■■ 38.3
PHF6Q8IWS0 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.032e-10■■■■■ 38.3
PHF6Q8IWS0 PDCD6-210ENST00000513582 3500 ntTSL 211.15□□□□□ -0.622e-10■■■■■ 38.3
PHF6Q8IWS0 PDCD6-209ENST00000512466 3763 ntTSL 210.15□□□□□ -0.782e-10■■■■■ 38.3
PHF6Q8IWS0 PDCD6-208ENST00000511482 878 ntTSL 510.03□□□□□ -0.82e-10■■■■■ 38.3
PHF6Q8IWS0 PDCD6-205ENST00000507473 486 ntTSL 37.37□□□□□ -1.232e-10■■■■■ 38.3
PHF6Q8IWS0 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 38.2
PHF6Q8IWS0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.725e-7■■■■■ 38
PHF6Q8IWS0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.565e-7■■■■■ 38
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