RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423674.5

HPCAL1-205, Transcript of hippocalcin like 1, humanhuman

TSL 4

Gene HPCAL1, Length 586 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1-205ENST00000423674 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.39■■■■■ 6.62
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HPCAL1-205ENST00000423674 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.65■■■■■ 5.22
HPCAL1-205ENST00000423674 NACADO15069 1562 aa47.48■■■■■ 5.19
HPCAL1-205ENST00000423674 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.23■■■■■ 5.15
HPCAL1-205ENST00000423674 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.08■■■■■ 5.13
HPCAL1-205ENST00000423674 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.89■■■■■ 5.1
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HPCAL1-205ENST00000423674 SCRIBQ14160 1630 aa45.87■■■■■ 4.93
HPCAL1-205ENST00000423674 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.75■■■■■ 4.91
HPCAL1-205ENST00000423674 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.03■■■■■ 4.8
HPCAL1-205ENST00000423674 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.96■■■■■ 4.79
HPCAL1-205ENST00000423674 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.74■■■■■ 4.75
HPCAL1-205ENST00000423674 SMARCA4P51532 1647 aa43.86■■■■■ 4.61
HPCAL1-205ENST00000423674 NCAPD3P42695 1498 aa43.82■■■■■ 4.6
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HPCAL1-205ENST00000423674 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.75■■■■■ 4.59
HPCAL1-205ENST00000423674 SMARCA2P51531 1590 aa43.69■■■■■ 4.58
HPCAL1-205ENST00000423674 HMGXB3Q12766 1538 aa43.57■■■■■ 4.56
HPCAL1-205ENST00000423674 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.47■■■■■ 4.55
HPCAL1-205ENST00000423674 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.43■■■■■ 4.54
HPCAL1-205ENST00000423674 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.36■■■■■ 4.53
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HPCAL1-205ENST00000423674 ERCC6Q03468 1493 aa42.9■■■■■ 4.46
HPCAL1-205ENST00000423674 NESP48681 1621 aa42.86■■■■■ 4.45
HPCAL1-205ENST00000423674 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.77■■■■■ 4.44
HPCAL1-205ENST00000423674 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.74■■■■■ 4.43
HPCAL1-205ENST00000423674 CUX2O14529 1486 aa42.67■■■■■ 4.42
HPCAL1-205ENST00000423674 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.5■■■■■ 4.39
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HPCAL1-205ENST00000423674 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
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HPCAL1-205ENST00000423674 CFTRP13569 1480 aa42.16■■■■■ 4.34
HPCAL1-205ENST00000423674 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.05■■■■■ 4.32
HPCAL1-205ENST00000423674 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.01■■■■■ 4.32
HPCAL1-205ENST00000423674 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.01■■■■■ 4.32
HPCAL1-205ENST00000423674 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.96■■■■■ 4.31
HPCAL1-205ENST00000423674 WDR62O43379 1518 aa41.94■■■■■ 4.3
HPCAL1-205ENST00000423674 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.9■■■■■ 4.3
HPCAL1-205ENST00000423674 PRDM2Q13029 1718 aa41.79■■■■■ 4.28
HPCAL1-205ENST00000423674 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
HPCAL1-205ENST00000423674 TOPBP1Q92547 1522 aa41.28■■■■■ 4.2
HPCAL1-205ENST00000423674 ABCC8Q09428 1581 aa41.28■■■■■ 4.2
HPCAL1-205ENST00000423674 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
HPCAL1-205ENST00000423674 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.2■■■■■ 4.19
HPCAL1-205ENST00000423674 IFT140Q96RY7 1462 aa41.15■■■■■ 4.18
HPCAL1-205ENST00000423674 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.98■■■■■ 4.15
HPCAL1-205ENST00000423674 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
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HPCAL1-205ENST00000423674 OSCARQ8IYS5 282 aa40.78■■■■■ 4.12
HPCAL1-205ENST00000423674 CUX1P39880 1505 aa40.77■■■■■ 4.12
HPCAL1-205ENST00000423674 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.72■■■■■ 4.11
HPCAL1-205ENST00000423674 SOGA1O94964 1423 aa40.71■■■■■ 4.11
HPCAL1-205ENST00000423674 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.7■■■■■ 4.11
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HPCAL1-205ENST00000423674 WDR97A6NE52 1622 aa40.57■■■■■ 4.09
HPCAL1-205ENST00000423674 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
HPCAL1-205ENST00000423674 CHD1O14646 1710 aa40.38■■■■■ 4.05
HPCAL1-205ENST00000423674 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.34■■■■■ 4.05
HPCAL1-205ENST00000423674 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.32■■■■■ 4.05
HPCAL1-205ENST00000423674 TOP2BQ02880 1626 aa40.32■■■■■ 4.05
HPCAL1-205ENST00000423674 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.32■■■■■ 4.05
HPCAL1-205ENST00000423674 GRIN2BQ13224 1484 aa40.32■■■■■ 4.04
HPCAL1-205ENST00000423674 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.31■■■■■ 4.04
HPCAL1-205ENST00000423674 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
HPCAL1-205ENST00000423674 FBLN2P98095 1184 aa40.27■■■■■ 4.04
HPCAL1-205ENST00000423674 SYNJ1O43426 1573 aa40.26■■■■■ 4.04
HPCAL1-205ENST00000423674 TRIM41Q8WV44 630 aa40.25■■■■■ 4.03
HPCAL1-205ENST00000423674 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.24■■■■■ 4.03
HPCAL1-205ENST00000423674 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.2■■■■■ 4.03
HPCAL1-205ENST00000423674 PBRM1Q86U86 1689 aa40.18■■■■■ 4.02
HPCAL1-205ENST00000423674 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.17■■■■■ 4.02
HPCAL1-205ENST00000423674 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.17■■■■■ 4.02
HPCAL1-205ENST00000423674 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.17■■■■■ 4.02
HPCAL1-205ENST00000423674 ARHGEF11O15085 1522 aa40.12■■■■■ 4.01
HPCAL1-205ENST00000423674 SYNJ2O15056 1496 aa40.12■■■■■ 4.01
HPCAL1-205ENST00000423674 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
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HPCAL1-205ENST00000423674 ADAMTS12P58397 1594 aa39.85■■■■□ 3.97
HPCAL1-205ENST00000423674 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.85■■■■□ 3.97
HPCAL1-205ENST00000423674 GRIN2AQ12879 1464 aa39.79■■■■□ 3.96
HPCAL1-205ENST00000423674 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.77■■■■□ 3.96
HPCAL1-205ENST00000423674 ARAP1Q96P48 1450 aa39.76■■■■□ 3.96
HPCAL1-205ENST00000423674 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.74■■■■□ 3.95
HPCAL1-205ENST00000423674 NUP160Q12769 1436 aa39.65■■■■□ 3.94
HPCAL1-205ENST00000423674 CEP170Q5SW79 1584 aa39.6■■■■□ 3.93
HPCAL1-205ENST00000423674 KIF27Q86VH2 1401 aa39.55■■■■□ 3.92
HPCAL1-205ENST00000423674 IGF1RP08069 1367 aa39.44■■■■□ 3.9
HPCAL1-205ENST00000423674 SHROOM2Q13796 1616 aa39.4■■■■□ 3.9
HPCAL1-205ENST00000423674 CUL7Q14999 1698 aa39.38■■■■□ 3.9
HPCAL1-205ENST00000423674 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.33■■■■□ 3.89
HPCAL1-205ENST00000423674 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.28■■■■□ 3.88
HPCAL1-205ENST00000423674 JPH4Q96JJ6 628 aa39.21■■■■□ 3.87
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